RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 Q8N3U1 123 aa14.11□□□□□ -0.15
ACTB-211ENST00000480301 M0QY20 66 aa14.1□□□□□ -0.15
ACTB-211ENST00000480301 TWIST1Q15672 202 aa14.1□□□□□ -0.15
ACTB-211ENST00000480301 TMEM241Q24JQ0 296 aa14.1□□□□□ -0.15
ACTB-211ENST00000480301 FAM74A3Q4VXF1 159 aa14.1□□□□□ -0.15
ACTB-211ENST00000480301 SUMO4Q6EEV6 95 aa14.1□□□□□ -0.15
ACTB-211ENST00000480301 DPH3P1Q9H4G8 78 aa14.1□□□□□ -0.15
ACTB-211ENST00000480301 SMDT1Q9H4I9 107 aa14.1□□□□□ -0.15
ACTB-211ENST00000480301 OSTCQ9NRP0 149 aa14.1□□□□□ -0.15
ACTB-211ENST00000480301 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
ACTB-211ENST00000480301 PGLYRP4Q96LB8 373 aa14.08□□□□□ -0.16
ACTB-211ENST00000480301 RPL23P62829 140 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
ACTB-211ENST00000480301 NIT1Q86X76 327 aa14.07□□□□□ -0.16
ACTB-211ENST00000480301 ISOC2Q96AB3 205 aa14.07□□□□□ -0.16
ACTB-211ENST00000480301 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa14.06□□□□□ -0.16
ACTB-211ENST00000480301 H7C1H1 209 aa14.06□□□□□ -0.16
ACTB-211ENST00000480301 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
ACTB-211ENST00000480301 TSKUQ8WUA8 353 aa14.06□□□□□ -0.16
ACTB-211ENST00000480301 DNAJC30Q96LL9 226 aa14.06□□□□□ -0.16
ACTB-211ENST00000480301 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
ACTB-211ENST00000480301 NAT8Q9UHE5 227 aa14.06□□□□□ -0.16
ACTB-211ENST00000480301 KIAA1109Q2LD37 5005 aa14.06□□□□□ -0.16
ACTB-211ENST00000480301 SPATA12Q7Z6I5 190 aa14.05□□□□□ -0.16
ACTB-211ENST00000480301 GFRA4Q9GZZ7 299 aa14.05□□□□□ -0.16
ACTB-211ENST00000480301 V9GYV3 84 aa14.05□□□□□ -0.16
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP10-2P60368 255 aa14.04□□□□□ -0.16
ACTB-211ENST00000480301 RASL11AQ6T310 242 aa14.04□□□□□ -0.16
ACTB-211ENST00000480301 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
ACTB-211ENST00000480301 Q9HAA7 133 aa14.04□□□□□ -0.16
ACTB-211ENST00000480301 FAM231BA6NCW3 169 aa14.03□□□□□ -0.16
ACTB-211ENST00000480301 LAGE3Q14657 143 aa14.03□□□□□ -0.16
ACTB-211ENST00000480301 ADIRFQ15847 76 aa14.03□□□□□ -0.16
ACTB-211ENST00000480301 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa14.03□□□□□ -0.16
ACTB-211ENST00000480301 C15orf54Q8N8G6 183 aa14.03□□□□□ -0.16
ACTB-211ENST00000480301 LRP1BQ9NZR2 4599 aa14.03□□□□□ -0.16
ACTB-211ENST00000480301 DNAH5Q8TE73 4624 aa14.02□□□□□ -0.16
ACTB-211ENST00000480301 HIGD1CA8MV81 97 aa14.02□□□□□ -0.17
ACTB-211ENST00000480301 RAB14P61106 215 aa14.02□□□□□ -0.17
ACTB-211ENST00000480301 NIT2Q9NQR4 276 aa14.02□□□□□ -0.17
ACTB-211ENST00000480301 HERC2O95714 4834 aa14.02□□□□□ -0.17
ACTB-211ENST00000480301 A0A087WTM6 91 aa14.01□□□□□ -0.17
ACTB-211ENST00000480301 C16orf90A8MZG2 172 aa14.01□□□□□ -0.17
ACTB-211ENST00000480301 TMEM97Q5BJF2 176 aa14.01□□□□□ -0.17
ACTB-211ENST00000480301 GATD1Q8NB37 220 aa14.01□□□□□ -0.17
ACTB-211ENST00000480301 CHCHD7Q9BUK0 85 aa14.01□□□□□ -0.17
ACTB-211ENST00000480301 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa14.01□□□□□ -0.17
ACTB-211ENST00000480301 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa14□□□□□ -0.17
ACTB-211ENST00000480301 SMIM15Q7Z3B0 74 aa14□□□□□ -0.17
ACTB-211ENST00000480301 A0A087WX48 190 aa13.99□□□□□ -0.17
ACTB-211ENST00000480301 A0A1B0GUT8 65 aa13.99□□□□□ -0.17
ACTB-211ENST00000480301 BORCS7Q96B45 105 aa13.99□□□□□ -0.17
ACTB-211ENST00000480301 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa13.98□□□□□ -0.17
ACTB-211ENST00000480301 TMEM262E9PQX1 116 aa13.98□□□□□ -0.17
ACTB-211ENST00000480301 EREGO14944 169 aa13.98□□□□□ -0.17
ACTB-211ENST00000480301 IFITM2Q01629 132 aa13.98□□□□□ -0.17
ACTB-211ENST00000480301 NUP35Q8NFH5 326 aa13.98□□□□□ -0.17
ACTB-211ENST00000480301 KLK12Q9UKR0 248 aa13.98□□□□□ -0.17
ACTB-211ENST00000480301 LRCOL1A6NCL2 159 aa13.97□□□□□ -0.17
ACTB-211ENST00000480301 PSCAO43653 123 aa13.97□□□□□ -0.17
ACTB-211ENST00000480301 CLLU1Q5K131 121 aa13.97□□□□□ -0.17
ACTB-211ENST00000480301 KCNIP4Q6PIL6 250 aa13.97□□□□□ -0.17
ACTB-211ENST00000480301 FRZBQ92765 325 aa13.97□□□□□ -0.17
ACTB-211ENST00000480301 CHCHD5Q9BSY4 110 aa13.97□□□□□ -0.17
ACTB-211ENST00000480301 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa13.96□□□□□ -0.17
ACTB-211ENST00000480301 IQCJQ1A5X6 159 aa13.96□□□□□ -0.17
ACTB-211ENST00000480301 TM2D2Q9BX73 214 aa13.96□□□□□ -0.17
ACTB-211ENST00000480301 TMEM191AQ9H0A3 160 aa13.96□□□□□ -0.17
ACTB-211ENST00000480301 NAT8BQ9UHF3 227 aa13.96□□□□□ -0.17
ACTB-211ENST00000480301 ELOBQ15370 118 aa13.95□□□□□ -0.18
ACTB-211ENST00000480301 MPV17L2Q567V2 206 aa13.95□□□□□ -0.18
ACTB-211ENST00000480301 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
ACTB-211ENST00000480301 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa13.95□□□□□ -0.18
ACTB-211ENST00000480301 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa13.94□□□□□ -0.18
ACTB-211ENST00000480301 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa13.94□□□□□ -0.18
ACTB-211ENST00000480301 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP13.94□□□□□ -0.186e-7■■■□□ 16.1
ACTB-211ENST00000480301 ATRAIDQ6UW56 229 aa13.94□□□□□ -0.18
ACTB-211ENST00000480301 UBE2WQ96B02 151 aa13.94□□□□□ -0.18
ACTB-211ENST00000480301 RYR1P21817 5038 aa13.93□□□□□ -0.18
ACTB-211ENST00000480301 PKIAP61925 76 aa13.93□□□□□ -0.18
ACTB-211ENST00000480301 GAGE6Q13070 117 aa13.93□□□□□ -0.18
ACTB-211ENST00000480301 Q8N976 141 aa13.93□□□□□ -0.18
ACTB-211ENST00000480301 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa13.93□□□□□ -0.18
ACTB-211ENST00000480301 RNF185Q96GF1 192 aa13.93□□□□□ -0.18
ACTB-211ENST00000480301 GAS8-AS1O95177 125 aa13.92□□□□□ -0.18
ACTB-211ENST00000480301 RIGQ13278 110 aa13.92□□□□□ -0.18
ACTB-211ENST00000480301 RAB4AP20338 218 aa13.91□□□□□ -0.18
ACTB-211ENST00000480301 RBX1P62877 108 aa13.91□□□□□ -0.18
ACTB-211ENST00000480301 ENHOQ6UWT2 76 aa13.91□□□□□ -0.18
ACTB-211ENST00000480301 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa13.91□□□□□ -0.18
ACTB-211ENST00000480301 COTL1Q14019 142 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTB-211ENST00000480301 CDPF1Q6NVV7 123 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTB-211ENST00000480301 AMN1Q8IY45 258 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTB-211ENST00000480301 RMI2Q96E14 147 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTB-211ENST00000480301 COX11Q9Y6N1 276 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTB-211ENST00000480301 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa13.89□□□□□ -0.19
ACTB-211ENST00000480301 ANGP03950 147 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
ACTB-211ENST00000480301 Q0VG73 95 aa13.89□□□□□ -0.19
ACTB-211ENST00000480301 WFDC2Q14508 124 aa13.89□□□□□ -0.19
ACTB-211ENST00000480301 TMEM243Q9BU79 118 aa13.89□□□□□ -0.19
ACTB-211ENST00000480301 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa13.88□□□□□ -0.19
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