RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 XKRY2A2RUG3 117 aa12.48□□□□□ -0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 LRCOL1A6NCL2 159 aa12.48□□□□□ -0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 CACNG7P62955 275 aa12.48□□□□□ -0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 LAGE3Q14657 143 aa12.48□□□□□ -0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 GTSF1Q8WW33 167 aa12.48□□□□□ -0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 PSCAO43653 123 aa12.47□□□□□ -0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 WFDC2Q14508 124 aa12.47□□□□□ -0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 M0QY20 66 aa12.46□□□□□ -0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 SRP19P09132 144 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 NTF3P20783 257 aa12.46□□□□□ -0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 SMIM7Q9BQ49 75 aa12.46□□□□□ -0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 F2Z2F3 143 aa12.45□□□□□ -0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 EREGO14944 169 aa12.45□□□□□ -0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 CDK2AP2O75956 126 aa12.45□□□□□ -0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa12.45□□□□□ -0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 CNFNQ9BYD5 112 aa12.45□□□□□ -0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa12.45□□□□□ -0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa12.44□□□□□ -0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 MPV17L2Q567V2 206 aa12.44□□□□□ -0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 LINC01551Q86U37 167 aa12.44□□□□□ -0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 KLK12Q9UKR0 248 aa12.44□□□□□ -0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 C9JQL5 133 aa12.43□□□□□ -0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 GATCO43716 136 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 TRGC1P0CF51 173 aa12.43□□□□□ -0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM231DQ6ZW35 169 aa12.43□□□□□ -0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa12.43□□□□□ -0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 DPH3P1Q9H4G8 78 aa12.43□□□□□ -0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa12.43□□□□□ -0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 TWIST1Q15672 202 aa12.42□□□□□ -0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 CDPF1Q6NVV7 123 aa12.42□□□□□ -0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 TEX261Q6UWH6 196 aa12.42□□□□□ -0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa12.41□□□□□ -0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF727A8MUV8 499 aa12.41□□□□□ -0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 LECT2O14960 151 aa12.41□□□□□ -0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP10-1P60331 282 aa12.41□□□□□ -0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa12.41□□□□□ -0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A087WX48 190 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 Q8N814 137 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 PGLYRP4Q96LB8 373 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 WDR73Q6P4I2 378 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 RASL11AQ6T310 242 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 C15orf54Q8N8G6 183 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 Q8N976 141 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 UBE2WQ96B02 151 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 CHCHD5Q9BSY4 110 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 CHCHD7Q9BUK0 85 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM262E9PQX1 116 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 H7C1H1 209 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 CT83Q5H943 113 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 GAGE6Q13070 117 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 GATD1Q8NB37 220 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 TM2D2Q9BX73 214 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 A8MWL6 223 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 ATRAIDQ6UW56 229 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 CLPSL2Q6UWE3 100 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 ENHOQ6UWT2 76 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 BAALCQ8WXS3 180 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAH8Q96JB1 4490 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 HIGD1CA8MV81 97 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 RPL23P62829 140 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 HAMPP81172 84 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 IQCJQ1A5X6 159 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNIP4Q6PIL6 250 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 ISOC2Q96AB3 205 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 V9GYV3 84 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 GAS8-AS1O95177 125 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 ANGP03950 147 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 RBX1P62877 108 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 TSKUQ8WUA8 353 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 NIT2Q9NQR4 276 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 OSTCQ9NRP0 149 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
SH3BP2-218ENST00000511185 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP2-218ENST00000511185 GCSHP23434 173 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP2-218ENST00000511185 ADIRFQ15847 76 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM97Q5BJF2 176 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP2-218ENST00000511185 CRPP02741 224 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP2-218ENST00000511185 XGP55808 180 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP2-218ENST00000511185 ELOBQ15370 118 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP2-218ENST00000511185 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
SH3BP2-218ENST00000511185 RMI2Q96E14 147 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP2-218ENST00000511185 GFRA4Q9GZZ7 299 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP2-218ENST00000511185 NAT8Q9UHE5 227 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM241Q24JQ0 296 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP2-218ENST00000511185 Q8N1X5 172 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM243Q9BU79 118 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP2-218ENST00000511185 FAT1Q14517 4588 aa12.29□□□□□ -0.44
SH3BP2-218ENST00000511185 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa12.29□□□□□ -0.44
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1B0GUT8 65 aa12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 184.1 ms