RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000032487.13

Vamp1-201, Transcript of Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Vamp1, Length 2,772 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Spcs1Q9D958 161 aa9.63□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cryba4Q9JJV0 196 aa9.63□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Trav8n-2A0A075B633 112 aa9.63□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 G6pcP35576 357 aa9.63□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Defa9P50707 93 aa9.63□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ly6eQ64253 130 aa9.63□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Wdr83osQ6ZWX0 106 aa9.63□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gpbar1Q80SS6 329 aa9.63□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 TdhQ8K3F7 373 aa9.63□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 2200002J24RikQ9D807 110 aa9.63□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 TslpQ9JIE6 140 aa9.63□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 S1pr3Q9Z0U9 378 aa9.63□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ighv1-15A0A0A6YXA5 117 aa9.62□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm45521A0A1B0GRK0 198 aa9.62□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Siglec15A7E1W8 342 aa9.62□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm9772F6XPD8 135 aa9.62□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 LtaP09225 202 aa9.62□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Neil2Q6R2P8 329 aa9.62□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Lcn10Q810Z1 182 aa9.62□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Smim37Q8BT35 56 aa9.62□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm5468Q8C3D3 155 aa9.62□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm9944Q8C559 102 aa9.62□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Klf17Q8CFA7 341 aa9.62□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Vmn1r216Q8R257 298 aa9.62□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cst6Q9D1B1 149 aa9.62□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr961Q9EQ84 314 aa9.62□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Inafm1E9PV59 130 aa9.62□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Lin7cO88952 197 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Fgf12P61329 243 aa9.62□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Trappc1Q5NCF2 145 aa9.62□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 NppcQ61839 126 aa9.62□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Nat6Q9R123 314 aa9.62□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 G6pc2Q9Z186 355 aa9.62□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm5741B2RVA4 72 aa9.61□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 TectbO08524 329 aa9.61□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tcn2O88968 430 aa9.61□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Wfdc18P62810 74 aa9.61□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 A930003A15RikQ3U552 87 aa9.61□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Oosp2Q4FZG8 168 aa9.61□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Rph3alQ768S4 302 aa9.61□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr211Q8VGH2 309 aa9.61□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cox20Q9D7J4 117 aa9.61□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Fam241bQ9D882 120 aa9.61□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cnn3Q9DAW9 330 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tnfrsf13bQ9ET35 249 aa9.61□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Kcnip1Q9JJ57 227 aa9.61□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Sh2d2aQ9QXK9 374 aa9.61□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ube2l6Q9QZU9 153 aa9.61□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Kcns2O35174 477 aa9.61□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 P0C913 63 aa9.61□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gabra2P26048 451 aa9.61□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cd59bP58019 129 aa9.61□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr1419Q7TQS2 343 aa9.61□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr1381Q7TQT4 311 aa9.61□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr1380Q7TQT5 311 aa9.61□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Fam110aQ8R184 296 aa9.61□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Prok2Q9QXU7 128 aa9.61□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Mpdu1Q9R0Q9 247 aa9.61□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Zfp292Q9Z2U2 2698 aa9.6□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 2610044O15Rik8A0A087WRJ1 410 aa9.6□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Igkv6-25A0A140T8N7 115 aa9.6□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tesk1O70146 627 aa9.6□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 CrpP14847 225 aa9.6□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Rom1P32958 351 aa9.6□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 LepP41160 167 aa9.6□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cd27P41272 250 aa9.6□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Clec12bQ149M0 275 aa9.6□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm614Q3V2K1 191 aa9.6□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Zfp420Q7TMN8 578 aa9.6□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Nhlrc1Q8BR37 401 aa9.6□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr492Q8VFD1 314 aa9.6□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Hyls1Q9CXX0 307 aa9.6□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Rab9aQ9R0M6 201 aa9.6□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Eml6Q5SQM0 1958 aa9.6□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm20825J3QM67 227 aa9.6□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 A630076J17RikJ3QQ32 107 aa9.6□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Il3raP26952 396 aa9.6□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 NpyP57774 97 aa9.6□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Rac3P60764 192 aa9.6□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ssty2Q149W4 227 aa9.6□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Clpsl2Q3UW21 102 aa9.6□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm21394Q497R7 227 aa9.6□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Trav3-1Q5R1I8 114 aa9.6□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm20854Q62461 227 aa9.6□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Fam168aQ8BGZ2 244 aa9.6□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ercc8Q8CFD5 397 aa9.6□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Epdr1Q99M71 224 aa9.6□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Acp1Q9D358 158 aa9.6□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Arl13aQ9D416 372 aa9.6□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 ArtnQ9Z0L2 224 aa9.6□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm4565A0A140LJ87 301 aa9.59□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 A0A1Y7VLU2 103 aa9.59□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm6176J3QK59 301 aa9.59□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Thy1P01831 162 aa9.59□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gng4P50153 75 aa9.59□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Btg2Q04211 158 aa9.59□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tff1Q08423 87 aa9.59□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm4567Q3UTA8 301 aa9.59□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 EogtQ8BYW9 527 aa9.59□□□□□ -0.87
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cxcl15Q9WVL7 167 aa9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 94.9 ms