RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636257.1

SPTAN1-230, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-230ENST00000636257 NRARPQ7Z6K4 114 aa7.44□□□□□ -1.22
SPTAN1-230ENST00000636257 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.44□□□□□ -1.22
SPTAN1-230ENST00000636257 C15orf40Q8WUR7 153 aa7.44□□□□□ -1.22
SPTAN1-230ENST00000636257 DIRC1Q969H9 104 aa7.44□□□□□ -1.22
SPTAN1-230ENST00000636257 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa7.43□□□□□ -1.22
SPTAN1-230ENST00000636257 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.43□□□□□ -1.22
SPTAN1-230ENST00000636257 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
SPTAN1-230ENST00000636257 SLC25A2Q9BXI2 301 aa7.43□□□□□ -1.22
SPTAN1-230ENST00000636257 F6UZH7 168 aa7.42□□□□□ -1.22
SPTAN1-230ENST00000636257 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
SPTAN1-230ENST00000636257 UBE2D3P61077 147 aa7.42□□□□□ -1.22
SPTAN1-230ENST00000636257 UBE2D2P62837 147 aa7.42□□□□□ -1.22
SPTAN1-230ENST00000636257 PHYHIPLQ96FC7 376 aa7.42□□□□□ -1.22
SPTAN1-230ENST00000636257 EXTL2Q9UBQ6 330 aa7.42□□□□□ -1.22
SPTAN1-230ENST00000636257 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa7.42□□□□□ -1.22
SPTAN1-230ENST00000636257 GZMBP10144 247 aa7.41□□□□□ -1.22
SPTAN1-230ENST00000636257 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
SPTAN1-230ENST00000636257 RPL29P47914 159 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
SPTAN1-230ENST00000636257 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa7.41□□□□□ -1.22
SPTAN1-230ENST00000636257 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.41□□□□□ -1.22
SPTAN1-230ENST00000636257 CDIP1Q9H305 208 aa7.41□□□□□ -1.22
SPTAN1-230ENST00000636257 JPT2Q9H910 190 aa7.41□□□□□ -1.22
SPTAN1-230ENST00000636257 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.41□□□□□ -1.22
SPTAN1-230ENST00000636257 H0Y9J4 135 aa7.4□□□□□ -1.22
SPTAN1-230ENST00000636257 RHODO00212 210 aa7.4□□□□□ -1.22
SPTAN1-230ENST00000636257 TSC22D2O75157 780 aa7.4□□□□□ -1.22
SPTAN1-230ENST00000636257 PTTG1O95997 202 aa7.4□□□□□ -1.22
SPTAN1-230ENST00000636257 MT-ND6P03923 174 aa7.4□□□□□ -1.22
SPTAN1-230ENST00000636257 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.4□□□□□ -1.22
SPTAN1-230ENST00000636257 LSM3P62310 102 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SPTAN1-230ENST00000636257 RBX1P62877 108 aa7.4□□□□□ -1.22
SPTAN1-230ENST00000636257 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SPTAN1-230ENST00000636257 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SPTAN1-230ENST00000636257 TMEM128Q5BJH2 165 aa7.4□□□□□ -1.22
SPTAN1-230ENST00000636257 C15orf56Q8N910 161 aa7.4□□□□□ -1.22
SPTAN1-230ENST00000636257 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SPTAN1-230ENST00000636257 TVP23CQ96ET8 276 aa7.4□□□□□ -1.22
SPTAN1-230ENST00000636257 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SPTAN1-230ENST00000636257 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.39□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.39□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.39□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 P01737 135 aa7.39□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 UBE2D1P51668 147 aa7.39□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 TAS2R30P59541 319 aa7.39□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 REG3AQ06141 175 aa7.39□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 SUN5Q8TC36 379 aa7.39□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 FXYD5Q96DB9 178 aa7.39□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 GFRA4Q9GZZ7 299 aa7.39□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 TREM1Q9NP99 234 aa7.39□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 TSPAN13O95857 204 aa7.38□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 TPRXLQ17RH7 258 aa7.38□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 C1orf137Q5JT78 98 aa7.38□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 SMIM4Q8WVI0 70 aa7.38□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 DIRAS2Q96HU8 199 aa7.38□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 WDR83OSQ9Y284 106 aa7.38□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 S100A10P60903 97 aa7.37□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 RANP62826 216 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 NEDD8Q15843 81 aa7.37□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.37□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 CRYGAP11844 174 aa7.36□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 GCSAMLQ5JQS6 135 aa7.36□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.36□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 MZT2AQ6P582 158 aa7.36□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 MIR17HGQ75NE6 70 aa7.36□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 OR10G8Q8NGN5 311 aa7.36□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 SFT2D2O95562 160 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 IGLV7-43P04211 117 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 CFAP161Q6P656 301 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 MCUBQ9NWR8 336 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 RAB5CP51148 216 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 BCL7BQ9BQE9 202 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 MIXL1Q9H2W2 232 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 UQCC1Q9NVA1 299 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-230ENST00000636257 GAGE6Q13070 117 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-230ENST00000636257 PPP1R1AQ13522 171 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-230ENST00000636257 HYLS1Q96M11 299 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-230ENST00000636257 NMES1Q9C002 83 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-230ENST00000636257 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-230ENST00000636257 C7orf66A4D0T2 115 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-230ENST00000636257 SCGB1D2O95969 90 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-230ENST00000636257 CFC1BP0CG36 223 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-230ENST00000636257 RAB2AP61019 212 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-230ENST00000636257 BAXQ07812 192 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-230ENST00000636257 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-230ENST00000636257 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-230ENST00000636257 MLST8Q9BVC4 326 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-230ENST00000636257 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-230ENST00000636257 OR5AC2Q9NZP5 309 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-230ENST00000636257 TRAV6A0A075B6T7 132 aa7.31□□□□□ -1.24
SPTAN1-230ENST00000636257 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa7.31□□□□□ -1.24
SPTAN1-230ENST00000636257 S100A4P26447 101 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SPTAN1-230ENST00000636257 NCS1P62166 190 aa7.31□□□□□ -1.24
SPTAN1-230ENST00000636257 CYCSP99999 105 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SPTAN1-230ENST00000636257 TMEM97Q5BJF2 176 aa7.31□□□□□ -1.24
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