RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000109698.8

Sh3bp1-204, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,923 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Chac2Q9CQG1 178 aa15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fbxo24Q9D417 589 aa15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nubp1Q9R060 320 aa15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pard6aQ9Z101 346 aa15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Abca12E9Q876 2595 aa15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr196E9PYP4 309 aa15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm17455G3UW87 128 aa15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 GzmfP08883 248 aa15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fli1P26323 452 aa15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Psg22Q810J1 475 aa15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fam78bQ8BQN5 261 aa15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Smco4Q9JIS3 59 aa15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gata2O09100 480 aa15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rhox4fQ2MDF8 205 aa15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gpr183Q3U6B2 357 aa15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 HaaoQ78JT3 286 aa15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 EtdQ80SW5 59 aa15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mrps26Q80ZS3 200 aa15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr958Q8VEY3 312 aa15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tmem189Q99LQ7 271 aa15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 ManfQ9CXI5 179 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1700008P02RikQ9DAJ8 175 aa15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pf4Q9Z126 105 aa15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ighv1-69A0A0G2JFS5 117 aa15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Csn2P10598 231 aa15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr1535Q7TQU0 326 aa15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 TecrQ9CY27 308 aa15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr972Q9EQA2 314 aa15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rhox4bQ9JI43 205 aa15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Arpc1aQ9R0Q6 370 aa15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pfdn5Q9WU28 154 aa15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm28845A0A087WR76 214 aa15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Thap8E9Q695 213 aa15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mtco2P00405 227 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Defa-rs1P17533 116 aa15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 PpoxP51175 477 aa15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm9733Q1AN91 178 aa15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gal3st4Q3V1B8 480 aa15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm17334Q8C6U3 126 aa15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 TdhQ8K3F7 373 aa15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr1323Q8VF35 309 aa15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rpp25lQ99JH1 163 aa15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Spink12Q9D256 87 aa15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zfp109A0A0U1RPC5 652 aa15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Slc45a2P58355 530 aa15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm4763Q8CFJ5 196 aa15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ms4a6dQ99N07 247 aa15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mad2l1bpQ9DCX1 276 aa15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pus1Q9WU56 423 aa15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Scgb1b29D2XZ31 93 aa15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Scgb1b20E9PWZ2 93 aa15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nkx2-8O70584 235 aa15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 B430305J03RikQ8BQQ8 176 aa15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cmtm2bQ9DAC0 210 aa15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 PigpQ9JHG1 132 aa15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gpa33Q9JKA5 319 aa15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tep1P97499 2629 aa15.83■□□□□ 0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ighv1-39A0A075B5V5 117 aa15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ighv8-2A0A0A6YW58 119 aa15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 P01915 264 aa15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rab19P35294 217 aa15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rhox4cQ2MDG1 205 aa15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tmem167bQ80X45 74 aa15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Necap2Q9D1J1 266 aa15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rhox4aQ9D3I8 205 aa15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Akirin2B1AXD8 201 aa15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 SrstQ06666 185 aa15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr305Q7TS02 319 aa15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Prickle3Q80VL3 624 aa15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr1412Q8VET3 321 aa15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr702Q920Z2 318 aa15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mrpl27Q99N92 148 aa15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm9195A0A140LHT4 2805 aa15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Sptbn1Q62261 2363 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm37388A0A0A6YY46 143 aa15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 ColqO35348 457 aa15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Igfbp1P47876 272 aa15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 NdpP48744 131 aa15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 AdtrpQ8C138 230 aa15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cldn16Q925N4 235 aa15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Crybb3Q9JJU9 211 aa15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Trav6n-5A0A075B621 112 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Trav6-5A0A075B6B5 112 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 H2al1jA2BFR3 109 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm20422E9PUR3 255 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Klhdc1Q80YG3 406 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cox19Q8K0C8 92 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 RpeQ8VEE0 228 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gng10Q9CXP8 68 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tagln2Q9WVA4 199 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Trav13n-4A0A0G2JG01 110 aa15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm6904E9PVF1 202 aa15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Plp1P60202 277 aa15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ube2g2P60605 165 aa15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Q497N7 227 aa15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Q9D9C7 252 aa15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zfyve26Q5DU37 2529 aa15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Trav23A0A0G2JG17 115 aa15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm5239D3YYZ2 122 aa15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rnf212bD3Z423 297 aa15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 95.3 ms