RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498428.5

ROBO1-211, Transcript of roundabout guidance receptor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ROBO1, Length 3,566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO1-211ENST00000498428 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa5.58□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa5.58□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa5.58□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 LINC01549A6NIU2 74 aa5.58□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 H7C1H1 209 aa5.58□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 HBDP02042 147 aa5.58□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 CGB3P0DN86 165 aa5.58□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 CGB7P0DN87 165 aa5.58□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 PDPNQ86YL7 162 aa5.58□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 ODF3Q96PU9 254 aa5.58□□□□□ -1.52
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ROBO1-211ENST00000498428 ASIPP42127 132 aa5.57□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 C15orf53Q8NAA6 179 aa5.57□□□□□ -1.52
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ROBO1-211ENST00000498428 C19orf71A6NCJ1 209 aa5.57□□□□□ -1.52
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ROBO1-211ENST00000498428 HERVK_113P61574 105 aa5.57□□□□□ -1.52
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ROBO1-211ENST00000498428 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa5.57□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 SLC25A2Q9BXI2 301 aa5.57□□□□□ -1.52
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ROBO1-211ENST00000498428 IGLV1-47P01700 117 aa5.57□□□□□ -1.52
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ROBO1-211ENST00000498428 ZMAT4Q9H898 229 aa5.57□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa5.56□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa5.56□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 D6R8Y8 96 aa5.56□□□□□ -1.52
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ROBO1-211ENST00000498428 LY6G5BQ8NDX9 201 aa5.56□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 MLST8Q9BVC4 326 aa5.56□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP5.56□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 UBE2D3P61077 147 aa5.56□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 UBE2D2P62837 147 aa5.56□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 MLANAQ16655 118 aa5.56□□□□□ -1.52
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ROBO1-211ENST00000498428 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa5.56□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 C11orf45Q8TAV5 145 aa5.56□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa5.56□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa5.56□□□□□ -1.52
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ROBO1-211ENST00000498428 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa5.56□□□□□ -1.52
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ROBO1-211ENST00000498428 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa5.55□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 A0A1B0GUT8 65 aa5.55□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 UPK2O00526 184 aa5.55□□□□□ -1.52
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ROBO1-211ENST00000498428 RBAKDNA6NC62 111 aa5.54□□□□□ -1.52
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ROBO1-211ENST00000498428 SCGB1C2P0DMR2 95 aa5.54□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 LINC00482Q8N8I6 264 aa5.54□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF492Q9P255 531 aa5.54□□□□□ -1.52
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ROBO1-211ENST00000498428 TRGV3P03979 118 aa5.54□□□□□ -1.52
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ROBO1-211ENST00000498428 TRGV9Q99603 122 aa5.54□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa5.54□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 SMKR1H3BMG3 65 aa5.54□□□□□ -1.52
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ROBO1-211ENST00000498428 PMAIP1Q13794 54 aa5.54□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 PAXXQ9BUH6 204 aa5.54□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa5.54□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 hADV29S1A0JD25 119 aa5.53□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 E7EUB6 86 aa5.53□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 AMN1Q8IY45 258 aa5.53□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 Q8N1Y9 231 aa5.53□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 LINC00311Q8N616 119 aa5.53□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 C8orf31Q8N9H6 132 aa5.53□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 ZNRF2Q8NHG8 242 aa5.53□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 NPIPB3Q92617 1050 aa5.53□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa5.53□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa5.53□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 PGPA6NDG6 321 aa5.53□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 J3QQQ9 107 aa5.53□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 SLC25A20O43772 301 aa5.53□□□□□ -1.52
ROBO1-211ENST00000498428 DPM2O94777 84 aa5.53□□□□□ -1.52
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