RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299598.11

PKD1L2-201, Transcript of polycystin 1 like 2 (gene/pseudogene), humanhuman

TSL 5

Gene PKD1L2, Length 5,818 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L2-201ENST00000299598 MDFICQ9P1T7 246 aa8.6□□□□□ -1.03
PKD1L2-201ENST00000299598 IGLV2-14P01704 120 aa8.6□□□□□ -1.03
PKD1L2-201ENST00000299598 MED12LQ86YW9 2145 aa8.6□□□□□ -1.03
PKD1L2-201ENST00000299598 SCXQ7RTU7 201 aa8.59□□□□□ -1.03
PKD1L2-201ENST00000299598 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.59□□□□□ -1.03
PKD1L2-201ENST00000299598 TOMM6Q96B49 74 aa8.59□□□□□ -1.03
PKD1L2-201ENST00000299598 PRR14LQ5THK1 2151 aa8.59□□□□□ -1.03
PKD1L2-201ENST00000299598 CDSNQ15517 529 aa8.59□□□□□ -1.03
PKD1L2-201ENST00000299598 P0DMU3 169 aa8.59□□□□□ -1.03
PKD1L2-201ENST00000299598 FAM231AP0DMU4 169 aa8.59□□□□□ -1.03
PKD1L2-201ENST00000299598 FAM231CP0DMU5 169 aa8.59□□□□□ -1.03
PKD1L2-201ENST00000299598 NFE4Q86UQ8 179 aa8.59□□□□□ -1.03
PKD1L2-201ENST00000299598 MLST8Q9BVC4 326 aa8.59□□□□□ -1.03
PKD1L2-201ENST00000299598 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa8.58□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 LYPD6BQ8NI32 183 aa8.58□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 CCDC140Q96MF4 163 aa8.58□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 CHD8Q9HCK8 2581 aa8.58□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 A0A0J9YX75 114 aa8.58□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.57□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 SPANXCQ9NY87 97 aa8.57□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa8.57□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 DSCAML1Q8TD84 2053 aa8.57□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 E9PLD3 99 aa8.56□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 HILS1P60008 231 aa8.56□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 A0A0U1RQV1 116 aa8.56□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa8.56□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 UPK3BQ9BT76 320 aa8.56□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 DEFB114Q30KQ6 69 aa8.55□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 SDIM1Q6ZPB5 146 aa8.55□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 A0A0J9YWU9 116 aa8.55□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 Q6ZUT4 128 aa8.55□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 LINC01006Q8NI28 216 aa8.55□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 SLPIP03973 132 aa8.55□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 KRTAP10-9P60411 292 aa8.55□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 PRO0255Q9UI72 69 aa8.55□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 TCL1BO95988 128 aa8.55□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa8.55□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa8.55□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 COX7BP24311 80 aa8.55□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 EBI3Q14213 229 aa8.55□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 ODF1Q14990 250 aa8.55□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.54□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 CASC2Q6XLA1 102 aa8.54□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 G3V4G9 280 aa8.54□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 SORL1Q92673 2214 aa8.53□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 C20orf197Q8N268 126 aa8.53□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 LY6LH3BQJ8 138 aa8.53□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 BPY2O14599 106 aa8.53□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 TP73-AS1Q9UF72 201 aa8.53□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8.53□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 SMR3AQ99954 134 aa8.53□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 CEP295Q9C0D2 2601 aa8.53□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 ALPK3Q96L96 1907 aa8.52□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.52□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 MBD6Q96DN6 1003 aa8.52□□□□□ -1.04
PKD1L2-201ENST00000299598 PTPRSQ13332 1948 aa8.52□□□□□ -1.05
PKD1L2-201ENST00000299598 C10orf99Q6UWK7 81 aa8.52□□□□□ -1.05
PKD1L2-201ENST00000299598 HIGD1BQ9P298 99 aa8.52□□□□□ -1.05
PKD1L2-201ENST00000299598 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa8.52□□□□□ -1.05
PKD1L2-201ENST00000299598 B9D2Q9BPU9 175 aa8.52□□□□□ -1.05
PKD1L2-201ENST00000299598 ZNF702PQ9H963 129 aa8.52□□□□□ -1.05
PKD1L2-201ENST00000299598 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa8.52□□□□□ -1.05
PKD1L2-201ENST00000299598 JMJD1CQ15652 2540 aa8.51□□□□□ -1.05
PKD1L2-201ENST00000299598 WFDC10BQ8IUB3 73 aa8.51□□□□□ -1.05
PKD1L2-201ENST00000299598 SMIM9A6NGZ8 99 aa8.51□□□□□ -1.05
PKD1L2-201ENST00000299598 SPATA12Q7Z6I5 190 aa8.51□□□□□ -1.05
PKD1L2-201ENST00000299598 LINC00482Q8N8I6 264 aa8.51□□□□□ -1.05
PKD1L2-201ENST00000299598 MT-ATP8P03928 68 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L2-201ENST00000299598 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L2-201ENST00000299598 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L2-201ENST00000299598 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L2-201ENST00000299598 H3BT86 120 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L2-201ENST00000299598 K7EQG2 157 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L2-201ENST00000299598 MED14OSP0DP75 135 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L2-201ENST00000299598 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PKD1L2-201ENST00000299598 FAM222AQ5U5X8 452 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L2-201ENST00000299598 CXCL5P42830 114 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L2-201ENST00000299598 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PKD1L2-201ENST00000299598 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PKD1L2-201ENST00000299598 ENHOQ6UWT2 76 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L2-201ENST00000299598 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L2-201ENST00000299598 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L2-201ENST00000299598 CTRLP40313 264 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L2-201ENST00000299598 Q6ZTI0 123 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L2-201ENST00000299598 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L2-201ENST00000299598 DCANP1Q8TF63 244 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L2-201ENST00000299598 MYO9AB2RTY4 2548 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L2-201ENST00000299598 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L2-201ENST00000299598 USP17L23D6RBM5 183 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L2-201ENST00000299598 LYRM9A8MSI8 78 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L2-201ENST00000299598 H3BQ85 93 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.5 ms