RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	C15orf32	Q32M92	178 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-225	ENST00000630659	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-225	ENST00000630659	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-225	ENST00000630659	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-225	ENST00000630659	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-225	ENST00000630659	TENM4	Q6N022	2769 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-225	ENST00000630659	CTSG	P08311	255 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-225	ENST00000630659	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-225	ENST00000630659	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-225	ENST00000630659	CR1	P17927	2039 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF815P	A8K554	130 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	TCL1B	O95988	128 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	IGHG2	P01859	326 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM126A	Q9H061	195 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	FSHB	P01225	129 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	ORM1	P02763	201 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	IGF1	P05019	195 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	CLEC3B	P05452	202 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	PTH2	Q96A98	100 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	HLA-DMB	P28068	263 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	HERVK_113	P61574	105 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	NRAC	Q8N912	160 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	ASCL2	Q99929	193 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	TOMM6	Q96B49	74 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	SLC25A20	O43772	301 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	RBAKDN	A6NC62	111 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	BLCAP	P62952	87 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	APC	P25054	2843 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		11.6	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	FAM223B	A6NKX1	122 aa		11.6	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659		H3BVH4	76 aa		11.6	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	IGHV4-59	P01825	116 aa		11.6	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		11.6	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC140	Q96MF4	163 aa		11.6	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		11.6	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		11.6	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	TRGV3	P03979	118 aa		11.6	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		11.6	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		11.6	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		11.59	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659		H3BUA1	57 aa		11.59	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	GAS8-AS1	O95177	125 aa		11.59	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	BRI3	O95415	125 aa		11.59	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659		P0DMU3	169 aa		11.59	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	FAM231A	P0DMU4	169 aa		11.59	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	FAM231C	P0DMU5	169 aa		11.59	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF575	Q86XF7	245 aa		11.59	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC179	H3BU77	68 aa		11.58	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659		Q6ZS46	218 aa		11.58	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		11.58	□□□□□ -0.55
BBS1-225	ENST00000630659	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
BBS1-225	ENST00000630659	KIR2DL4	Q99706	377 aa		11.58	□□□□□ -0.56
BBS1-225	ENST00000630659	ERCC8	Q13216	396 aa		11.57	□□□□□ -0.56
BBS1-225	ENST00000630659		Q6YL49	198 aa		11.57	□□□□□ -0.56
BBS1-225	ENST00000630659	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		11.57	□□□□□ -0.56
BBS1-225	ENST00000630659	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		11.57	□□□□□ -0.56
BBS1-225	ENST00000630659	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		11.56	□□□□□ -0.56
BBS1-225	ENST00000630659	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		11.56	□□□□□ -0.56
BBS1-225	ENST00000630659	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		11.56	□□□□□ -0.56
BBS1-225	ENST00000630659		A0A0J9YY99	117 aa		11.56	□□□□□ -0.56
BBS1-225	ENST00000630659	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		11.56	□□□□□ -0.56
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF580	Q9UK33	172 aa		11.56	□□□□□ -0.56
BBS1-225	ENST00000630659	PPP1R17	O96001	155 aa		11.56	□□□□□ -0.56
BBS1-225	ENST00000630659	CFC1B	P0CG36	223 aa		11.56	□□□□□ -0.56
BBS1-225	ENST00000630659	CFC1	P0CG37	223 aa		11.56	□□□□□ -0.56
BBS1-225	ENST00000630659	USMG5	Q96IX5	58 aa		11.56	□□□□□ -0.56
BBS1-225	ENST00000630659	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		11.56	□□□□□ -0.56
BBS1-225	ENST00000630659	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		11.55	□□□□□ -0.56
BBS1-225	ENST00000630659	IGHV3-30	P01768	117 aa		11.55	□□□□□ -0.56
BBS1-225	ENST00000630659	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		11.55	□□□□□ -0.56
BBS1-225	ENST00000630659	ATXN8	Q156A1	80 aa		11.55	□□□□□ -0.56
BBS1-225	ENST00000630659		Q8TAT8	98 aa		11.55	□□□□□ -0.56
BBS1-225	ENST00000630659	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		11.55	□□□□□ -0.56
BBS1-225	ENST00000630659	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	11.55	□□□□□ -0.56
BBS1-225	ENST00000630659		C9JAW5	83 aa		11.54	□□□□□ -0.56
BBS1-225	ENST00000630659	IGLV1-40	P01703	118 aa		11.54	□□□□□ -0.56
BBS1-225	ENST00000630659	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		11.54	□□□□□ -0.56

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