RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424585.1

NEB-208, Transcript of nebulin, humanhuman

TSL 3

Gene NEB, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEB-208ENST00000424585 PYYP10082 97 aa-0.08□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 B2MP61769 119 aa-0.08□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 RPS29P62273 56 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 RPL38P63173 70 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 HAMPP81172 84 aa-0.08□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa-0.08□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 Q8N8P6 123 aa-0.08□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 FDCSPQ8NFU4 85 aa-0.08□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 SMIM11BQ8TCY0 68 aa-0.08□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 VPS25Q9BRG1 176 aa-0.08□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa-0.08□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 CENPHQ9H3R5 247 aa-0.08□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa-0.08□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 TMEM242Q9NWH2 141 aa-0.08□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 BET1LQ9NYM9 111 aa-0.08□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 CALML5Q9NZT1 146 aa-0.08□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 APLNQ9ULZ1 77 aa-0.08□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 NDUFAF1Q9Y375 327 aa-0.08□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 DNAJC13O75165 2243 aa-0.08□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 UNC13BO14795 1591 aa-0.08□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa-0.08□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 PLXNA2O75051 1894 aa-0.08□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 AKAP6Q13023 2319 aa-0.08□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 FAM208BQ5VWN6 2430 aa-0.08□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 CHD9Q3L8U1 2897 aa-0.08□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 PDZD2O15018 2839 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 AKAP13Q12802 2813 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 AKAP11Q9UKA4 1901 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 ABCC10Q5T3U5 1492 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 APC2O95996 2303 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 TANC1Q9C0D5 1861 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 ITPR2Q14571 2701 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 CHD6Q8TD26 2715 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 ARHGEF5Q12774 1597 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 ERCC6L2Q5T890 1561 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 A0A087WVE0 104 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 A0A1B0GW64 132 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 LINC01546A6NGU7 62 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 TMEM14DPA8MWL7 114 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 H0YJX3 145 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 I3L3M4 83 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 SNCGO76070 127 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 DPM2O94777 84 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 SIX6O95475 246 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 APOC3P02656 99 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 S100A8P05109 93 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 PAEPP09466 180 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 PIPP12273 146 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 HLA-DRB4P13762 266 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 CD52P31358 61 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 SNCAP37840 140 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 EDDM3BP56851 147 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 NPC2P61916 151 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 SARNPP82979 210 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 PLGLB1Q02325 96 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 NMSQ5H8A3 153 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 SLC48A1Q6P1K1 146 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 OR8I2Q8N0Y5 310 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 C20orf197Q8N268 126 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 C9orf62Q8N4C0 152 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 TTC9CQ8N5M4 171 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 SMIM4Q8WVI0 70 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 PP6455Q8WZ26 134 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 LINC01600Q96MT4 127 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 Q96NJ1 140 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 SLC35B3Q9H1N7 401 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 BATF3Q9NR55 127 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 FAIMQ9NVQ4 179 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 SCN3BQ9NY72 215 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 CRIPTQ9P021 101 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 NDUFA12Q9UI09 145 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 S4R3F8 94 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 LPAP08519 4548 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 PSME4Q14997 1843 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 MED13LQ71F56 2210 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 SLIT1O75093 1534 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa-0.09□□□□□ -2.42
NEB-208ENST00000424585 POLQO75417 2590 aa-0.09□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.8 ms