RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559259.1

MFGE8-210, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 2

Gene MFGE8, Length 611 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-210ENST00000559259 C16orf74Q96GX8 76 aa13.13□□□□□ -0.31
MFGE8-210ENST00000559259 NDUFAF3Q9BU61 184 aa13.13□□□□□ -0.31
MFGE8-210ENST00000559259 A0A1B0GUT8 65 aa13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-210ENST00000559259 NXPH4O95158 308 aa13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-210ENST00000559259 TCL1AP56279 114 aa13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-210ENST00000559259 RRN3P1Q2M238 152 aa13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-210ENST00000559259 LYZL1Q6UWQ5 148 aa13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-210ENST00000559259 C11orf72Q8NBR9 251 aa13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-210ENST00000559259 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-210ENST00000559259 RCHY1Q96PM5 261 aa13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-210ENST00000559259 SPXQ9BT56 116 aa13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-210ENST00000559259 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-210ENST00000559259 S100A8P05109 93 aa13.11□□□□□ -0.31
MFGE8-210ENST00000559259 RIGQ13278 110 aa13.11□□□□□ -0.31
MFGE8-210ENST00000559259 DEFB121Q5J5C9 76 aa13.11□□□□□ -0.31
MFGE8-210ENST00000559259 IL17DQ8TAD2 202 aa13.11□□□□□ -0.31
MFGE8-210ENST00000559259 PGLYRP4Q96LB8 373 aa13.11□□□□□ -0.31
MFGE8-210ENST00000559259 A0A1B0GXF2 115 aa13.1□□□□□ -0.31
MFGE8-210ENST00000559259 H3BVH4 76 aa13.1□□□□□ -0.31
MFGE8-210ENST00000559259 MDFICQ9P1T7 246 aa13.1□□□□□ -0.31
MFGE8-210ENST00000559259 X6R8D5 127 aa13.1□□□□□ -0.31
MFGE8-210ENST00000559259 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa13.09□□□□□ -0.31
MFGE8-210ENST00000559259 COLCA2A8K830 154 aa13.09□□□□□ -0.31
MFGE8-210ENST00000559259 SPRY2O43597 315 aa13.09□□□□□ -0.31
MFGE8-210ENST00000559259 MIFP14174 115 aa13.09□□□□□ -0.31
MFGE8-210ENST00000559259 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
MFGE8-210ENST00000559259 DEFB135Q30KP9 77 aa13.09□□□□□ -0.31
MFGE8-210ENST00000559259 ZFP82Q8N141 532 aa13.09□□□□□ -0.31
MFGE8-210ENST00000559259 GATD1Q8NB37 220 aa13.09□□□□□ -0.31
MFGE8-210ENST00000559259 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa13.09□□□□□ -0.31
MFGE8-210ENST00000559259 HBBP68871 147 aa13.08□□□□□ -0.32
MFGE8-210ENST00000559259 SYT8Q8NBV8 401 aa13.08□□□□□ -0.32
MFGE8-210ENST00000559259 FAM210BQ96KR6 192 aa13.08□□□□□ -0.32
MFGE8-210ENST00000559259 TPPP3Q9BW30 176 aa13.08□□□□□ -0.32
MFGE8-210ENST00000559259 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa13.07□□□□□ -0.32
MFGE8-210ENST00000559259 M0R2P5 195 aa13.07□□□□□ -0.32
MFGE8-210ENST00000559259 HTN1P15515 57 aa13.07□□□□□ -0.32
MFGE8-210ENST00000559259 LGALS9BQ3B8N2 356 aa13.07□□□□□ -0.32
MFGE8-210ENST00000559259 SPANXN1Q5VSR9 72 aa13.07□□□□□ -0.32
MFGE8-210ENST00000559259 OR10AG1Q8NH19 301 aa13.07□□□□□ -0.32
MFGE8-210ENST00000559259 B9D2Q9BPU9 175 aa13.07□□□□□ -0.32
MFGE8-210ENST00000559259 PLAC8L1A1L4L8 177 aa13.06□□□□□ -0.32
MFGE8-210ENST00000559259 SNURFLB1AK76 121 aa13.06□□□□□ -0.32
MFGE8-210ENST00000559259 MT-ND6P03923 174 aa13.06□□□□□ -0.32
MFGE8-210ENST00000559259 AZU1P20160 251 aa13.06□□□□□ -0.32
MFGE8-210ENST00000559259 NTF3P20783 257 aa13.06□□□□□ -0.32
MFGE8-210ENST00000559259 OR11H2Q8NH07 326 aa13.06□□□□□ -0.32
MFGE8-210ENST00000559259 OVOL2Q9BRP0 275 aa13.06□□□□□ -0.32
MFGE8-210ENST00000559259 GNB1LQ9BYB4 327 aa13.05□□□□□ -0.32
MFGE8-210ENST00000559259 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa13.05□□□□□ -0.32
MFGE8-210ENST00000559259 TRGC1P0CF51 173 aa13.04□□□□□ -0.32
MFGE8-210ENST00000559259 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
MFGE8-210ENST00000559259 RASL10AQ92737 203 aa13.04□□□□□ -0.32
MFGE8-210ENST00000559259 SPATA25Q9BR10 227 aa13.04□□□□□ -0.32
MFGE8-210ENST00000559259 TM2D3Q9BRN9 247 aa13.04□□□□□ -0.32
MFGE8-210ENST00000559259 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
MFGE8-210ENST00000559259 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
MFGE8-210ENST00000559259 SPINK4O60575 86 aa13.03□□□□□ -0.32
MFGE8-210ENST00000559259 HLA-DQA1P01909 254 aa13.03□□□□□ -0.32
MFGE8-210ENST00000559259 RAB5AP20339 215 aa13.03□□□□□ -0.32
MFGE8-210ENST00000559259 TWIST1Q15672 202 aa13.03□□□□□ -0.32
MFGE8-210ENST00000559259 TMEM191AQ9H0A3 160 aa13.03□□□□□ -0.32
MFGE8-210ENST00000559259 PRM2P04554 102 aa13.02□□□□□ -0.33
MFGE8-210ENST00000559259 ZNF876PQ49A33 203 aa13.02□□□□□ -0.33
MFGE8-210ENST00000559259 DMRTA1Q5VZB9 504 aa13.02□□□□□ -0.33
MFGE8-210ENST00000559259 SMIM15Q7Z3B0 74 aa13.02□□□□□ -0.33
MFGE8-210ENST00000559259 SBSPONQ8IVN8 264 aa13.02□□□□□ -0.33
MFGE8-210ENST00000559259 Q8NAQ8 132 aa13.02□□□□□ -0.33
MFGE8-210ENST00000559259 AP1S3Q96PC3 154 aa13.02□□□□□ -0.33
MFGE8-210ENST00000559259 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa13.01□□□□□ -0.33
MFGE8-210ENST00000559259 LYRM9A8MSI8 78 aa13.01□□□□□ -0.33
MFGE8-210ENST00000559259 A8MWV9 139 aa13.01□□□□□ -0.33
MFGE8-210ENST00000559259 M0R381 172 aa13.01□□□□□ -0.33
MFGE8-210ENST00000559259 TMEM136Q6ZRR5 245 aa13.01□□□□□ -0.33
MFGE8-210ENST00000559259 FRZBQ92765 325 aa13.01□□□□□ -0.33
MFGE8-210ENST00000559259 C18orf15Q96N68 181 aa13.01□□□□□ -0.33
MFGE8-210ENST00000559259 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa13□□□□□ -0.33
MFGE8-210ENST00000559259 CIDEAO60543 219 aa13□□□□□ -0.33
MFGE8-210ENST00000559259 CAMPP49913 170 aa13□□□□□ -0.33
MFGE8-210ENST00000559259 LINC00612Q8N6U2 182 aa13□□□□□ -0.33
MFGE8-210ENST00000559259 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
MFGE8-210ENST00000559259 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
MFGE8-210ENST00000559259 MSRB1Q9NZV6 116 aa12.99□□□□□ -0.33
MFGE8-210ENST00000559259 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa12.98□□□□□ -0.33
MFGE8-210ENST00000559259 MUC21A0A140T8X8 626 aa12.98□□□□□ -0.33
MFGE8-210ENST00000559259 DPH3P1Q9H4G8 78 aa12.98□□□□□ -0.33
MFGE8-210ENST00000559259 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
MFGE8-210ENST00000559259 RHODO00212 210 aa12.97□□□□□ -0.33
MFGE8-210ENST00000559259 FAM104BQ5XKR9 115 aa12.97□□□□□ -0.33
MFGE8-210ENST00000559259 POM121L12Q8N7R1 296 aa12.97□□□□□ -0.33
MFGE8-210ENST00000559259 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa12.97□□□□□ -0.33
MFGE8-210ENST00000559259 RS1O15537 224 aa12.96□□□□□ -0.33
MFGE8-210ENST00000559259 SMIM17P0DL12 118 aa12.96□□□□□ -0.33
MFGE8-210ENST00000559259 RPS10P46783 165 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
MFGE8-210ENST00000559259 ZFP2Q6ZN57 461 aa12.96□□□□□ -0.33
MFGE8-210ENST00000559259 ZMAT4Q9H898 229 aa12.96□□□□□ -0.33
MFGE8-210ENST00000559259 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa12.96□□□□□ -0.33
MFGE8-210ENST00000559259 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa12.95□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 EVI2AP22794 236 aa12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms