RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477057.5

FDPS-211, Transcript of farnesyl diphosphate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene FDPS, Length 741 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPS-211ENST00000477057 LYPD5Q6UWN5 251 aa8.73□□□□□ -1.01
FDPS-211ENST00000477057 SH2D6Q7Z4S9 175 aa8.73□□□□□ -1.01
FDPS-211ENST00000477057 NUDT10Q8NFP7 164 aa8.73□□□□□ -1.01
FDPS-211ENST00000477057 NUDT11Q96G61 164 aa8.73□□□□□ -1.01
FDPS-211ENST00000477057 AP1S3Q96PC3 154 aa8.73□□□□□ -1.01
FDPS-211ENST00000477057 RYR2Q92736 4967 aa8.73□□□□□ -1.01
FDPS-211ENST00000477057 RYR3Q15413 4870 aa8.73□□□□□ -1.01
FDPS-211ENST00000477057 SACSQ9NZJ4 4579 aa8.72□□□□□ -1.01
FDPS-211ENST00000477057 SIVA1O15304 175 aa8.72□□□□□ -1.01
FDPS-211ENST00000477057 SNAI2O43623 268 aa8.72□□□□□ -1.01
FDPS-211ENST00000477057 TTC32Q5I0X7 151 aa8.72□□□□□ -1.01
FDPS-211ENST00000477057 C1orf134Q5TEV5 83 aa8.72□□□□□ -1.01
FDPS-211ENST00000477057 Q6ZSN1 163 aa8.72□□□□□ -1.01
FDPS-211ENST00000477057 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
FDPS-211ENST00000477057 OR10J3Q5JRS4 329 aa8.71□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 LYZL1Q6UWQ5 148 aa8.71□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 ZNF575Q86XF7 245 aa8.71□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.71□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 UPK3BQ9BT76 320 aa8.71□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 HYDINQ4G0P3 5121 aa8.7□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa8.7□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 A0A1W2PPQ1 181 aa8.7□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 CRYGDP07320 174 aa8.7□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 CACNG7P62955 275 aa8.7□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 ADIRFQ15847 76 aa8.7□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 WFDC10BQ8IUB3 73 aa8.7□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 DNAH1Q9P2D7 4330 aa8.69□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 PRSS29PA6NIE9 313 aa8.69□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 F2Z2F3 143 aa8.69□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 IGLC6P0CF74 106 aa8.69□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 TWIST1Q15672 202 aa8.69□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 UFSP1Q6NVU6 142 aa8.69□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 Q6ZR54 194 aa8.69□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 C6orf223Q8N319 242 aa8.69□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 BORCS7Q96B45 105 aa8.69□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 LY96Q9Y6Y9 160 aa8.69□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 TRGC1P0CF51 173 aa8.68□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 LINC01551Q86U37 167 aa8.68□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 C15orf54Q8N8G6 183 aa8.68□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 MSRB1Q9NZV6 116 aa8.68□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 A8MWL6 223 aa8.67□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 C9JQL5 133 aa8.67□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 NTF3P20783 257 aa8.67□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 EVI2AP22794 236 aa8.67□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 RAB4BP61018 213 aa8.67□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 TMEM241Q24JQ0 296 aa8.67□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 FAM74A3Q4VXF1 159 aa8.67□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.67□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 SMIM15Q7Z3B0 74 aa8.67□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.67□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 GTSF1LQ9H1H1 148 aa8.67□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 NAT8Q9UHE5 227 aa8.67□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa8.66□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 RTL8CO15255 209 aa8.66□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 IGHV3-30P01768 117 aa8.66□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 IGHV3-33P01772 117 aa8.66□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa8.66□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa8.66□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 FAM231DQ6ZW35 169 aa8.66□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.66□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 Q9UF83 564 aa8.66□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa8.65□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa8.65□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 CTRLP40313 264 aa8.65□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 RPL23P62829 140 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 LELP1Q5T871 98 aa8.65□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.65□□□□□ -1.02
FDPS-211ENST00000477057 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa8.64□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 H7C1H1 209 aa8.64□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 LINC00315P59091 139 aa8.64□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 GTSF1Q8WW33 167 aa8.64□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 ISOC2Q96AB3 205 aa8.64□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.64□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 SMDT1Q9H4I9 107 aa8.64□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 OSTCQ9NRP0 149 aa8.64□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa8.64□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 KMT2AQ03164 3969 aa8.63□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 TIRAPP58753 221 aa8.63□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 CT83Q5H943 113 aa8.63□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 SUMO4Q6EEV6 95 aa8.63□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 KCNIP4Q6PIL6 250 aa8.63□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.63□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 OR10G8Q8NGN5 311 aa8.63□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa8.63□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 A0A087WWC5 75 aa8.62□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 HIGD1CA8MV81 97 aa8.62□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 LINC00694P0DN24 101 aa8.62□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.62□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 TSKUQ8WUA8 353 aa8.62□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 Q9HAA7 133 aa8.62□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.62□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 VPS13DQ5THJ4 4388 aa8.62□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.61□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 UBE2D3P61077 147 aa8.61□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58 ms