RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 AP1S3Q96PC3 154 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 VAX2Q9UIW0 290 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 A0A087WX48 190 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 P01737 135 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 SMIM17P0DL12 118 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 BAALCQ8WXS3 180 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 UBE2WQ96B02 151 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 TM2D2Q9BX73 214 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 K7EN84 100 aa9.15□□□□□ -0.94
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PRAME-209ENST00000439106 MPV17L2Q567V2 206 aa9.15□□□□□ -0.94
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PRAME-209ENST00000439106 LYZL1Q6UWQ5 148 aa9.15□□□□□ -0.94
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PRAME-209ENST00000439106 SMIM12Q96EX1 92 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-209ENST00000439106 NUDT11Q96G61 164 aa9.14□□□□□ -0.95
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PRAME-209ENST00000439106 C15orf54Q8N8G6 183 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-209ENST00000439106 Q8N976 141 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-209ENST00000439106 OCC1Q8TAD7 63 aa9.13□□□□□ -0.95
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PRAME-209ENST00000439106 FAM30AQ9NZY2 134 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-209ENST00000439106 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-209ENST00000439106 M0QY20 66 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-209ENST00000439106 CACNG7P62955 275 aa9.12□□□□□ -0.95
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PRAME-209ENST00000439106 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PRAME-209ENST00000439106 XKRY2A2RUG3 117 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-209ENST00000439106 ANGP03950 147 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
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PRAME-209ENST00000439106 CLPSL2Q6UWE3 100 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-209ENST00000439106 ENHOQ6UWT2 76 aa9.11□□□□□ -0.95
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PRAME-209ENST00000439106 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
PRAME-209ENST00000439106 CTRLP40313 264 aa9.1□□□□□ -0.95
PRAME-209ENST00000439106 BLOC1S1P78537 153 aa9.1□□□□□ -0.95
PRAME-209ENST00000439106 ATRAIDQ6UW56 229 aa9.1□□□□□ -0.95
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PRAME-209ENST00000439106 CRPP02741 224 aa9.09□□□□□ -0.95
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PRAME-209ENST00000439106 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
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PRAME-209ENST00000439106 COX11Q9Y6N1 276 aa9.09□□□□□ -0.95
PRAME-209ENST00000439106 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa9.08□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa9.08□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 RBX1P62877 108 aa9.08□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 TWIST1Q15672 202 aa9.08□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 RASL11AQ6T310 242 aa9.08□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 LYPD6BQ8NI32 183 aa9.08□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 GTSF1Q8WW33 167 aa9.08□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 FRZBQ92765 325 aa9.08□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 C1orf43Q9BWL3 253 aa9.08□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 TMEM250H0YL14 139 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 H7C1H1 209 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 HLA-DQA1P01909 254 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 Q0VG73 95 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 CLLU1Q5K131 121 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa9.06□□□□□ -0.96
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PRAME-209ENST00000439106 IQCJQ1A5X6 159 aa9.06□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 TMEM97Q5BJF2 176 aa9.06□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 LINC00269Q8N2A0 174 aa9.06□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 MYCBP2O75592 4640 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 INAFM2P0DMQ5 153 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 RAB14P61106 215 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 PGLYRP4Q96LB8 373 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 CNFNQ9BYD5 112 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 NIT2Q9NQR4 276 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 HERC1Q15751 4861 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 GATD1Q8NB37 220 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 SMIM7Q9BQ49 75 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 GFRA4Q9GZZ7 299 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa9.03□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 USP17L23D6RBM5 183 aa9.03□□□□□ -0.96
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