RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 SCGB1C2P0DMR2 95 aa1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 HLA-DRB4P13762 266 aa1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 CLDN12P56749 244 aa1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 TAS2R30P59541 319 aa1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 TSPAN5P62079 268 aa1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 LSM3P62310 102 aaKnown RBP1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 DHRS2Q13268 280 aa1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF345Q14585 488 aa1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 AADACL3Q5VUY0 350 aa1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 Q6ZQT7 251 aa1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 TCTE3Q8IZS6 198 aa1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 C3orf22Q8N5N4 141 aa1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 OR4C16Q8NGL9 310 aa1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 SCGB1C1Q8TD33 95 aa1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 UBE2WQ96B02 151 aa1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 LINC01587Q99440 93 aa1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM70Q9BUB7 260 aa1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 NMES1Q9C002 83 aa1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM222Q9H0R3 208 aa1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 HRASLSQ9HDD0 168 aa1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM14BQ9NUH8 114 aa1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 FKBP11Q9NYL4 201 aa1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 UFC1Q9Y3C8 167 aa1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A0J9YY99 117 aa1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A1W2PNM2 257 aa1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 A6NED7 52 aa1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 HMSDA8MTL9 139 aa1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 H3BP45 60 aa1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 CORTO00230 105 aa1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 IFNA21P01568 189 aa1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 IFNA17P01571 189 aa1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 APOA2P02652 100 aa1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 CD3DP04234 171 aa1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 OR4E1P0C645 316 aa1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 NQO2P16083 231 aa1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 S100A2P29034 98 aa1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 S100A7P31151 101 aa1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 PIGPP57054 158 aa1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP1.36□□□□□ -2.19
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RABGGTB-211ENST00000489450 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 RTL8BQ17RB0 113 aa1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 VMA21Q3ZAQ7 101 aa1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 SPINK9Q5DT21 86 aa1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 WFDC10BQ8IUB3 73 aa1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 OR13C8Q8NGS7 320 aa1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa1.36□□□□□ -2.19
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RABGGTB-211ENST00000489450 HYLS1Q96M11 299 aa1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP1.36□□□□□ -2.19
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RABGGTB-211ENST00000489450 GGACTQ9BVM4 153 aa1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 HINT2Q9BX68 163 aa1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC25A31Q9H0C2 315 aa1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 NAA60Q9H7X0 242 aa1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 BET1LQ9NYM9 111 aa1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 U3KQ87 197 aa1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 USH2AO75445 5202 aa1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 TRAV2A0A0B4J234 112 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A0D9SG52 128 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 C9orf170A2RU37 121 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 M0QXV9 152 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 M0R2Z0 102 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 CYB5BO43169 146 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 PITX3O75364 302 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 SFT2D2O95562 160 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 MT-CO2P00403 227 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 CFDP00746 253 aaPredicted RBP1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 C1QBP02746 253 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 SPART-AS1P0CW21 52 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 SULT1A3P0DMM9 295 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 SULT1A4P0DMN0 295 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 OR13C7P0DN81 318 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC25A4P12235 298 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 AKR1C4P17516 323 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 CRYBB3P26998 211 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 SPCS3P61009 180 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 DAD1P61803 113 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 OR2F1Q13607 317 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 BSXQ3C1V8 233 aa1.35□□□□□ -2.19
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