RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345015.4

KCNQ1-203, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene KCNQ1, Length 304 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-203ENST00000345015 C9JQL5 133 aa8.31□□□□□ -1.08
KCNQ1-203ENST00000345015 F5H697 171 aa8.31□□□□□ -1.08
KCNQ1-203ENST00000345015 M0QY20 66 aa8.31□□□□□ -1.08
KCNQ1-203ENST00000345015 GAGE1Q13065 139 aa8.31□□□□□ -1.08
KCNQ1-203ENST00000345015 GAGE4Q13068 117 aa8.31□□□□□ -1.08
KCNQ1-203ENST00000345015 GAGE5Q13069 117 aa8.31□□□□□ -1.08
KCNQ1-203ENST00000345015 TWIST1Q15672 202 aa8.31□□□□□ -1.08
KCNQ1-203ENST00000345015 GAGE13Q4V321 117 aa8.31□□□□□ -1.08
KCNQ1-203ENST00000345015 OR10J3Q5JRS4 329 aa8.31□□□□□ -1.08
KCNQ1-203ENST00000345015 A0A1B0GUT8 65 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNQ1-203ENST00000345015 A0A1B0GW15 77 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNQ1-203ENST00000345015 PRSS29PA6NIE9 313 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNQ1-203ENST00000345015 HIGD1CA8MV81 97 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNQ1-203ENST00000345015 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
KCNQ1-203ENST00000345015 WFDC10BQ8IUB3 73 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNQ1-203ENST00000345015 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNQ1-203ENST00000345015 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNQ1-203ENST00000345015 MSRB1Q9NZV6 116 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNQ1-203ENST00000345015 V9GYV3 84 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNQ1-203ENST00000345015 PPP1R2P9O14990 202 aa8.29□□□□□ -1.08
KCNQ1-203ENST00000345015 RASL11AQ6T310 242 aa8.29□□□□□ -1.08
KCNQ1-203ENST00000345015 NIT2Q9NQR4 276 aa8.29□□□□□ -1.08
KCNQ1-203ENST00000345015 NAT8BQ9UHF3 227 aa8.29□□□□□ -1.08
KCNQ1-203ENST00000345015 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.28□□□□□ -1.08
KCNQ1-203ENST00000345015 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa8.28□□□□□ -1.08
KCNQ1-203ENST00000345015 MUC21A0A140T8X8 626 aa8.28□□□□□ -1.08
KCNQ1-203ENST00000345015 A0A1B0GVY2 172 aa8.28□□□□□ -1.08
KCNQ1-203ENST00000345015 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa8.28□□□□□ -1.08
KCNQ1-203ENST00000345015 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa8.28□□□□□ -1.08
KCNQ1-203ENST00000345015 IFITM2Q01629 132 aa8.28□□□□□ -1.08
KCNQ1-203ENST00000345015 RIGQ13278 110 aa8.28□□□□□ -1.08
KCNQ1-203ENST00000345015 ELOBQ15370 118 aa8.28□□□□□ -1.08
KCNQ1-203ENST00000345015 ADIRFQ15847 76 aa8.28□□□□□ -1.08
KCNQ1-203ENST00000345015 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.28□□□□□ -1.08
KCNQ1-203ENST00000345015 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.28□□□□□ -1.08
KCNQ1-203ENST00000345015 Q9UF83 564 aa8.28□□□□□ -1.08
KCNQ1-203ENST00000345015 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa8.28□□□□□ -1.08
KCNQ1-203ENST00000345015 PPP1R17O96001 155 aa8.27□□□□□ -1.09
KCNQ1-203ENST00000345015 SUMO4Q6EEV6 95 aa8.27□□□□□ -1.09
KCNQ1-203ENST00000345015 KCNIP4Q6PIL6 250 aa8.27□□□□□ -1.09
KCNQ1-203ENST00000345015 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
KCNQ1-203ENST00000345015 DNAH11Q96DT5 4516 aa8.26□□□□□ -1.09
KCNQ1-203ENST00000345015 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa8.26□□□□□ -1.09
KCNQ1-203ENST00000345015 S100A8P05109 93 aa8.26□□□□□ -1.09
KCNQ1-203ENST00000345015 NIT1Q86X76 327 aa8.26□□□□□ -1.09
KCNQ1-203ENST00000345015 NUP35Q8NFH5 326 aa8.26□□□□□ -1.09
KCNQ1-203ENST00000345015 COX11Q9Y6N1 276 aa8.26□□□□□ -1.09
KCNQ1-203ENST00000345015 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa8.26□□□□□ -1.09
KCNQ1-203ENST00000345015 MGPP08493 103 aa8.25□□□□□ -1.09
KCNQ1-203ENST00000345015 SSTP61278 116 aa8.25□□□□□ -1.09
KCNQ1-203ENST00000345015 IQCJQ1A5X6 159 aa8.25□□□□□ -1.09
KCNQ1-203ENST00000345015 ANAPC16Q96DE5 110 aa8.25□□□□□ -1.09
KCNQ1-203ENST00000345015 MRAP2Q96G30 205 aa8.25□□□□□ -1.09
KCNQ1-203ENST00000345015 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa8.24□□□□□ -1.09
KCNQ1-203ENST00000345015 A0A087WX48 190 aa8.24□□□□□ -1.09
KCNQ1-203ENST00000345015 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.24□□□□□ -1.09
KCNQ1-203ENST00000345015 NCR2O95944 276 aa8.24□□□□□ -1.09
KCNQ1-203ENST00000345015 MT-ND4LP03901 98 aa8.24□□□□□ -1.09
KCNQ1-203ENST00000345015 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa8.24□□□□□ -1.09
KCNQ1-203ENST00000345015 TM2D2Q9BX73 214 aa8.24□□□□□ -1.09
KCNQ1-203ENST00000345015 EREGO14944 169 aa8.23□□□□□ -1.09
KCNQ1-203ENST00000345015 GATD1Q8NB37 220 aa8.23□□□□□ -1.09
KCNQ1-203ENST00000345015 RMI2Q96E14 147 aa8.23□□□□□ -1.09
KCNQ1-203ENST00000345015 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa8.22□□□□□ -1.09
KCNQ1-203ENST00000345015 A0A1B0GUV1 79 aa8.22□□□□□ -1.09
KCNQ1-203ENST00000345015 TMEM218A2RU14 115 aa8.22□□□□□ -1.09
KCNQ1-203ENST00000345015 LINC00862A6NCI5 91 aa8.22□□□□□ -1.09
KCNQ1-203ENST00000345015 TNP2Q05952 138 aa8.22□□□□□ -1.09
KCNQ1-203ENST00000345015 Q0VG73 95 aa8.22□□□□□ -1.09
KCNQ1-203ENST00000345015 IMMP2LQ96T52 175 aa8.22□□□□□ -1.09
KCNQ1-203ENST00000345015 SEC11CQ9BY50 192 aa8.22□□□□□ -1.09
KCNQ1-203ENST00000345015 F8W036 122 aa8.21□□□□□ -1.1
KCNQ1-203ENST00000345015 H7C423 109 aa8.21□□□□□ -1.1
KCNQ1-203ENST00000345015 CDPF1Q6NVV7 123 aa8.21□□□□□ -1.1
KCNQ1-203ENST00000345015 ATRAIDQ6UW56 229 aa8.21□□□□□ -1.1
KCNQ1-203ENST00000345015 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
KCNQ1-203ENST00000345015 RAB4AP20338 218 aa8.2□□□□□ -1.1
KCNQ1-203ENST00000345015 HBBP68871 147 aa8.2□□□□□ -1.1
KCNQ1-203ENST00000345015 COTL1Q14019 142 aa8.2□□□□□ -1.1
KCNQ1-203ENST00000345015 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.2□□□□□ -1.1
KCNQ1-203ENST00000345015 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.2□□□□□ -1.1
KCNQ1-203ENST00000345015 CTDSP1Q9GZU7 261 aa8.2□□□□□ -1.1
KCNQ1-203ENST00000345015 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.2□□□□□ -1.1
KCNQ1-203ENST00000345015 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.19□□□□□ -1.1
KCNQ1-203ENST00000345015 A0A1B0GXF2 115 aa8.19□□□□□ -1.1
KCNQ1-203ENST00000345015 TCAPO15273 167 aa8.19□□□□□ -1.1
KCNQ1-203ENST00000345015 IGHV3-30P01768 117 aa8.19□□□□□ -1.1
KCNQ1-203ENST00000345015 IGHV3-33P01772 117 aa8.19□□□□□ -1.1
KCNQ1-203ENST00000345015 PPBPP02775 128 aa8.19□□□□□ -1.1
KCNQ1-203ENST00000345015 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa8.19□□□□□ -1.1
KCNQ1-203ENST00000345015 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa8.19□□□□□ -1.1
KCNQ1-203ENST00000345015 RPL32P62910 135 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
KCNQ1-203ENST00000345015 RNF185Q96GF1 192 aa8.19□□□□□ -1.1
KCNQ1-203ENST00000345015 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.19□□□□□ -1.1
KCNQ1-203ENST00000345015 TMEM243Q9BU79 118 aa8.19□□□□□ -1.1
KCNQ1-203ENST00000345015 TMEM242Q9NWH2 141 aa8.19□□□□□ -1.1
KCNQ1-203ENST00000345015 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa8.18□□□□□ -1.1
KCNQ1-203ENST00000345015 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa8.18□□□□□ -1.1
KCNQ1-203ENST00000345015 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.18□□□□□ -1.1
KCNQ1-203ENST00000345015 TMEM262E9PQX1 116 aa8.18□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.4 ms