RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591387.5

CTIF-209, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 859 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-209ENST00000591387 A0A1B0GV50 99 aa12.09□□□□□ -0.47
CTIF-209ENST00000591387 SCO2A0A1W2PP80 73 aa12.09□□□□□ -0.47
CTIF-209ENST00000591387 IGHV3-30P01768 117 aa12.09□□□□□ -0.47
CTIF-209ENST00000591387 IGHV3-33P01772 117 aa12.09□□□□□ -0.47
CTIF-209ENST00000591387 CXCL1P09341 107 aa12.09□□□□□ -0.47
CTIF-209ENST00000591387 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa12.09□□□□□ -0.47
CTIF-209ENST00000591387 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa12.09□□□□□ -0.47
CTIF-209ENST00000591387 RAB5CP51148 216 aa12.09□□□□□ -0.47
CTIF-209ENST00000591387 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
CTIF-209ENST00000591387 BAGE2Q86Y30 109 aa12.09□□□□□ -0.47
CTIF-209ENST00000591387 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
CTIF-209ENST00000591387 MLST8Q9BVC4 326 aa12.09□□□□□ -0.47
CTIF-209ENST00000591387 DNAH5Q8TE73 4624 aa12.08□□□□□ -0.48
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CTIF-209ENST00000591387 FAM74A4Q5TZK3 123 aa12.08□□□□□ -0.48
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CTIF-209ENST00000591387 TEX46H3BTG2 121 aa12.06□□□□□ -0.48
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CTIF-209ENST00000591387 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
CTIF-209ENST00000591387 Q9HAA7 133 aa12.06□□□□□ -0.48
CTIF-209ENST00000591387 Q9UF83 564 aa12.06□□□□□ -0.48
CTIF-209ENST00000591387 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa12.05□□□□□ -0.48
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CTIF-209ENST00000591387 C11orf52Q96A22 123 aa12.04□□□□□ -0.48
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CTIF-209ENST00000591387 COX11Q9Y6N1 276 aa12.02□□□□□ -0.49
CTIF-209ENST00000591387 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa12.02□□□□□ -0.49
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CTIF-209ENST00000591387 ZNF56Q15929 161 aa11.98□□□□□ -0.49
CTIF-209ENST00000591387 KCNIP4Q6PIL6 250 aa11.98□□□□□ -0.49
CTIF-209ENST00000591387 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
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CTIF-209ENST00000591387 TMEM70Q9BUB7 260 aa11.97□□□□□ -0.49
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CTIF-209ENST00000591387 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-209ENST00000591387 F5H697 171 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-209ENST00000591387 IGLV2-8P01709 118 aa11.95□□□□□ -0.5
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CTIF-209ENST00000591387 AP1S3Q96PC3 154 aa11.95□□□□□ -0.5
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CTIF-209ENST00000591387 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-209ENST00000591387 MUC21A0A140T8X8 626 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-209ENST00000591387 XKRY2A2RUG3 117 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-209ENST00000591387 C19orf71A6NCJ1 209 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-209ENST00000591387 BCL2P10415 239 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-209ENST00000591387 TMEM97Q5BJF2 176 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-209ENST00000591387 Q6ZNX1 250 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-209ENST00000591387 MED9Q9NWA0 146 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-209ENST00000591387 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-209ENST00000591387 RAB19A4D1S5 217 aa11.93□□□□□ -0.5
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