RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563261.5

SNAI3-AS1-201, SNAI3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAI3-AS1, Length 998 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TTC32Q5I0X7 151 aa15.25■□□□□ 0.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 Q6ZSN1 163 aa15.25■□□□□ 0.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF727A8MUV8 499 aa15.24■□□□□ 0.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa15.23■□□□□ 0.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MUC21A0A140T8X8 626 aa15.23■□□□□ 0.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 A0A1W2PPQ1 181 aa15.23■□□□□ 0.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TIRAPP58753 221 aa15.23■□□□□ 0.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TPPP3Q9BW30 176 aa15.23■□□□□ 0.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 F2Z2F3 143 aa15.22■□□□□ 0.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CACNG7P62955 275 aa15.22■□□□□ 0.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PEA15Q15121 130 aa15.22■□□□□ 0.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM231DQ6ZW35 169 aa15.22■□□□□ 0.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AP1S3Q96PC3 154 aa15.22■□□□□ 0.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SMDT1Q9H4I9 107 aa15.22■□□□□ 0.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SIVA1O15304 175 aa15.21■□□□□ 0.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SOHLH1Q5JUK2 328 aa15.21■□□□□ 0.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LINC00336Q6ZUF6 198 aa15.21■□□□□ 0.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LINC00694P0DN24 101 aa15.2■□□□□ 0.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM74A3Q4VXF1 159 aa15.2■□□□□ 0.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LINC01551Q86U37 167 aa15.2■□□□□ 0.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CTRLP40313 264 aa15.19■□□□□ 0.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C1orf134Q5TEV5 83 aa15.19■□□□□ 0.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa15.19■□□□□ 0.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa15.18■□□□□ 0.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GAGE12JA6NER3 117 aa15.18■□□□□ 0.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GATCO43716 136 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SMIM17P0DL12 118 aa15.18■□□□□ 0.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RAB4BP61018 213 aa15.18■□□□□ 0.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RAB14P61106 215 aa15.18■□□□□ 0.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SSTP61278 116 aa15.18■□□□□ 0.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GAGE1Q13065 139 aa15.18■□□□□ 0.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GAGE4Q13068 117 aa15.18■□□□□ 0.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GAGE5Q13069 117 aa15.18■□□□□ 0.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF56Q15929 161 aa15.18■□□□□ 0.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GAGE13Q4V321 117 aa15.18■□□□□ 0.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LYZL1Q6UWQ5 148 aa15.18■□□□□ 0.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RTL8CO15255 209 aa15.17■□□□□ 0.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ERVFC1-1P60608 527 aa15.17■□□□□ 0.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CT83Q5H943 113 aa15.17■□□□□ 0.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 WDR73Q6P4I2 378 aa15.17■□□□□ 0.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GTSF1LQ9H1H1 148 aa15.17■□□□□ 0.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C9JQL5 133 aa15.16■□□□□ 0.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C6orf223Q8N319 242 aa15.16■□□□□ 0.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CNFNQ9BYD5 112 aa15.16■□□□□ 0.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa15.16■□□□□ 0.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 A8MWL6 223 aa15.15■□□□□ 0.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRGC1P0CF51 173 aa15.15■□□□□ 0.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMEM241Q24JQ0 296 aa15.15■□□□□ 0.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 WFDC10BQ8IUB3 73 aa15.15■□□□□ 0.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 Q9UF83 564 aa15.15■□□□□ 0.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa15.15■□□□□ 0.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BTF3P20290 206 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LELP1Q5T871 98 aa15.14■□□□□ 0.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OSTCQ9NRP0 149 aa15.14■□□□□ 0.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MSRB1Q9NZV6 116 aa15.14■□□□□ 0.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NAT8Q9UHE5 227 aa15.14■□□□□ 0.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa15.13■□□□□ 0.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 K7EP13 123 aa15.13■□□□□ 0.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GTSF1Q8WW33 167 aa15.13■□□□□ 0.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 F5H697 171 aa15.12■□□□□ 0.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DNAH10OSP0CZ25 163 aa15.12■□□□□ 0.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NTF3P20783 257 aa15.12■□□□□ 0.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LINC00315P59091 139 aa15.12■□□□□ 0.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OR10G8Q8NGN5 311 aa15.12■□□□□ 0.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ISOC2Q96AB3 205 aa15.12■□□□□ 0.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa15.11■□□□□ 0.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa15.11■□□□□ 0.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRSS29PA6NIE9 313 aa15.11■□□□□ 0.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RPL23P62829 140 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OR10J3Q5JRS4 329 aa15.11■□□□□ 0.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CLLU1Q5K131 121 aa15.11■□□□□ 0.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C15orf54Q8N8G6 183 aa15.11■□□□□ 0.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 A0A087WWC5 75 aa15.1■□□□□ 0.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa15.1■□□□□ 0.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MGPP08493 103 aa15.1■□□□□ 0.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EVI2AP22794 236 aa15.1■□□□□ 0.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DPH3P1Q9H4G8 78 aa15.1■□□□□ 0.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UBE2D3P61077 147 aa15.09■□□□□ 0.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UBE2D2P62837 147 aa15.09■□□□□ 0.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TWIST1Q15672 202 aa15.09■□□□□ 0.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ADIRFQ15847 76 aa15.09■□□□□ 0.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa15.09■□□□□ 0.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TSKUQ8WUA8 353 aa15.09■□□□□ 0.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GFRA4Q9GZZ7 299 aa15.09■□□□□ 0.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM231BA6NCW3 169 aa15.08■□□□□ 0
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 H7C1H1 209 aa15.08■□□□□ 0
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IFITM2Q01629 132 aa15.07■□□□□ 0
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LINC01556Q5JQF7 62 aa15.07■□□□□ 0
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C10orf126Q8N4M7 172 aa15.07■□□□□ 0
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BORCS7Q96B45 105 aa15.07■□□□□ 0
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 V9GYV3 84 aa15.07■□□□□ 0
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PGLYRP4Q96LB8 373 aa15.06■□□□□ 0
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HIGD1CA8MV81 97 aa15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms