RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638876.1

SLC35A3-211, Transcript of solute carrier family 35 member A3, humanhuman

TSL 5

Gene SLC35A3, Length 1,005 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A3-211ENST00000638876 CXCL1P09341 107 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC35A3-211ENST00000638876 RPL35P42766 123 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SLC35A3-211ENST00000638876 KRTAP10-2P60368 255 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC35A3-211ENST00000638876 C11orf52Q96A22 123 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC35A3-211ENST00000638876 PRR27Q6MZM9 219 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC35A3-211ENST00000638876 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SLC35A3-211ENST00000638876 A0A087WWL8 130 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC35A3-211ENST00000638876 LINC00694P0DN24 101 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC35A3-211ENST00000638876 RPL19P84098 196 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SLC35A3-211ENST00000638876 AKAP14Q86UN6 197 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC35A3-211ENST00000638876 IFNA1P01562 189 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC35A3-211ENST00000638876 CDK2AP2O75956 126 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC35A3-211ENST00000638876 DERL1Q9BUN8 251 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC35A3-211ENST00000638876 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC35A3-211ENST00000638876 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SLC35A3-211ENST00000638876 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC35A3-211ENST00000638876 Q9UF83 564 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC35A3-211ENST00000638876 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC35A3-211ENST00000638876 A0A087WTM6 91 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC35A3-211ENST00000638876 A0A087WWC5 75 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC35A3-211ENST00000638876 PDE6DO43924 150 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC35A3-211ENST00000638876 IGHV3-30P01768 117 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC35A3-211ENST00000638876 IGHV3-33P01772 117 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC35A3-211ENST00000638876 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC35A3-211ENST00000638876 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC35A3-211ENST00000638876 CENPWQ5EE01 88 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC35A3-211ENST00000638876 OR10AG1Q8NH19 301 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC35A3-211ENST00000638876 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SLC35A3-211ENST00000638876 SNAI2O43623 268 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC35A3-211ENST00000638876 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC35A3-211ENST00000638876 OR5AL1P0C617 328 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC35A3-211ENST00000638876 BCL2P10415 239 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC35A3-211ENST00000638876 SPANXN1Q5VSR9 72 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC35A3-211ENST00000638876 CDPF1Q6NVV7 123 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC35A3-211ENST00000638876 C9orf62Q8N4C0 152 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC35A3-211ENST00000638876 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SLC35A3-211ENST00000638876 SMIM12Q96EX1 92 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC35A3-211ENST00000638876 PSCAO43653 123 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC35A3-211ENST00000638876 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SLC35A3-211ENST00000638876 GNG4P50150 75 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC35A3-211ENST00000638876 MED9Q9NWA0 146 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC35A3-211ENST00000638876 RAB19A4D1S5 217 aa14.6□□□□□ -0.07
SLC35A3-211ENST00000638876 RAB4BP61018 213 aa14.6□□□□□ -0.07
SLC35A3-211ENST00000638876 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SLC35A3-211ENST00000638876 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SLC35A3-211ENST00000638876 VAX2Q9UIW0 290 aa14.6□□□□□ -0.07
SLC35A3-211ENST00000638876 IGLV2-8P01709 118 aa14.59□□□□□ -0.07
SLC35A3-211ENST00000638876 RPS20P60866 119 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SLC35A3-211ENST00000638876 LAGE3Q14657 143 aa14.59□□□□□ -0.07
SLC35A3-211ENST00000638876 Q9HAA7 133 aa14.59□□□□□ -0.07
SLC35A3-211ENST00000638876 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa14.58□□□□□ -0.08
SLC35A3-211ENST00000638876 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa14.58□□□□□ -0.08
SLC35A3-211ENST00000638876 MUC21A0A140T8X8 626 aa14.58□□□□□ -0.08
SLC35A3-211ENST00000638876 ZNF56Q15929 161 aa14.58□□□□□ -0.08
SLC35A3-211ENST00000638876 BIN3Q9NQY0 253 aa14.58□□□□□ -0.08
SLC35A3-211ENST00000638876 OR2D3Q8NGH3 330 aa14.57□□□□□ -0.08
SLC35A3-211ENST00000638876 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa14.57□□□□□ -0.08
SLC35A3-211ENST00000638876 LRP1BQ9NZR2 4599 aa14.57□□□□□ -0.08
SLC35A3-211ENST00000638876 SMIM17P0DL12 118 aa14.56□□□□□ -0.08
SLC35A3-211ENST00000638876 UBE2D3P61077 147 aa14.56□□□□□ -0.08
SLC35A3-211ENST00000638876 SSTP61278 116 aa14.56□□□□□ -0.08
SLC35A3-211ENST00000638876 UBE2D2P62837 147 aa14.56□□□□□ -0.08
SLC35A3-211ENST00000638876 TOR2AQ5JU69 321 aa14.56□□□□□ -0.08
SLC35A3-211ENST00000638876 OR10G8Q8NGN5 311 aa14.56□□□□□ -0.08
SLC35A3-211ENST00000638876 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa14.56□□□□□ -0.08
SLC35A3-211ENST00000638876 XKRY2A2RUG3 117 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC35A3-211ENST00000638876 C19orf71A6NCJ1 209 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC35A3-211ENST00000638876 F5H697 171 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC35A3-211ENST00000638876 P01737 135 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC35A3-211ENST00000638876 BLOC1S1P78537 153 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC35A3-211ENST00000638876 Q8N3U1 123 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC35A3-211ENST00000638876 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC35A3-211ENST00000638876 AP1S3Q96PC3 154 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC35A3-211ENST00000638876 TPPP3Q9BW30 176 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC35A3-211ENST00000638876 TM2D2Q9BX73 214 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC35A3-211ENST00000638876 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC35A3-211ENST00000638876 GZMBP10144 247 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC35A3-211ENST00000638876 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
SLC35A3-211ENST00000638876 ALKAL2Q6UX46 152 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC35A3-211ENST00000638876 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC35A3-211ENST00000638876 IGLC6P0CF74 106 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC35A3-211ENST00000638876 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SLC35A3-211ENST00000638876 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC35A3-211ENST00000638876 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SLC35A3-211ENST00000638876 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC35A3-211ENST00000638876 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SLC35A3-211ENST00000638876 RYR1P21817 5038 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC35A3-211ENST00000638876 LRCOL1A6NCL2 159 aa14.52□□□□□ -0.09
SLC35A3-211ENST00000638876 RBFOX3A6NFN3 312 aa14.52□□□□□ -0.09
SLC35A3-211ENST00000638876 CACNG7P62955 275 aa14.52□□□□□ -0.09
SLC35A3-211ENST00000638876 KCNIP4Q6PIL6 250 aa14.52□□□□□ -0.09
SLC35A3-211ENST00000638876 NIT1Q86X76 327 aa14.52□□□□□ -0.09
SLC35A3-211ENST00000638876 CHCHD7Q9BUK0 85 aa14.51□□□□□ -0.09
SLC35A3-211ENST00000638876 A0A087WX48 190 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC35A3-211ENST00000638876 F2Z2F3 143 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC35A3-211ENST00000638876 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC35A3-211ENST00000638876 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SLC35A3-211ENST00000638876 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa14.48□□□□□ -0.09
SLC35A3-211ENST00000638876 ELOBQ15370 118 aa14.48□□□□□ -0.09
SLC35A3-211ENST00000638876 NUDT10Q8NFP7 164 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 190.5 ms