RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523270.1

CNOT8-223, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 8, human

TSL 4

Gene CNOT8, Length 575 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT8-223	ENST00000523270	NTF3	P20783	257 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CNOT8-223	ENST00000523270	TEX261	Q6UWH6	196 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CNOT8-223	ENST00000523270	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CNOT8-223	ENST00000523270	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CNOT8-223	ENST00000523270	NIT1	Q86X76	327 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CNOT8-223	ENST00000523270		C9JQL5	133 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CNOT8-223	ENST00000523270		M0QY20	66 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CNOT8-223	ENST00000523270	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CNOT8-223	ENST00000523270	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CNOT8-223	ENST00000523270	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CNOT8-223	ENST00000523270	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CNOT8-223	ENST00000523270	CNFN	Q9BYD5	112 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CNOT8-223	ENST00000523270	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CNOT8-223	ENST00000523270	LAGE3	Q14657	143 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CNOT8-223	ENST00000523270	LINC01551	Q86U37	167 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CNOT8-223	ENST00000523270	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CNOT8-223	ENST00000523270	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CNOT8-223	ENST00000523270	TRGC1	P0CF51	173 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CNOT8-223	ENST00000523270	WDR73	Q6P4I2	378 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CNOT8-223	ENST00000523270	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CNOT8-223	ENST00000523270	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CNOT8-223	ENST00000523270	ZNF727	A8MUV8	499 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CNOT8-223	ENST00000523270	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CNOT8-223	ENST00000523270	PSCA	O43653	123 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CNOT8-223	ENST00000523270	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
CNOT8-223	ENST00000523270	TWIST1	Q15672	202 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CNOT8-223	ENST00000523270	EREG	O14944	169 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CNOT8-223	ENST00000523270	WFDC2	Q14508	124 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CNOT8-223	ENST00000523270	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CNOT8-223	ENST00000523270	KLK12	Q9UKR0	248 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CNOT8-223	ENST00000523270	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CNOT8-223	ENST00000523270	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270		A8MWL6	223 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270	MPV17L2	Q567V2	206 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270	CT83	Q5H943	113 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270	RASL11A	Q6T310	242 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270		A0A087WX48	190 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270		H7C1H1	209 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270	CDK2AP2	O75956	126 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270	OSTC	Q9NRP0	149 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270	TMEM262	E9PQX1	116 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270	GATD1	Q8NB37	220 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270	ISOC2	Q96AB3	205 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270	TSKU	Q8WUA8	353 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270	UBE2W	Q96B02	151 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270		V9GYV3	84 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270	KRTAP10-1	P60331	282 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270		Q8N976	141 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270	TM2D2	Q9BX73	214 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270	NIT2	Q9NQR4	276 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270	HIGD1C	A8MV81	97 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270	LECT2	O14960	151 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270	GAGE6	Q13070	117 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270	ATRAID	Q6UW56	229 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270		Q8N814	137 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CNOT8-223	ENST00000523270	PEA15	Q15121	130 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CNOT8-223	ENST00000523270	ADIRF	Q15847	76 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CNOT8-223	ENST00000523270	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CNOT8-223	ENST00000523270	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CNOT8-223	ENST00000523270	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CNOT8-223	ENST00000523270	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CNOT8-223	ENST00000523270	ENHO	Q6UWT2	76 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CNOT8-223	ENST00000523270	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CNOT8-223	ENST00000523270	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CNOT8-223	ENST00000523270	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CNOT8-223	ENST00000523270	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CNOT8-223	ENST00000523270	NAT8	Q9UHE5	227 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CNOT8-223	ENST00000523270	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CNOT8-223	ENST00000523270	GAS8-AS1	O95177	125 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CNOT8-223	ENST00000523270	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CNOT8-223	ENST00000523270	RBX1	P62877	108 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CNOT8-223	ENST00000523270	ELOB	Q15370	118 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CNOT8-223	ENST00000523270	BAALC	Q8WXS3	180 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CNOT8-223	ENST00000523270		A0A1B0GUT8	65 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CNOT8-223	ENST00000523270	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CNOT8-223	ENST00000523270	FAM231B	A6NCW3	169 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CNOT8-223	ENST00000523270	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CNOT8-223	ENST00000523270	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CNOT8-223	ENST00000523270	NUP35	Q8NFH5	326 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CNOT8-223	ENST00000523270	RMI2	Q96E14	147 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CNOT8-223	ENST00000523270	BORCS7	Q96B45	105 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CNOT8-223	ENST00000523270	RNF185	Q96GF1	192 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CNOT8-223	ENST00000523270	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CNOT8-223	ENST00000523270	GCSH	P23434	173 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CNOT8-223	ENST00000523270	PKIA	P61925	76 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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