RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM231BA6NCW3 169 aa3.81□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 UBE2L6O14933 153 aa3.81□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 GATCO43716 136 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 PPP1R17O96001 155 aa3.81□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 IGHV3-30P01768 117 aa3.81□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 IGHV3-33P01772 117 aa3.81□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 MGPP08493 103 aa3.81□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa3.81□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa3.81□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 RAB14P61106 215 aa3.81□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 TWIST1Q15672 202 aa3.81□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 CT83Q5H943 113 aa3.81□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 Q8N976 141 aa3.81□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 OR10AG1Q8NH19 301 aa3.81□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 SMIM7Q9BQ49 75 aa3.81□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 CHCHD5Q9BSY4 110 aa3.81□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 JPT2Q9H910 190 aa3.81□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa3.8□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa3.8□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 RAB19A4D1S5 217 aa3.8□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 C19orf71A6NCJ1 209 aa3.8□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF727A8MUV8 499 aa3.8□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 S100A8P05109 93 aa3.8□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 UBE2D3P61077 147 aa3.8□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 SSTP61278 116 aa3.8□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 UBE2D2P62837 147 aa3.8□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 RPL19P84098 196 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 LYZL1Q6UWQ5 148 aa3.8□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM231DQ6ZW35 169 aa3.8□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF575Q86XF7 245 aa3.8□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 Q8N1X5 172 aa3.8□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa3.8□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 NUDT10Q8NFP7 164 aa3.8□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 LYPD6BQ8NI32 183 aa3.8□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 NUDT11Q96G61 164 aa3.8□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 DERL1Q9BUN8 251 aa3.8□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 C1orf43Q9BWL3 253 aa3.8□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 SAMD10Q9BYL1 202 aa3.8□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 GFRA4Q9GZZ7 299 aa3.8□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 Q9HAA7 133 aa3.8□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 NIT2Q9NQR4 276 aa3.8□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A087WTM6 91 aa3.79□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A1B0GW15 77 aa3.79□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 TCAPO15273 167 aa3.79□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 ANGP03950 147 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 IGLC6P0CF74 106 aa3.79□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 LINC00694P0DN24 101 aa3.79□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 NTF3P20783 257 aa3.79□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 COTL1Q14019 142 aa3.79□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 MIAQ16674 131 aa3.79□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM241Q24JQ0 296 aa3.79□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 RASL11AQ6T310 242 aa3.79□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 NIT1Q86X76 327 aa3.79□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa3.79□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 OCC1Q8TAD7 63 aa3.79□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa3.79□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 APOBP04114 4563 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 LRP1BQ9NZR2 4599 aa3.79□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 MYCBP2O75592 4640 aa3.78□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa3.78□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa3.78□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa3.78□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa3.78□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 MUC21A0A140T8X8 626 aa3.78□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A1B0GUT8 65 aa3.78□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 NCR2O95944 276 aa3.78□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 IGLV2-8P01709 118 aa3.78□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 GZMBP10144 247 aa3.78□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 GCSHP23434 173 aa3.78□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 CTRLP40313 264 aa3.78□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 RIGQ13278 110 aa3.78□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa3.78□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 Q6ZSN1 163 aa3.78□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 TSKUQ8WUA8 353 aa3.78□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 UBE2WQ96B02 151 aa3.78□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 PGLYRP4Q96LB8 373 aa3.78□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM243Q9BU79 118 aa3.78□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 CNFNQ9BYD5 112 aa3.78□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 OSTCQ9NRP0 149 aa3.78□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 KLK12Q9UKR0 248 aa3.78□□□□□ -1.8
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A1B0GUV1 79 aa3.77□□□□□ -1.81
CLSTN3-215ENST00000544584 F8W036 122 aa3.77□□□□□ -1.81
CLSTN3-215ENST00000544584 H7C423 109 aa3.77□□□□□ -1.81
CLSTN3-215ENST00000544584 M0QY20 66 aa3.77□□□□□ -1.81
CLSTN3-215ENST00000544584 PPP1R2P9O14990 202 aa3.77□□□□□ -1.81
CLSTN3-215ENST00000544584 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
CLSTN3-215ENST00000544584 IQCJQ1A5X6 159 aa3.77□□□□□ -1.81
CLSTN3-215ENST00000544584 CFAP161Q6P656 301 aa3.77□□□□□ -1.81
CLSTN3-215ENST00000544584 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
CLSTN3-215ENST00000544584 CLRN3Q8NCR9 226 aa3.77□□□□□ -1.81
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM18Q96B42 140 aa3.77□□□□□ -1.81
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM101Q96IK0 257 aa3.77□□□□□ -1.81
CLSTN3-215ENST00000544584 BTF3L4Q96K17 158 aa3.77□□□□□ -1.81
CLSTN3-215ENST00000544584 NAT8Q9UHE5 227 aa3.77□□□□□ -1.81
CLSTN3-215ENST00000544584 NAT8BQ9UHF3 227 aa3.77□□□□□ -1.81
CLSTN3-215ENST00000544584 PKIGQ9Y2B9 76 aa3.77□□□□□ -1.81
CLSTN3-215ENST00000544584 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa3.76□□□□□ -1.81
CLSTN3-215ENST00000544584 HIGD1CA8MV81 97 aa3.76□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms