RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563951.1

CCDC33-211, Transcript of coiled-coil domain containing 33, humanhuman

TSL 5

Gene CCDC33, Length 308 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33-211ENST00000563951 SPANXN1Q5VSR9 72 aa5.76□□□□□ -1.49
CCDC33-211ENST00000563951 LYZL1Q6UWQ5 148 aa5.76□□□□□ -1.49
CCDC33-211ENST00000563951 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa5.76□□□□□ -1.49
CCDC33-211ENST00000563951 OR10G8Q8NGN5 311 aa5.76□□□□□ -1.49
CCDC33-211ENST00000563951 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CCDC33-211ENST00000563951 AP1S3Q96PC3 154 aa5.76□□□□□ -1.49
CCDC33-211ENST00000563951 SMIM7Q9BQ49 75 aa5.76□□□□□ -1.49
CCDC33-211ENST00000563951 TPPP3Q9BW30 176 aa5.76□□□□□ -1.49
CCDC33-211ENST00000563951 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CCDC33-211ENST00000563951 GTSF1LQ9H1H1 148 aa5.76□□□□□ -1.49
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CCDC33-211ENST00000563951 SUMO4Q6EEV6 95 aa5.74□□□□□ -1.49
CCDC33-211ENST00000563951 XKRY2A2RUG3 117 aa5.73□□□□□ -1.49
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CCDC33-211ENST00000563951 IGHV3-33P01772 117 aa5.73□□□□□ -1.49
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CCDC33-211ENST00000563951 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa5.73□□□□□ -1.49
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CCDC33-211ENST00000563951 OR10J3Q5JRS4 329 aa5.73□□□□□ -1.49
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CCDC33-211ENST00000563951 V9GYV3 84 aa5.73□□□□□ -1.49
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CCDC33-211ENST00000563951 KRTAP10-2P60368 255 aa5.72□□□□□ -1.49
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CCDC33-211ENST00000563951 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa5.72□□□□□ -1.49
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CCDC33-211ENST00000563951 K7EP13 123 aa5.7□□□□□ -1.5
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CCDC33-211ENST00000563951 TMEM241Q24JQ0 296 aa5.7□□□□□ -1.5
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CCDC33-211ENST00000563951 C10orf126Q8N4M7 172 aa5.7□□□□□ -1.5
CCDC33-211ENST00000563951 TSKUQ8WUA8 353 aa5.7□□□□□ -1.5
CCDC33-211ENST00000563951 SMDT1Q9H4I9 107 aa5.7□□□□□ -1.5
CCDC33-211ENST00000563951 NAT8Q9UHE5 227 aa5.7□□□□□ -1.5
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CCDC33-211ENST00000563951 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa5.69□□□□□ -1.5
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CCDC33-211ENST00000563951 RASL11AQ6T310 242 aa5.69□□□□□ -1.5
CCDC33-211ENST00000563951 SPATA12Q7Z6I5 190 aa5.69□□□□□ -1.5
CCDC33-211ENST00000563951 GATD1Q8NB37 220 aa5.69□□□□□ -1.5
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CCDC33-211ENST00000563951 LAGE3Q14657 143 aa5.68□□□□□ -1.5
CCDC33-211ENST00000563951 MPV17L2Q567V2 206 aa5.68□□□□□ -1.5
CCDC33-211ENST00000563951 NFE4Q86UQ8 179 aa5.68□□□□□ -1.5
CCDC33-211ENST00000563951 NUP35Q8NFH5 326 aa5.68□□□□□ -1.5
CCDC33-211ENST00000563951 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa5.68□□□□□ -1.5
CCDC33-211ENST00000563951 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CCDC33-211ENST00000563951 RNF185Q96GF1 192 aa5.68□□□□□ -1.5
CCDC33-211ENST00000563951 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.68□□□□□ -1.5
CCDC33-211ENST00000563951 A0A1B0GUT8 65 aa5.67□□□□□ -1.5
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