RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
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PGGT1B-204ENST00000503638 RHODO00212 210 aa9.39□□□□□ -0.91
PGGT1B-204ENST00000503638 SNAI2O43623 268 aa9.39□□□□□ -0.91
PGGT1B-204ENST00000503638 LY6G6CO95867 125 aa9.39□□□□□ -0.91
PGGT1B-204ENST00000503638 IGLC6P0CF74 106 aa9.39□□□□□ -0.91
PGGT1B-204ENST00000503638 TWIST1Q15672 202 aa9.39□□□□□ -0.91
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF575Q86XF7 245 aa9.39□□□□□ -0.91
PGGT1B-204ENST00000503638 AP1S3Q96PC3 154 aa9.39□□□□□ -0.91
PGGT1B-204ENST00000503638 APLNQ9ULZ1 77 aa9.39□□□□□ -0.91
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM218A2RU14 115 aa9.38□□□□□ -0.91
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PGGT1B-204ENST00000503638 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF56Q15929 161 aa9.38□□□□□ -0.91
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PGGT1B-204ENST00000503638 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-204ENST00000503638 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
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PGGT1B-204ENST00000503638 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
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PGGT1B-204ENST00000503638 V9GYV3 84 aa9.36□□□□□ -0.91
PGGT1B-204ENST00000503638 PPP1R2P9O14990 202 aa9.35□□□□□ -0.91
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PGGT1B-204ENST00000503638 SLC25A29Q8N8R3 303 aa9.35□□□□□ -0.91
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PGGT1B-204ENST00000503638 GAGE4Q13068 117 aa9.32□□□□□ -0.92
PGGT1B-204ENST00000503638 GAGE5Q13069 117 aa9.32□□□□□ -0.92
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PGGT1B-204ENST00000503638 NDUFA5Q16718 116 aa9.32□□□□□ -0.92
PGGT1B-204ENST00000503638 GAGE13Q4V321 117 aa9.32□□□□□ -0.92
PGGT1B-204ENST00000503638 LGALS9CQ6DKI2 356 aa9.32□□□□□ -0.92
PGGT1B-204ENST00000503638 WDR73Q6P4I2 378 aa9.32□□□□□ -0.92
PGGT1B-204ENST00000503638 NUP35Q8NFH5 326 aa9.32□□□□□ -0.92
PGGT1B-204ENST00000503638 DPH3P1Q9H4G8 78 aa9.32□□□□□ -0.92
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PGGT1B-204ENST00000503638 UFSP1Q6NVU6 142 aa9.31□□□□□ -0.92
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PGGT1B-204ENST00000503638 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa9.3□□□□□ -0.92
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PGGT1B-204ENST00000503638 APOC3P02656 99 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-204ENST00000503638 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
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PGGT1B-204ENST00000503638 SH2D6Q7Z4S9 175 aa9.29□□□□□ -0.92
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PGGT1B-204ENST00000503638 ALMS1Q8TCU4 4167 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-204ENST00000503638 LOC100996750A0A140TA64 210 aa9.28□□□□□ -0.92
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PGGT1B-204ENST00000503638 ESRGQ1W209 222 aa9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-204ENST00000503638 SUMO4Q6EEV6 95 aa9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-204ENST00000503638 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa9.28□□□□□ -0.92
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PGGT1B-204ENST00000503638 LINC00588Q9Y4M8 146 aa9.28□□□□□ -0.92
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