RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580713.1

TOP3A-210, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3A, Length 474 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-210ENST00000580713 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.47□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 TMEM242Q9NWH2 141 aa7.47□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 V9GYV3 84 aa7.47□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 ORM1P02763 201 aa7.46□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 CT83Q5H943 113 aa7.46□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 Q6ZQT7 251 aa7.46□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 OR2D3Q8NGH3 330 aa7.46□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 TMEM208Q9BTX3 173 aa7.46□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.46□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 FAT1Q14517 4588 aa7.45□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa7.45□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 XKRY2A2RUG3 117 aa7.45□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 A8MWL6 223 aa7.45□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 CRXO43186 299 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 INSP01308 110 aa7.45□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 RPS20P60866 119 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 RPL19P84098 196 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.45□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 C20orf144Q9BQM9 153 aa7.45□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 SMCO4Q9NRQ5 59 aa7.45□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 IL36BQ9NZH7 164 aa7.45□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.45□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 NAGKQ9UJ70 344 aa7.45□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 LYRM9A8MSI8 78 aa7.44□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 S100PP25815 95 aa7.44□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 MUC21Q5SSG8 566 aa7.44□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 KCNIP4Q6PIL6 250 aa7.44□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 FAM159AQ6UWV7 190 aa7.44□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 CBLN2Q8IUK8 224 aa7.44□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 TSKUQ8WUA8 353 aa7.44□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 IMMP2LQ96T52 175 aa7.44□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa7.43□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa7.43□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.43□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 ATP5G1P05496 136 aa7.43□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 GZMBP10144 247 aa7.43□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 TCL1AP56279 114 aa7.43□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa7.43□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 Q6ZSN1 163 aa7.43□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.43□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 KCNS1Q96KK3 526 aa7.43□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 GFRA4Q9GZZ7 299 aa7.43□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa7.43□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 GRIFINA4D1Z8 144 aa7.42□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 FAM231BA6NCW3 169 aa7.42□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 CXCL1P09341 107 aa7.42□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 TMEM256Q8N2U0 113 aa7.42□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 SYT8Q8NBV8 401 aa7.42□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 LINC01587Q99440 93 aa7.42□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.42□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.41□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 A0A1W2PPQ1 181 aa7.41□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 HIGD1CA8MV81 97 aa7.41□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 PRM2P04554 102 aa7.41□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 TYMSP04818 313 aa7.41□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 LINC00315P59091 139 aa7.41□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 KRTAP10-1P60331 282 aa7.41□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 ELOBQ15370 118 aa7.41□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 TDRG1Q3Y452 100 aa7.41□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 NUP35Q8NFH5 326 aa7.41□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 GTSF1Q8WW33 167 aa7.41□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.41□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 CBY3A6NI87 242 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 GNRH2O43555 120 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 IGLC6P0CF74 106 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 S100A4P26447 101 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 ASIPP42127 132 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 HAMPP81172 84 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 DNLZQ5SXM8 178 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 PGLYRP4Q96LB8 373 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 TPPP3Q9BW30 176 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3A-210ENST00000580713 H3BVH4 76 aa7.39□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 HTN1P15515 57 aa7.39□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.39□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 LYZL1Q6UWQ5 148 aa7.39□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 BORCS7Q96B45 105 aa7.39□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 BTF3L4Q96K17 158 aa7.39□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 YPEL4Q96NS1 127 aa7.39□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa7.39□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa7.38□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa7.38□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa7.38□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 F2Z2F3 143 aa7.38□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 SPINK4O60575 86 aa7.38□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 OR5AL1P0C617 328 aa7.38□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 ARMS2P0C7Q2 107 aa7.38□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 CTRLP40313 264 aa7.38□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 ESRGQ1W209 222 aa7.38□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.37□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 A0A0J9YY99 117 aa7.37□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 A0A1B0GUT8 65 aa7.37□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 COLCA2A8K830 154 aa7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms