Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B1

Cst6, Cystatin, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cst6Q9D1B1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Cst6Q9D1B1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cst6Q9D1B1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cst6Q9D1B1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cst6Q9D1B1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cst6Q9D1B1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cst6Q9D1B1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Cst6Q9D1B1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Cst6Q9D1B1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cst6Q9D1B1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Cst6Q9D1B1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cst6Q9D1B1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Cst6Q9D1B1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cst6Q9D1B1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Cst6Q9D1B1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cst6Q9D1B1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cst6Q9D1B1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cst6Q9D1B1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cst6Q9D1B1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cst6Q9D1B1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cst6Q9D1B1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cst6Q9D1B1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cst6Q9D1B1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cst6Q9D1B1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cst6Q9D1B1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cst6Q9D1B1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Cst6Q9D1B1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cst6Q9D1B1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Cst6Q9D1B1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cst6Q9D1B1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cst6Q9D1B1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cst6Q9D1B1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cst6Q9D1B1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cst6Q9D1B1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cst6Q9D1B1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cst6Q9D1B1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cst6Q9D1B1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cst6Q9D1B1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cst6Q9D1B1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cst6Q9D1B1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cst6Q9D1B1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cst6Q9D1B1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cst6Q9D1B1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cst6Q9D1B1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cst6Q9D1B1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cst6Q9D1B1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cst6Q9D1B1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cst6Q9D1B1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cst6Q9D1B1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cst6Q9D1B1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cst6Q9D1B1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cst6Q9D1B1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cst6Q9D1B1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cst6Q9D1B1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cst6Q9D1B1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cst6Q9D1B1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cst6Q9D1B1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cst6Q9D1B1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cst6Q9D1B1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cst6Q9D1B1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cst6Q9D1B1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cst6Q9D1B1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cst6Q9D1B1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cst6Q9D1B1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cst6Q9D1B1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cst6Q9D1B1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cst6Q9D1B1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cst6Q9D1B1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cst6Q9D1B1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cst6Q9D1B1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cst6Q9D1B1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cst6Q9D1B1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cst6Q9D1B1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cst6Q9D1B1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cst6Q9D1B1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cst6Q9D1B1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cst6Q9D1B1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cst6Q9D1B1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cst6Q9D1B1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cst6Q9D1B1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cst6Q9D1B1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cst6Q9D1B1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cst6Q9D1B1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cst6Q9D1B1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cst6Q9D1B1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cst6Q9D1B1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cst6Q9D1B1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cst6Q9D1B1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cst6Q9D1B1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cst6Q9D1B1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cst6Q9D1B1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cst6Q9D1B1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cst6Q9D1B1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cst6Q9D1B1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cst6Q9D1B1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cst6Q9D1B1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cst6Q9D1B1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cst6Q9D1B1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cst6Q9D1B1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cst6Q9D1B1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms