RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422847.1

LINC00857-201, long intergenic non-protein coding RNA 857, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LINC00857, Length 2,161 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00857-201ENST00000422847 RPL39P62891 51 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 GAGE4Q13068 117 aa8.44□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa8.44□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 DUX5Q96PT3 197 aa8.44□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 TRAV4A0A0B4J268 109 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 GNRH2O43555 120 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 ACANP16112 2415 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 CREBBPQ92793 2442 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.42□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa8.42□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 FAM223BA6NKX1 122 aa8.42□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 TTC32Q5I0X7 151 aa8.42□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 FAM223AQ8IWN6 122 aa8.42□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 WFDC11Q8NEX6 87 aa8.42□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 FAM30AQ9NZY2 134 aa8.42□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.42□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.42□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 RHOHQ15669 191 aa8.42□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa8.42□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 Q96MF0 132 aa8.42□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 WNK2Q9Y3S1 2297 aa8.42□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 TLN2Q9Y4G6 2542 aa8.42□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 M0R2P5 195 aa8.41□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 LGALS9O00182 355 aa8.41□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 CRLF1O75462 422 aa8.41□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa8.41□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.41□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 C10orf105Q8TEF2 133 aa8.41□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 ODF3Q96PU9 254 aa8.41□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 ABCA2Q9BZC7 2435 aa8.41□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 CSPG4Q6UVK1 2322 aa8.41□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.41□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 H3BMM0 161 aa8.41□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 UBE2E1P51965 193 aa8.41□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 Q1RN00 199 aa8.41□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 UBE2WQ96B02 151 aa8.41□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa8.4□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 NDUFA4O00483 81 aa8.4□□□□□ -1.06
LINC00857-201ENST00000422847 KLLNB2CW77 178 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 CCDC179H3BU77 68 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 MDFICQ9P1T7 246 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 H7C2G1 150 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 ELANEP08246 267 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 C5orf56Q8N8D9 126 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 MAST4O15021 2626 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 CR1P17927 2039 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 TRAV41A0A0B4J266 112 aa8.38□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa8.38□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa8.38□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 H3BT86 120 aa8.38□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 DEFB1P60022 68 aa8.38□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 MUC4Q99102 2169 aa8.38□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 A0A0J9YXY3 114 aa8.38□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 F5H697 171 aa8.38□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 TRIAP1O43715 76 aa8.38□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa8.38□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 JPT2Q9H910 190 aa8.38□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 F6UB75 175 aa8.37□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 SAA4P35542 130 aa8.37□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 DSCR9P59020 149 aa8.37□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 C2orf82Q6UX34 121 aa8.37□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.37□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 HIVEP1P15822 2718 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 LMO4P61968 165 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 DEFB121Q5J5C9 76 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 C9orf85Q96MD7 179 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 LITAFQ99732 161 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 ICOSQ9Y6W8 199 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 M0QY20 66 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 SPANXCQ9NY87 97 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 MOB4Q9Y3A3 225 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 CUBNO60494 3623 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 SONP18583 2426 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 A0A096LNT2 108 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 H7C423 109 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8.34□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 A0A0J9YXV3 536 aa8.34□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 BRI3O95415 125 aa8.34□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 TRBV12-3P01733 135 aa8.34□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 COX6CP09669 75 aa8.34□□□□□ -1.07
LINC00857-201ENST00000422847 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.34□□□□□ -1.08
LINC00857-201ENST00000422847 NPFFO15130 113 aa8.34□□□□□ -1.08
LINC00857-201ENST00000422847 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa8.34□□□□□ -1.08
LINC00857-201ENST00000422847 ZNF56Q15929 161 aa8.34□□□□□ -1.08
LINC00857-201ENST00000422847 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa8.33□□□□□ -1.08
LINC00857-201ENST00000422847 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.33□□□□□ -1.08
LINC00857-201ENST00000422847 H3BUA1 57 aa8.33□□□□□ -1.08
LINC00857-201ENST00000422847 I3L3M4 83 aa8.33□□□□□ -1.08
LINC00857-201ENST00000422847 FAM74A4Q5TZK3 123 aa8.33□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms