RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 LYPD2Q6UXB3 125 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 CLEC2BQ92478 149 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 IGFBPL1Q8WX77 278 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC01600Q96MT4 127 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 METTL26Q96S19 204 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 KAAG1Q9UBP8 84 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 Q9UF83 564 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF223E7ERA6 249 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 H3BT86 120 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 UBE2E1P51965 193 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 ACACAQ13085 2346 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1B0GX51 115 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 NDUFB3O43676 98 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV1-8P0DP01 117 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 Q6ZSV7 163 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM223A0PJW6 202 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 IGIPA6NJ69 53 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 F8W735 103 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 PRSS2P07478 247 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 LOXP28300 417 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 BSNQ9UPA5 3926 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 hADV29S1A0JD25 119 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 COX7A1P24310 79 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM219Q86XT9 240 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 CCL17Q92583 94 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 IMUPQ9GZP8 106 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 NPC2P61916 151 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF580Q9UK33 172 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 COX6CP09669 75 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 COX7CP15954 63 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 S100A4P26447 101 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 CD164Q04900 197 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 IGF2RP11717 2491 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 GHRHP01286 108 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 ABCA4P78363 2273 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF876PQ49A33 203 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 PRR9Q5T870 116 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 LEPROTO15243 131 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 NACAE9PAV3 2078 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 LST1O00453 97 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 KLK9Q2XQG4 91 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 KLK9Q9UKQ9 250 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A0J9YXY3 114 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 OVOL1O14753 267 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00643Q86TS7 51 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 GPHB5Q86YW7 130 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 UBE2E2Q96LR5 201 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 I3L3M4 83 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 IGLV1-47P01700 117 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 CTSGP08311 255 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A0U1RQV1 116 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 DSCR9P59020 149 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 C22orf34Q6ZV56 151 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM141Q96I45 108 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 DSCR8Q96T75 97 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM178BH3BS89 294 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 K7EMT4 169 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 TRACP01848 142 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-203ENST00000439720 ACYP1P07311 99 aa6.25□□□□□ -1.41
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