RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417400.1

CITED1-203, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, human

TSL 2

Gene CITED1, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CITED1-203	ENST00000417400	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	PTH2	Q96A98	100 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	CHTF8	P0CG12	524 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	BATF3	Q9NR55	127 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	LPA	P08519	4548 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400		A0A0U1RRA0	63 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400		A0A1W2PRE2	83 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400		H3BVH4	76 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	IFNA7	P01567	189 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	HLA-DQA1	P01909	254 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	CRIP1	P50238	77 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	GAGE6	Q13070	117 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	TWIST1	Q15672	202 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	ZNF726P1	Q15940	193 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	MAJIN	Q3KP22	176 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	MPV17L2	Q567V2	206 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400		Q6ZRU5	148 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	PTTG1	O95997	202 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	SLPI	P03973	132 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	UBE2G2	P60604	165 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	ZFP69	Q49AA0	526 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	RMI2	Q96E14	147 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	COX11	Q9Y6N1	276 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400		A0A087WWC5	75 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	FAM74A7	A6NL05	159 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400		A8MWV9	139 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400		B4DEV8	164 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400		H0Y8G0	127 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	PEX7	O00628	323 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	UBE2D3	P61077	147 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	UBE2D2	P62837	147 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	IL36B	Q9NZH7	164 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CITED1-203	ENST00000417400	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CITED1-203	ENST00000417400		A0A087WX48	190 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CITED1-203	ENST00000417400		A0A087WYN8	130 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CITED1-203	ENST00000417400		M0R036	132 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CITED1-203	ENST00000417400	PHOX2A	O14813	284 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CITED1-203	ENST00000417400	SH2D1A	O60880	128 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CITED1-203	ENST00000417400	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CITED1-203	ENST00000417400	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CITED1-203	ENST00000417400	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CITED1-203	ENST00000417400	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CITED1-203	ENST00000417400	SFRP2	Q96HF1	295 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CITED1-203	ENST00000417400	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CITED1-203	ENST00000417400	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CITED1-203	ENST00000417400	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CITED1-203	ENST00000417400	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CITED1-203	ENST00000417400	XKRY2	A2RUG3	117 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CITED1-203	ENST00000417400	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CITED1-203	ENST00000417400		G3V3Q6	166 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CITED1-203	ENST00000417400	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CITED1-203	ENST00000417400	UBE2G1	P62253	170 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CITED1-203	ENST00000417400	HERV-K104	P63124	156 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CITED1-203	ENST00000417400	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CITED1-203	ENST00000417400	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CITED1-203	ENST00000417400		Q86TA4	180 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CITED1-203	ENST00000417400	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CITED1-203	ENST00000417400	STOML3	Q8TAV4	291 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CITED1-203	ENST00000417400	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CITED1-203	ENST00000417400	LINC01600	Q96MT4	127 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CITED1-203	ENST00000417400	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CITED1-203	ENST00000417400	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CITED1-203	ENST00000417400	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CITED1-203	ENST00000417400	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CITED1-203	ENST00000417400	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CITED1-203	ENST00000417400	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		4.19	□□□□□ -1.74

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