RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFAND6Q6FIF0 208 aa2.61□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 Q8N2B8 174 aa2.61□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa2.61□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa2.61□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 ASIPP42127 132 aa2.61□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 SAMD13Q5VXD3 122 aa2.61□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 PLAC8L1A1L4L8 177 aa2.61□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 RHOHQ15669 191 aa2.61□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM61Q8N0U2 210 aa2.61□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD29Q8N6D5 301 aa2.61□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM141Q96I45 108 aa2.61□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHV3-11P01762 117 aa2.61□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 Q6ZSV7 163 aa2.6□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 PPDPFLQ8WWR9 84 aa2.6□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A087WWL8 130 aa2.6□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAV4A0A0B4J268 109 aa2.6□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa2.6□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM89A2RUT3 159 aa2.6□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 H3BUX3 64 aa2.6□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIAP1O43715 76 aa2.6□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 UFC1Q9Y3C8 167 aa2.6□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa2.6□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 A8MZ25 164 aa2.6□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 PRM2P04554 102 aa2.6□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 KLRB1Q12918 225 aa2.6□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 RAXQ9Y2V3 346 aa2.6□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa2.6□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 SVIPQ8NHG7 77 aa2.6□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 VCYO14598 125 aa2.6□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP1R17O96001 155 aa2.6□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHV3-53P01767 116 aa2.6□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 PROK1P58294 105 aa2.6□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 PRO1854Q9UHT4 67 aa2.6□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa2.6□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa2.6□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 HIST1H4GQ99525 98 aa2.6□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 LINC00467Q9BRT7 94 aa2.6□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 PRORYQ9H606 182 aa2.6□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa2.6□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa2.6□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa2.6□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 H3BMM0 161 aa2.6□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa2.59□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 LINC00694P0DN24 101 aa2.59□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 LINC00242Q5T6M2 205 aa2.59□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 VSIG2Q96IQ7 327 aa2.59□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 C19orf73Q9NVV2 129 aa2.59□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa2.59□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 LINC01620Q4KN68 170 aa2.59□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 TIMM21Q9BVV7 248 aa2.59□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 LST1O00453 97 aa2.59□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 C16orf92Q96LL3 132 aa2.59□□□□□ -1.99
PGGT1B-203ENST00000419445 ODF3L2Q3SX64 289 aa2.59□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 MUSTN1Q8IVN3 82 aa2.59□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 SFTA2Q6UW10 78 aa2.59□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP2.59□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF702PQ9H963 129 aa2.59□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa2.59□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa2.59□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa2.58□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 APOMO95445 188 aa2.58□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa2.58□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa2.58□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa2.58□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 H7C423 109 aa2.58□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 TIMM17BO60830 172 aa2.58□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 Q6Q795 121 aa2.58□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 SPANXDQ9BXN6 97 aa2.58□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 SPANXCQ9NY87 97 aa2.58□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 SMIM1B2RUZ4 78 aa2.58□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHV4-59P01825 116 aa2.58□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF688P0C7X2 276 aa2.58□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 COL7A1Q02388 2944 aa2.58□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa2.58□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa2.58□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 LEPROTO15243 131 aa2.58□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 UCNP55089 124 aa2.58□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 ARL17AQ8IVW1 177 aa2.58□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 ERG28Q9UKR5 140 aa2.58□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa2.58□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa2.58□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa2.58□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 C1orf158Q8N1D5 194 aa2.58□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa2.57□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 TIRAPP58753 221 aa2.57□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 FOXC1Q12948 553 aa2.57□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 OR10J6PQ8NGY7 276 aa2.57□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAV2A0A0B4J234 112 aa2.57□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC25A20O43772 301 aa2.57□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 MSMBP08118 114 aa2.57□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM218AQ96MZ4 157 aa2.57□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa2.57□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 J3KRW8 73 aa2.57□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 MIAQ16674 131 aa2.57□□□□□ -2
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