RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447950.1

PTPRD-AS1-202, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD-AS1, Length 1,668 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TEX46H3BTG2 121 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IFNA1P01562 189 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 AP1S3Q96PC3 154 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TM2D2Q9BX73 214 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FAM30AQ9NZY2 134 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 VAX2Q9UIW0 290 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 F5H697 171 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ALKAL2Q6UX46 152 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BAALCQ8WXS3 180 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 K7EN84 100 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MPV17L2Q567V2 206 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SMIM12Q96EX1 92 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 P01737 135 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MGPP08493 103 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RPS20P60866 119 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TOR2AQ5JU69 321 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LYZL1Q6UWQ5 148 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 UBE2WQ96B02 151 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 EPM2AB3EWF7 344 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 Q5VSD8 79 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SUMO4Q6EEV6 95 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NUDT10Q8NFP7 164 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NUDT11Q96G61 164 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 A0A087WX48 190 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 A0A1B0GVG6 124 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 M0QY20 66 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LINC01620Q4KN68 170 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ENHOQ6UWT2 76 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CHCHD7Q9BUK0 85 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TMEM262E9PQX1 116 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SMIM17P0DL12 118 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ATRAIDQ6UW56 229 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C15orf54Q8N8G6 183 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 Q8N976 141 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 OCC1Q8TAD7 63 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TMEM70Q9BUB7 260 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CTRLP40313 264 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CACNG7P62955 275 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NTF3P20783 257 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LYPD6BQ8NI32 183 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CHCHD5Q9BSY4 110 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GAGE6Q13070 117 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RMI2Q96E14 147 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ANGP03950 147 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CLPSL2Q6UWE3 100 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 Q6ZSA8 131 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 COX11Q9Y6N1 276 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 XKRY2A2RUG3 117 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 F2Z2F3 143 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RBX1P62877 108 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BLOC1S1P78537 153 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ELOBQ15370 118 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KCNIP4Q6PIL6 250 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GTSF1Q8WW33 167 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BIN3Q9NQY0 253 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IQCJQ1A5X6 159 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FRZBQ92765 325 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CNFNQ9BYD5 112 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DPH3P1Q9H4G8 78 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRGC1P0CF51 173 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 Q0VG73 95 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RASL11AQ6T310 242 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TMEM250H0YL14 139 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CRPP02741 224 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 INAFM2P0DMQ5 153 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TMEM97Q5BJF2 176 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C1orf43Q9BWL3 253 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GFRA4Q9GZZ7 299 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MYCBP2O75592 4640 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 H7C1H1 209 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CEBPGP53567 150 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TWIST1Q15672 202 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 WDR73Q6P4I2 378 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GATD1Q8NB37 220 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PRR34Q9NV39 138 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HLA-DQA1P01909 254 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LINC00269Q8N2A0 174 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C20orf203Q8NBC4 194 aa9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms