RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316786.1

C9orf106-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 106 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf106, Length 3,145 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf106-201ENST00000316786 LYZL1Q6UWQ5 148 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf106-201ENST00000316786 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf106-201ENST00000316786 K7EMT4 169 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf106-201ENST00000316786 PRR9Q5T870 116 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf106-201ENST00000316786 Q8N1Y9 231 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf106-201ENST00000316786 C11orf21Q9P2W6 132 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf106-201ENST00000316786 HERVK_113P61574 105 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf106-201ENST00000316786 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf106-201ENST00000316786 IL17DQ8TAD2 202 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf106-201ENST00000316786 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
C9orf106-201ENST00000316786 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf106-201ENST00000316786 DCANP1Q8TF63 244 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf106-201ENST00000316786 TMEM158Q8WZ71 300 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf106-201ENST00000316786 TMEM86BQ8N661 226 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf106-201ENST00000316786 HAX1O00165 279 aa9.89□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 TRACP01848 142 aa9.89□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 C1orf195Q5TG92 126 aa9.89□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 LINC00526Q96FQ7 95 aa9.89□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 DPH3Q96FX2 82 aa9.89□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa9.89□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa9.89□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 M0R2P5 195 aa9.89□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 Q5XG85 94 aa9.89□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa9.89□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 HIVEP1P15822 2718 aa9.88□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 AMN1Q8IY45 258 aa9.88□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 MSRB1Q9NZV6 116 aa9.88□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 FN1P02751 2386 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 NPYP01303 97 aa9.87□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 HBDP02042 147 aa9.87□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 RIGQ13278 110 aa9.87□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa9.87□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 A0A096LNJ9 63 aa9.87□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 A0A0U1RRA0 63 aa9.87□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 HLA-DRB4P13762 266 aa9.87□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 TAL2Q16559 108 aa9.87□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa9.87□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 IGKCP01834 107 aa9.87□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 PSMG4Q5JS54 123 aa9.87□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa9.87□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 OVOL1O14753 267 aa9.86□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 OXTP01178 125 aa9.86□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 TWIST1Q15672 202 aa9.86□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 HHLA3Q9XRX5 114 aa9.86□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 IGKV3-20P01619 116 aa9.86□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 CRYGDP07320 174 aa9.86□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 PFN2P35080 140 aa9.86□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 LINC01559Q495D7 138 aa9.86□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 LINC01619G3V211 115 aa9.85□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 LGALS9O00182 355 aa9.85□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 SPRY2O43597 315 aa9.85□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 H7C2G1 150 aa9.85□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 C4orf3Q8WVX3 66 aa9.85□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 RETNQ9HD89 108 aa9.85□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 LY6G6DO95868 133 aa9.85□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 CD28P10747 220 aa9.85□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 LINC01006Q8NI28 216 aa9.84□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa9.84□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 FAM19A4Q96LR4 140 aa9.84□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 C2orf48Q96LS8 159 aa9.84□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 JMJD1CQ15652 2540 aa9.84□□□□□ -0.83
C9orf106-201ENST00000316786 C2CD3Q4AC94 2353 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf106-201ENST00000316786 K7EQG2 157 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf106-201ENST00000316786 SCGB1D4Q6XE38 83 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf106-201ENST00000316786 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
C9orf106-201ENST00000316786 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa9.82□□□□□ -0.84
C9orf106-201ENST00000316786 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa9.82□□□□□ -0.84
C9orf106-201ENST00000316786 SMKR1H3BMG3 65 aa9.82□□□□□ -0.84
C9orf106-201ENST00000316786 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
C9orf106-201ENST00000316786 LENEPQ9Y5L5 61 aa9.82□□□□□ -0.84
C9orf106-201ENST00000316786 NOTCH3Q9UM47 2321 aa9.82□□□□□ -0.84
C9orf106-201ENST00000316786 D6R8Y8 96 aa9.81□□□□□ -0.84
C9orf106-201ENST00000316786 DPM2O94777 84 aa9.81□□□□□ -0.84
C9orf106-201ENST00000316786 COX7CP15954 63 aa9.81□□□□□ -0.84
C9orf106-201ENST00000316786 UBE2D3P61077 147 aa9.81□□□□□ -0.84
C9orf106-201ENST00000316786 UBE2D2P62837 147 aa9.81□□□□□ -0.84
C9orf106-201ENST00000316786 J3QQQ9 107 aa9.81□□□□□ -0.84
C9orf106-201ENST00000316786 TMEM61Q8N0U2 210 aa9.81□□□□□ -0.84
C9orf106-201ENST00000316786 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa9.8□□□□□ -0.84
C9orf106-201ENST00000316786 GAS8-AS1O95177 125 aa9.8□□□□□ -0.84
C9orf106-201ENST00000316786 HILS1P60008 231 aa9.8□□□□□ -0.84
C9orf106-201ENST00000316786 FAM104BQ5XKR9 115 aa9.8□□□□□ -0.84
C9orf106-201ENST00000316786 SBSPONQ8IVN8 264 aa9.8□□□□□ -0.84
C9orf106-201ENST00000316786 TRAV21A0A0B4J279 112 aa9.8□□□□□ -0.84
C9orf106-201ENST00000316786 INAFM1C9JVW0 142 aa9.8□□□□□ -0.84
C9orf106-201ENST00000316786 H3BMM0 161 aa9.8□□□□□ -0.84
C9orf106-201ENST00000316786 GNRH2O43555 120 aa9.8□□□□□ -0.84
C9orf106-201ENST00000316786 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
C9orf106-201ENST00000316786 UBE2WQ96B02 151 aa9.8□□□□□ -0.84
C9orf106-201ENST00000316786 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa9.79□□□□□ -0.84
C9orf106-201ENST00000316786 CNFNQ9BYD5 112 aa9.79□□□□□ -0.84
C9orf106-201ENST00000316786 CYSTM1Q9H1C7 97 aa9.79□□□□□ -0.84
C9orf106-201ENST00000316786 SPANXCQ9NY87 97 aa9.79□□□□□ -0.84
C9orf106-201ENST00000316786 A0A0J9YX75 114 aa9.79□□□□□ -0.84
C9orf106-201ENST00000316786 BRK1Q8WUW1 75 aa9.79□□□□□ -0.84
C9orf106-201ENST00000316786 PEMTQ9UBM1 199 aa9.79□□□□□ -0.84
C9orf106-201ENST00000316786 SPINK13Q1W4C9 94 aa9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms