RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-215ENST00000583289 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-215ENST00000583289 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-215ENST00000583289 NBASA2RRP1 2371 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-215ENST00000583289 DMDP11532 3685 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRM-215ENST00000583289 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 TRAV40A0A0B4J280 105 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 TMEM213A2RRL7 107 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 C19orf84I3L1E1 186 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 M0QZ24 198 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 LGALS9O00182 355 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 PRSS1P07477 247 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 RNF224P0DH78 156 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 SMIM17P0DL12 118 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 IGF2RP11717 2491 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 HLA-DRB4P13762 266 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 COX6B1P14854 86 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 LEPP41159 167 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 RPL32P62910 135 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 ERCC8Q13216 396 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 TMEM219Q86XT9 240 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 ATOH7Q8N100 152 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 NBEAQ8NFP9 2946 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 OR8A1Q8NGG7 326 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 AP1S3Q96PC3 154 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 DPH3P1Q9H4G8 78 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 PEMTQ9UBM1 199 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 PRAC2D3DTV9 90 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 GAGE7O76087 117 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 DPM2O94777 84 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 NPYP01303 97 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 GAGE12FP0CL80 117 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 GAGE12GP0CL81 117 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 GAGE12IP0CL82 117 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 EVI2AP22794 236 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 PLNP26678 52 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 UQCRFS1P47985 274 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 GAGE4Q13068 117 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 UBE2V1Q13404 147 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 TAL2Q16559 108 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 TMEM97Q5BJF2 176 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 FAM159AQ6UWV7 190 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 BRD3OSQ6XYD6 125 aa3.39□□□□□ -1.87
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PTPRM-215ENST00000583289 RNF185Q96GF1 192 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 FAM19A4Q96LR4 140 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 HIGD1BQ9P298 99 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 CBY1Q9Y3M2 126 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 SPTBN4Q9H254 2564 aa3.39□□□□□ -1.87
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PTPRM-215ENST00000583289 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 A0A087WW49 117 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 TRAV2A0A0B4J234 112 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 hDV102S1A0JD36 115 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 C7orf71A4D174 169 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 H7C1H1 209 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 SOCS3O14543 225 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 VCYO14598 125 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 IGKCP01834 107 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa3.38□□□□□ -1.87
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PTPRM-215ENST00000583289 HLA-DMBP28068 263 aa3.38□□□□□ -1.87
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PTPRM-215ENST00000583289 LY6EQ16553 131 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 ERASQ7Z444 233 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 POM121L12Q8N7R1 296 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 UBE2E2Q96LR5 201 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 MED13LQ71F56 2210 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 LOC400499M0QZD8 3231 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 A0A087WX48 190 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-215ENST00000583289 A0A096LNJ9 63 aa3.37□□□□□ -1.87
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