RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 CRYGAP11844 174 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 MUC4Q99102 2169 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 J3QL48 77 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 RHOHQ15669 191 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 TIMM17AQ99595 171 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 CEP295Q9C0D2 2601 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 HILS1P60008 231 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 DPH3Q96FX2 82 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 BUB3O43684 328 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP5G1P05496 136 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 CHD6Q8TD26 2715 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A0J9YXV3 536 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 NDPQ00604 133 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 F5H697 171 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 GNRH2O43555 120 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP1R17O96001 155 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 LITAFQ99732 161 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF5Q99942 180 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 JPT2Q9H910 190 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 PCNX1Q96RV3 2341 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 LY6G5BQ8NDX9 201 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 C19orf84I3L1E1 186 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 DEFB1P60022 68 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 C5orf38Q86SI9 138 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 DCANP1Q8TF63 244 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 Q9H8V8 135 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A0J9YX75 114 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 LY6LH3BQJ8 138 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 ATOX1O00244 68 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
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RABGEF1-203ENST00000439720 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.21□□□□□ -1.42
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RABGEF1-203ENST00000439720 X6R8D5 127 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-203ENST00000439720 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.21□□□□□ -1.42
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RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM258P61165 79 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-203ENST00000439720 Q5XG85 94 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-203ENST00000439720 C11orf71Q6IPW1 123 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM61Q8N0U2 210 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.21□□□□□ -1.42
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RABGEF1-203ENST00000439720 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.2□□□□□ -1.42
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RABGEF1-203ENST00000439720 E7EQL1 145 aa6.19□□□□□ -1.42
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RABGEF1-203ENST00000439720 C10orf105Q8TEF2 133 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-203ENST00000439720 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-203ENST00000439720 LYNX1G3V0Z9 82 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-203ENST00000439720 NXPH4O95158 308 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-203ENST00000439720 LYNX1P0DP58 116 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-203ENST00000439720 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A087WVE0 104 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-203ENST00000439720 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-203ENST00000439720 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-203ENST00000439720 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-203ENST00000439720 NPBQ8NG41 125 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-203ENST00000439720 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-203ENST00000439720 F6UB75 175 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-203ENST00000439720 ODF3BA8MYP8 253 aa6.17□□□□□ -1.42
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