RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497453.1

UBE2Q1-207, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 5

Gene UBE2Q1, Length 830 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-207ENST00000497453 PKD1P98161 4303 aa12.08□□□□□ -0.48
UBE2Q1-207ENST00000497453 IGHV3-30P01768 117 aa12.07□□□□□ -0.48
UBE2Q1-207ENST00000497453 IGHV3-33P01772 117 aa12.07□□□□□ -0.48
UBE2Q1-207ENST00000497453 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa12.07□□□□□ -0.48
UBE2Q1-207ENST00000497453 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa12.07□□□□□ -0.48
UBE2Q1-207ENST00000497453 SUMO4Q6EEV6 95 aa12.07□□□□□ -0.48
UBE2Q1-207ENST00000497453 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
UBE2Q1-207ENST00000497453 TSKUQ8WUA8 353 aa12.07□□□□□ -0.48
UBE2Q1-207ENST00000497453 M0QY20 66 aa12.06□□□□□ -0.48
UBE2Q1-207ENST00000497453 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
UBE2Q1-207ENST00000497453 ADIRFQ15847 76 aa12.06□□□□□ -0.48
UBE2Q1-207ENST00000497453 C15orf54Q8N8G6 183 aa12.06□□□□□ -0.48
UBE2Q1-207ENST00000497453 V9GYV3 84 aa12.06□□□□□ -0.48
UBE2Q1-207ENST00000497453 DNAH11Q96DT5 4516 aa12.06□□□□□ -0.48
UBE2Q1-207ENST00000497453 NFE4Q86UQ8 179 aa12.05□□□□□ -0.48
UBE2Q1-207ENST00000497453 GFRA4Q9GZZ7 299 aa12.05□□□□□ -0.48
UBE2Q1-207ENST00000497453 H7C1H1 209 aa12.04□□□□□ -0.48
UBE2Q1-207ENST00000497453 IFITM2Q01629 132 aa12.04□□□□□ -0.48
UBE2Q1-207ENST00000497453 Q8N3U1 123 aa12.04□□□□□ -0.48
UBE2Q1-207ENST00000497453 DNAJC30Q96LL9 226 aa12.04□□□□□ -0.48
UBE2Q1-207ENST00000497453 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
UBE2Q1-207ENST00000497453 PKHD1P08F94 4074 aa12.03□□□□□ -0.48
UBE2Q1-207ENST00000497453 FAM231BA6NCW3 169 aa12.03□□□□□ -0.48
UBE2Q1-207ENST00000497453 HIGD1CA8MV81 97 aa12.03□□□□□ -0.48
UBE2Q1-207ENST00000497453 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa12.03□□□□□ -0.48
UBE2Q1-207ENST00000497453 CLLU1Q5K131 121 aa12.03□□□□□ -0.48
UBE2Q1-207ENST00000497453 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
UBE2Q1-207ENST00000497453 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa12.02□□□□□ -0.49
UBE2Q1-207ENST00000497453 RASL11AQ6T310 242 aa12.02□□□□□ -0.49
UBE2Q1-207ENST00000497453 SMIM15Q7Z3B0 74 aa12.02□□□□□ -0.49
UBE2Q1-207ENST00000497453 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
UBE2Q1-207ENST00000497453 NIT1Q86X76 327 aa12.02□□□□□ -0.49
UBE2Q1-207ENST00000497453 BORCS7Q96B45 105 aa12.02□□□□□ -0.49
UBE2Q1-207ENST00000497453 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
UBE2Q1-207ENST00000497453 A0A1B0GUT8 65 aa12□□□□□ -0.49
UBE2Q1-207ENST00000497453 NIT2Q9NQR4 276 aa12□□□□□ -0.49
UBE2Q1-207ENST00000497453 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2Q1-207ENST00000497453 TMEM97Q5BJF2 176 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2Q1-207ENST00000497453 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2Q1-207ENST00000497453 GATD1Q8NB37 220 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2Q1-207ENST00000497453 NUP35Q8NFH5 326 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2Q1-207ENST00000497453 Q9HAA7 133 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2Q1-207ENST00000497453 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2Q1-207ENST00000497453 LAGE3Q14657 143 aa11.98□□□□□ -0.49
UBE2Q1-207ENST00000497453 CHCHD7Q9BUK0 85 aa11.98□□□□□ -0.49
UBE2Q1-207ENST00000497453 NAT8BQ9UHF3 227 aa11.98□□□□□ -0.49
UBE2Q1-207ENST00000497453 A0A087WX48 190 aa11.96□□□□□ -0.49
UBE2Q1-207ENST00000497453 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa11.96□□□□□ -0.49
UBE2Q1-207ENST00000497453 KCNIP4Q6PIL6 250 aa11.96□□□□□ -0.49
UBE2Q1-207ENST00000497453 SPATA12Q7Z6I5 190 aa11.96□□□□□ -0.49
UBE2Q1-207ENST00000497453 FRZBQ92765 325 aa11.96□□□□□ -0.49
UBE2Q1-207ENST00000497453 CHCHD5Q9BSY4 110 aa11.96□□□□□ -0.49
UBE2Q1-207ENST00000497453 TMEM191AQ9H0A3 160 aa11.96□□□□□ -0.49
UBE2Q1-207ENST00000497453 TMEM262E9PQX1 116 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 RIGQ13278 110 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa11.94□□□□□ -0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 A0A087WTM6 91 aa11.94□□□□□ -0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa11.94□□□□□ -0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa11.94□□□□□ -0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 PSCAO43653 123 aa11.94□□□□□ -0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 IQCJQ1A5X6 159 aa11.94□□□□□ -0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 RNF185Q96GF1 192 aa11.94□□□□□ -0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 KLK12Q9UKR0 248 aa11.94□□□□□ -0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 C16orf90A8MZG2 172 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 KRTAP10-2P60368 255 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 PKIAP61925 76 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 ELOBQ15370 118 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 MPV17L2Q567V2 206 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 EREGO14944 169 aa11.92□□□□□ -0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 RAB4AP20338 218 aa11.92□□□□□ -0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 GAGE6Q13070 117 aa11.92□□□□□ -0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 AMN1Q8IY45 258 aa11.92□□□□□ -0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa11.92□□□□□ -0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 GAS8-AS1O95177 125 aa11.91□□□□□ -0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 ATRAIDQ6UW56 229 aa11.91□□□□□ -0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 UQCC3Q6UW78 93 aa11.91□□□□□ -0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 TM2D2Q9BX73 214 aa11.91□□□□□ -0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 DNAH5Q8TE73 4624 aa11.9□□□□□ -0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 LRCOL1A6NCL2 159 aa11.9□□□□□ -0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 PPP1R2P9O14990 202 aa11.9□□□□□ -0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 COTL1Q14019 142 aa11.9□□□□□ -0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 Q8N976 141 aa11.9□□□□□ -0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 UBE2WQ96B02 151 aa11.9□□□□□ -0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 MRAP2Q96G30 205 aa11.9□□□□□ -0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 TMEM243Q9BU79 118 aa11.9□□□□□ -0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa11.89□□□□□ -0.51
UBE2Q1-207ENST00000497453 ANGP03950 147 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
UBE2Q1-207ENST00000497453 RBX1P62877 108 aa11.89□□□□□ -0.51
UBE2Q1-207ENST00000497453 KIAA1109Q2LD37 5005 aa11.89□□□□□ -0.51
UBE2Q1-207ENST00000497453 LRP1BQ9NZR2 4599 aa11.88□□□□□ -0.51
UBE2Q1-207ENST00000497453 HERC2O95714 4834 aa11.88□□□□□ -0.51
UBE2Q1-207ENST00000497453 A0A1B0GW15 77 aa11.88□□□□□ -0.51
UBE2Q1-207ENST00000497453 SDHAF1A6NFY7 115 aa11.88□□□□□ -0.51
UBE2Q1-207ENST00000497453 AMTP48728 403 aa11.88□□□□□ -0.51
UBE2Q1-207ENST00000497453 CAMPP49913 170 aa11.88□□□□□ -0.51
UBE2Q1-207ENST00000497453 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
UBE2Q1-207ENST00000497453 ENHOQ6UWT2 76 aa11.88□□□□□ -0.51
UBE2Q1-207ENST00000497453 RMI2Q96E14 147 aa11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.7 ms