RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trav6-3Q5R1E6 112 aa10.55□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr983Q8VG90 315 aa10.55□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wrap73Q9JM98 462 aa10.55□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fbln5Q9WVH9 448 aa10.55□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ighv1-34A0A075B5V2 117 aa10.55□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 BC053393A0A0B4J1F6 192 aa10.55□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P01649 108 aa10.55□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PgpQ8CHP8 321 aa10.55□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pilrb2Q2YFS1 225 aa10.55□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Piezo2Q8CD54 2822 aa10.55□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm6034E9Q101 117 aa10.55□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm19684G3UZ45 117 aa10.55□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp11P10751 647 aa10.55□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1178Q7TR20 323 aa10.55□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ifi27l2bQ8VC49 283 aa10.55□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 1700025B11RikA0A087WNZ6 93 aa10.54□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Igkv19-93A0A0G2JFZ3 115 aa10.54□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TcapO70548 167 aa10.54□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 F5O88783 2183 aa10.54□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ighv1-22A0A075B5U7 117 aa10.54□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Scgb1b10A0A087WPW0 93 aa10.54□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Snrpd3P62320 126 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RhogP84096 191 aa10.54□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klf11Q8K1S5 502 aa10.54□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sp5Q9JHX2 398 aa10.54□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hdgfl3Q9JMG7 202 aa10.54□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ighv3-4A0A0A6YXF1 117 aa10.54□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ighv1-36A0A0A6YXT2 117 aa10.54□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ly6lH3BJG9 140 aa10.54□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cks1brtQ3UNC9 96 aa10.54□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Oosp2Q4FZG8 168 aa10.54□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trdv2-2Q5R1A4 116 aa10.54□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q8BTC1 67 aa10.54□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mcrip2Q9CQB2 160 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Urm1Q9D2P4 101 aa10.54□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem183Q9JJB9 375 aa10.54□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc25a20Q9Z2Z6 301 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 E430018J23RikE9PZQ8 461 aa10.54□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem88bQ3TYP4 173 aa10.54□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znf787Q8BIF9 381 aa10.54□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Scnm1Q8K136 229 aa10.54□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TncQ80YX1 2110 aa10.53□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr482Q8VG03 323 aa10.53□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cst10Q9JM84 148 aa10.53□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm5157A0A087WRH8 301 aa10.53□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ighv6-4A0A0A6YX19 119 aa10.53□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rnf5O35445 180 aa10.53□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fxyd6Q9D164 94 aa10.53□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pard6aQ9Z101 346 aa10.53□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm9964E9Q9S5 144 aa10.53□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znf146Q8BQN6 292 aa10.53□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem100Q9CQG9 134 aa10.53□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem50aQ9CXL1 157 aa10.53□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ArtnQ9Z0L2 224 aa10.53□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lrrk2Q5S006 2527 aa10.53□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 BC035044E0CXF8 138 aa10.52□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Scgb2a2J3KMP9 96 aa10.52□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ptbp1P17225 527 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spata46Q4FZF2 204 aa10.52□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1339Q8VGB1 315 aa10.52□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1258Q8VGN6 311 aa10.52□□□□□ -0.72
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm21900J3QP38 180 aa10.52□□□□□ -0.73
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vsig8Q6P3A4 417 aa10.52□□□□□ -0.73
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wdr83osQ6ZWX0 106 aa10.52□□□□□ -0.73
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr968Q8VFN4 314 aa10.52□□□□□ -0.73
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ighv5-12-4A0A0A6YWG4 117 aa10.52□□□□□ -0.73
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Plcxd2B2RXA1 340 aa10.52□□□□□ -0.73
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P01660 111 aa10.52□□□□□ -0.73
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr150Q60895 312 aa10.52□□□□□ -0.73
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Btf3Q64152 204 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm10190Q8BSD7 107 aa10.52□□□□□ -0.73
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Notch3Q61982 2318 aa10.52□□□□□ -0.73
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1192-ps1A0A1L1SRD7 309 aa10.52□□□□□ -0.73
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fhl4Q8CDC8 279 aa10.52□□□□□ -0.73
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spsb4Q8R5B6 273 aa10.51□□□□□ -0.73
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem189Q99LQ7 271 aa10.51□□□□□ -0.73
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmed6Q9CQG0 239 aa10.51□□□□□ -0.73
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1331K7N684 317 aa10.51□□□□□ -0.73
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SnrpcQ62241 159 aa10.51□□□□□ -0.73
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cox19Q8K0C8 92 aa10.51□□□□□ -0.73
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klhdc3Q8VEM9 382 aa10.51□□□□□ -0.73
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gatad1Q920S3 266 aa10.51□□□□□ -0.73
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lmo1Q924W9 156 aa10.51□□□□□ -0.73
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gp2Q9D733 531 aa10.51□□□□□ -0.73
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1369-ps1A0A140T8K7 317 aa10.51□□□□□ -0.73
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm45623A0A1B0GSF6 103 aa10.51□□□□□ -0.73
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Psg22Q810J1 475 aa10.51□□□□□ -0.73
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ighv5-16A0A0B4J1P4 117 aa10.51□□□□□ -0.73
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp27P10077 819 aa10.51□□□□□ -0.73
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rpl13aP19253 203 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cnn1Q08091 297 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm10118Q8C8J5 116 aa10.51□□□□□ -0.73
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm4763Q8CFJ5 196 aa10.51□□□□□ -0.73
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bpifa5Q9CQX3 270 aa10.51□□□□□ -0.73
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem167aQ9CR64 72 aa10.51□□□□□ -0.73
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fancd2osQ9D4K4 178 aa10.51□□□□□ -0.73
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pglyrp3A1A547 347 aa10.5□□□□□ -0.73
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1337A2ACY8 315 aa10.5□□□□□ -0.73
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hoxa6P09092 232 aa10.5□□□□□ -0.73
Pkp1-201ENSMUST00000027667 BsxQ810B3 232 aa10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36 ms