RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384161.1

RNU6-48P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 48, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-48P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-48P-201ENST00000384161 DISP2A7MBM2 1401 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-48P-201ENST00000384161 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-48P-201ENST00000384161 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-48P-201ENST00000384161 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-48P-201ENST00000384161 ETV6P41212 452 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-48P-201ENST00000384161 RBM3P98179 157 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-48P-201ENST00000384161 ZNF56Q15929 161 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-48P-201ENST00000384161 TRIQKQ629K1 86 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-48P-201ENST00000384161 CSAG1Q6PB30 78 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-48P-201ENST00000384161 DCUN1D2Q6PH85 259 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-48P-201ENST00000384161 DMAC1Q96GE9 116 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-48P-201ENST00000384161 LXNQ9BS40 222 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-48P-201ENST00000384161 CCDC32Q9BV29 185 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-48P-201ENST00000384161 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-48P-201ENST00000384161 LRRC37A3O60309 1634 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-48P-201ENST00000384161 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-48P-201ENST00000384161 ADGRB1O14514 1584 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-48P-201ENST00000384161 CPS1P31327 1500 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-48P-201ENST00000384161 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-48P-201ENST00000384161 AKAP6Q13023 2319 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-48P-201ENST00000384161 DNAH8Q96JB1 4490 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-48P-201ENST00000384161 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-48P-201ENST00000384161 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-48P-201ENST00000384161 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-48P-201ENST00000384161 E5RI56 91 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-48P-201ENST00000384161 H7BYZ3 331 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-48P-201ENST00000384161 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-48P-201ENST00000384161 S100A11P31949 105 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-48P-201ENST00000384161 KLKP1Q107X0 134 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-48P-201ENST00000384161 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-48P-201ENST00000384161 Q5XG85 94 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-48P-201ENST00000384161 LINC00305Q7Z4B0 112 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-48P-201ENST00000384161 MORN4Q8NDC4 146 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-48P-201ENST00000384161 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-48P-201ENST00000384161 SPRR2GQ9BYE4 73 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-48P-201ENST00000384161 ATPIF1Q9UII2 106 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-48P-201ENST00000384161 RREB1Q92766 1687 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-48P-201ENST00000384161 UNC13BO14795 1591 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-48P-201ENST00000384161 CUL7Q14999 1698 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 TMEM189A5PLL7 270 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 TMEM238C9JI98 176 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 MCRIP1C9JLW8 97 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 E7EQ34 232 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 FXYD1O00168 92 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 TPST1O60507 370 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 EDF1O60869 148 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 TMEM78Q5T7P6 136 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 GID8Q9NWU2 228 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 PAPPAQ13219 1627 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 CRYBA4P53673 196 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 RHOHQ15669 191 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 VMO1Q7Z5L0 202 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 STX12Q86Y82 276 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 ARL17AQ8IVW1 177 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 SMIM7Q9BQ49 75 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 PROK2Q9HC23 129 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 TMEM14BQ9NUH8 114 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 ABCC5O15440 1437 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 A0A096LNT2 108 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 A0A0G2JMM0 328 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 H3BMG7 143 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 SPINK1P00995 79 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 SDC4P31431 198 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 LYPD5Q6UWN5 251 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 IDO2Q6ZQW0 420 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 OR51A4Q8NGJ6 313 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 ATG5Q9H1Y0 275 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 FKBP11Q9NYL4 201 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 MED31Q9Y3C7 131 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 WDR97A6NE52 1622 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 A2MP01023 1474 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 GAPVD1Q14C86 1478 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 MLH3Q9UHC1 1453 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 SLC25A4P12235 298 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 CRYGSP22914 178 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 BLCAPP62952 87 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 Q5BKY6 102 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 TEX29Q8N6K0 151 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 CDC26Q8NHZ8 85 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 THEM6Q8WUY1 208 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 COMMD3Q9UBI1 195 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 PEG3Q9GZU2 1588 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 C1orf167Q5SNV9 1468 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 URB1O60287 2271 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 MADDQ8WXG6 1647 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 A0A1W2PRE2 83 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 OR5A2Q8NGI9 324 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 DSCR8Q96T75 97 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 PCBD2Q9H0N5 130 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 F5P12259 2224 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-48P-201ENST00000384161 PTPRGP23470 1445 aa-0.08□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms