Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ2

Scgb1b20, ABPA20, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb1b20E9PWZ2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Scgb1b20E9PWZ2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Scgb1b20E9PWZ2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,32■■□□□ 1,8
Scgb1b20E9PWZ2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Scgb1b20E9PWZ2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,01■■□□□ 1,75
Scgb1b20E9PWZ2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Scgb1b20E9PWZ2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Scgb1b20E9PWZ2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Scgb1b20E9PWZ2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Scgb1b20E9PWZ2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Scgb1b20E9PWZ2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,61■■□□□ 1,53
Scgb1b20E9PWZ2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Scgb1b20E9PWZ2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Scgb1b20E9PWZ2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,51
Scgb1b20E9PWZ2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Scgb1b20E9PWZ2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Scgb1b20E9PWZ2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Scgb1b20E9PWZ2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Scgb1b20E9PWZ2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Scgb1b20E9PWZ2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Scgb1b20E9PWZ2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Scgb1b20E9PWZ2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,94■■□□□ 1,42
Scgb1b20E9PWZ2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Scgb1b20E9PWZ2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Scgb1b20E9PWZ2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,61■■□□□ 1,37
Scgb1b20E9PWZ2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Scgb1b20E9PWZ2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Scgb1b20E9PWZ2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,47■■□□□ 1,35
Scgb1b20E9PWZ2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,37■■□□□ 1,33
Scgb1b20E9PWZ2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Scgb1b20E9PWZ2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Scgb1b20E9PWZ2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Scgb1b20E9PWZ2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23,26■■□□□ 1,31
Scgb1b20E9PWZ2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,21■■□□□ 1,31
Scgb1b20E9PWZ2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Scgb1b20E9PWZ2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Scgb1b20E9PWZ2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23,07■■□□□ 1,28
Scgb1b20E9PWZ2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,98■■□□□ 1,27
Scgb1b20E9PWZ2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Scgb1b20E9PWZ2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC22,92■■□□□ 1,26
Scgb1b20E9PWZ2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,91■■□□□ 1,26
Scgb1b20E9PWZ2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22,85■■□□□ 1,25
Scgb1b20E9PWZ2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Scgb1b20E9PWZ2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Scgb1b20E9PWZ2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Scgb1b20E9PWZ2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Scgb1b20E9PWZ2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Scgb1b20E9PWZ2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
Scgb1b20E9PWZ2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
Scgb1b20E9PWZ2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Scgb1b20E9PWZ2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22,63■■□□□ 1,21
Scgb1b20E9PWZ2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22,62■■□□□ 1,21
Scgb1b20E9PWZ2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
Scgb1b20E9PWZ2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22,57■■□□□ 1,2
Scgb1b20E9PWZ2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22,56■■□□□ 1,2
Scgb1b20E9PWZ2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Scgb1b20E9PWZ2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
Scgb1b20E9PWZ2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22,51■■□□□ 1,19
Scgb1b20E9PWZ2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Scgb1b20E9PWZ2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
Scgb1b20E9PWZ2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
Scgb1b20E9PWZ2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,39■■□□□ 1,17
Scgb1b20E9PWZ2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
Scgb1b20E9PWZ2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22,36■■□□□ 1,17
Scgb1b20E9PWZ2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Scgb1b20E9PWZ2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Scgb1b20E9PWZ2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Scgb1b20E9PWZ2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Scgb1b20E9PWZ2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,14
Scgb1b20E9PWZ2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22,12■■□□□ 1,13
Scgb1b20E9PWZ2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Scgb1b20E9PWZ2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Scgb1b20E9PWZ2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22,08■■□□□ 1,13
Scgb1b20E9PWZ2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,12
Scgb1b20E9PWZ2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Scgb1b20E9PWZ2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Scgb1b20E9PWZ2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22,02■■□□□ 1,12
Scgb1b20E9PWZ2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,01■■□□□ 1,11
Scgb1b20E9PWZ2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Scgb1b20E9PWZ2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Scgb1b20E9PWZ2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Scgb1b20E9PWZ2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Scgb1b20E9PWZ2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Scgb1b20E9PWZ2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Scgb1b20E9PWZ2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Scgb1b20E9PWZ2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Scgb1b20E9PWZ2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21,92■■□□□ 1,1
Scgb1b20E9PWZ2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Scgb1b20E9PWZ2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21,89■■□□□ 1,09
Scgb1b20E9PWZ2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Scgb1b20E9PWZ2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Scgb1b20E9PWZ2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Scgb1b20E9PWZ2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Scgb1b20E9PWZ2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Scgb1b20E9PWZ2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Scgb1b20E9PWZ2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Scgb1b20E9PWZ2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Scgb1b20E9PWZ2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Scgb1b20E9PWZ2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21,74■■□□□ 1,07
Scgb1b20E9PWZ2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,3 ms