RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532885.5

RPS6KA4-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A4, human

TSL 3

Gene RPS6KA4, Length 902 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS6KA4-208	ENST00000532885	NTF3	P20783	257 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KA4-208	ENST00000532885	PKD1	P98161	4303 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TWIST1	Q15672	202 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA4-208	ENST00000532885	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA4-208	ENST00000532885	NIT1	Q86X76	327 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CNFN	Q9BYD5	112 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA4-208	ENST00000532885	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA4-208	ENST00000532885	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KA4-208	ENST00000532885	PKHD1	P08F94	4074 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA4-208	ENST00000532885		A0A087WTM6	91 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA4-208	ENST00000532885		A0A087WX48	190 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA4-208	ENST00000532885		A8MWL6	223 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CT83	Q5H943	113 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA4-208	ENST00000532885	LINC01551	Q86U37	167 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA4-208	ENST00000532885		Q8N3U1	123 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA4-208	ENST00000532885	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KA4-208	ENST00000532885		M0QY20	66 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS6KA4-208	ENST00000532885	KRTAP10-2	P60368	255 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TM2D2	Q9BX73	214 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS6KA4-208	ENST00000532885	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS6KA4-208	ENST00000532885	PKIA	P61925	76 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS6KA4-208	ENST00000532885	PEA15	Q15121	130 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ELOB	Q15370	118 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS6KA4-208	ENST00000532885	GTSF1	Q8WW33	167 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS6KA4-208	ENST00000532885	BORCS7	Q96B45	105 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS6KA4-208	ENST00000532885	RASL11A	Q6T310	242 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS6KA4-208	ENST00000532885	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS6KA4-208	ENST00000532885	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TMEM262	E9PQX1	116 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPS6KA4-208	ENST00000532885	RMI2	Q96E14	147 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPS6KA4-208	ENST00000532885	OSTC	Q9NRP0	149 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TSKU	Q8WUA8	353 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPS6KA4-208	ENST00000532885	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPS6KA4-208	ENST00000532885	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPS6KA4-208	ENST00000532885	NIT2	Q9NQR4	276 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPS6KA4-208	ENST00000532885	KLK12	Q9UKR0	248 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPS6KA4-208	ENST00000532885	COX11	Q9Y6N1	276 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FAM231B	A6NCW3	169 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CDK2AP2	O75956	126 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RPS6KA4-208	ENST00000532885	NAT8	Q9UHE5	227 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPS6KA4-208	ENST00000532885	HIGD1C	A8MV81	97 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FRZB	Q92765	325 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ISOC2	Q96AB3	205 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS6KA4-208	ENST00000532885	UBE2W	Q96B02	151 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS6KA4-208	ENST00000532885	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
RPS6KA4-208	ENST00000532885	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RPS6KA4-208	ENST00000532885	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RPS6KA4-208	ENST00000532885	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CRP	P02741	224 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RPS6KA4-208	ENST00000532885		Q0VG73	95 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ADIRF	Q15847	76 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RPS6KA4-208	ENST00000532885	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RPS6KA4-208	ENST00000532885		A0A1B0GUT8	65 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RPS6KA4-208	ENST00000532885		C9JQL5	133 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RPS6KA4-208	ENST00000532885	RAB14	P61106	215 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RPS6KA4-208	ENST00000532885	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
RPS6KA4-208	ENST00000532885	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RPS6KA4-208	ENST00000532885	MPV17L2	Q567V2	206 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RPS6KA4-208	ENST00000532885		V9GYV3	84 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RPS6KA4-208	ENST00000532885	HERC2	O95714	4834 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RPS6KA4-208	ENST00000532885	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		11.05	□□□□□ -0.64
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		11.05	□□□□□ -0.64
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		11.05	□□□□□ -0.64
RPS6KA4-208	ENST00000532885		Q8N814	137 aa		11.05	□□□□□ -0.64
RPS6KA4-208	ENST00000532885	GATD1	Q8NB37	220 aa		11.05	□□□□□ -0.64
RPS6KA4-208	ENST00000532885	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	11.04	□□□□□ -0.64
RPS6KA4-208	ENST00000532885	COTL1	Q14019	142 aa		11.04	□□□□□ -0.64
RPS6KA4-208	ENST00000532885	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		11.03	□□□□□ -0.64
RPS6KA4-208	ENST00000532885	GAGE6	Q13070	117 aa		11.03	□□□□□ -0.64
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CLLU1	Q5K131	121 aa		11.03	□□□□□ -0.64
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ATRAID	Q6UW56	229 aa		11.03	□□□□□ -0.64
RPS6KA4-208	ENST00000532885		Q8N976	141 aa		11.03	□□□□□ -0.64
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TMEM243	Q9BU79	118 aa		11.03	□□□□□ -0.64
RPS6KA4-208	ENST00000532885	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		11.03	□□□□□ -0.64
RPS6KA4-208	ENST00000532885	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		11.03	□□□□□ -0.64
RPS6KA4-208	ENST00000532885	RBX1	P62877	108 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RPS6KA4-208	ENST00000532885	RIG	Q13278	110 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RPS6KA4-208	ENST00000532885	UBE2L6	O14933	153 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPS6KA4-208	ENST00000532885	GCSH	P23434	173 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPS6KA4-208	ENST00000532885	AMT	P48728	403 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPS6KA4-208	ENST00000532885	NUP35	Q8NFH5	326 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPS6KA4-208	ENST00000532885	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65

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