RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547188.1

PRDM4-202, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 3

Gene PRDM4, Length 640 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-202ENST00000547188 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa14.9□□□□□ -0.02
PRDM4-202ENST00000547188 PYYP10082 97 aa14.89□□□□□ -0.03
PRDM4-202ENST00000547188 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PRDM4-202ENST00000547188 SDIM1Q6ZPB5 146 aa14.89□□□□□ -0.03
PRDM4-202ENST00000547188 OR51M1Q9H341 326 aa14.89□□□□□ -0.03
PRDM4-202ENST00000547188 WFDC1Q9HC57 220 aa14.89□□□□□ -0.03
PRDM4-202ENST00000547188 A0A0U1RQV1 116 aa14.88□□□□□ -0.03
PRDM4-202ENST00000547188 PHOX2AO14813 284 aa14.88□□□□□ -0.03
PRDM4-202ENST00000547188 PRSS1P07477 247 aa14.88□□□□□ -0.03
PRDM4-202ENST00000547188 DPPA3Q6W0C5 159 aa14.88□□□□□ -0.03
PRDM4-202ENST00000547188 AAMDCQ9H7C9 122 aa14.88□□□□□ -0.03
PRDM4-202ENST00000547188 TMEM14CQ9P0S9 112 aa14.88□□□□□ -0.03
PRDM4-202ENST00000547188 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa14.88□□□□□ -0.03
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PRDM4-202ENST00000547188 USP17L23D6RBM5 183 aa14.87□□□□□ -0.03
PRDM4-202ENST00000547188 GAGE1Q13065 139 aa14.87□□□□□ -0.03
PRDM4-202ENST00000547188 GAGE4Q13068 117 aa14.87□□□□□ -0.03
PRDM4-202ENST00000547188 GAGE5Q13069 117 aa14.87□□□□□ -0.03
PRDM4-202ENST00000547188 GAGE13Q4V321 117 aa14.87□□□□□ -0.03
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PRDM4-202ENST00000547188 CFAP126Q5VTH2 177 aa14.87□□□□□ -0.03
PRDM4-202ENST00000547188 WDR73Q6P4I2 378 aa14.87□□□□□ -0.03
PRDM4-202ENST00000547188 NIT1Q86X76 327 aa14.87□□□□□ -0.03
PRDM4-202ENST00000547188 ASB13Q8WXK3 278 aa14.87□□□□□ -0.03
PRDM4-202ENST00000547188 KCNIP2Q9NS61 270 aa14.87□□□□□ -0.03
PRDM4-202ENST00000547188 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa14.87□□□□□ -0.03
PRDM4-202ENST00000547188 GIPP09681 153 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PRDM4-202ENST00000547188 Q6AWC8 147 aa14.86□□□□□ -0.03
PRDM4-202ENST00000547188 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa14.86□□□□□ -0.03
PRDM4-202ENST00000547188 SMIM3Q9BZL3 60 aa14.86□□□□□ -0.03
PRDM4-202ENST00000547188 ATRAIDQ6UW56 229 aa14.85□□□□□ -0.03
PRDM4-202ENST00000547188 DPH3Q96FX2 82 aa14.85□□□□□ -0.03
PRDM4-202ENST00000547188 SLC25A2Q9BXI2 301 aa14.85□□□□□ -0.03
PRDM4-202ENST00000547188 C17orf112F2Z3M2 114 aa14.84□□□□□ -0.03
PRDM4-202ENST00000547188 PDE6HQ13956 83 aa14.84□□□□□ -0.03
PRDM4-202ENST00000547188 MIR17HGQ75NE6 70 aa14.84□□□□□ -0.03
PRDM4-202ENST00000547188 AQP10Q96PS8 301 aa14.84□□□□□ -0.03
PRDM4-202ENST00000547188 SH3BGRL3Q9H299 93 aa14.84□□□□□ -0.03
PRDM4-202ENST00000547188 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa14.83□□□□□ -0.04
PRDM4-202ENST00000547188 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PRDM4-202ENST00000547188 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa14.83□□□□□ -0.04
PRDM4-202ENST00000547188 SCGB1C1Q8TD33 95 aa14.83□□□□□ -0.04
PRDM4-202ENST00000547188 A0A087WYN8 130 aa14.82□□□□□ -0.04
PRDM4-202ENST00000547188 TYMSP04818 313 aa14.82□□□□□ -0.04
PRDM4-202ENST00000547188 SEC11BP0C7V7 166 aa14.82□□□□□ -0.04
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF876PQ49A33 203 aa14.82□□□□□ -0.04
PRDM4-202ENST00000547188 C1orf43Q9BWL3 253 aa14.82□□□□□ -0.04
PRDM4-202ENST00000547188 Q9UF83 564 aa14.82□□□□□ -0.04
PRDM4-202ENST00000547188 CHTF8P0CG12 524 aa14.81□□□□□ -0.04
PRDM4-202ENST00000547188 LINC00694P0DN24 101 aa14.81□□□□□ -0.04
PRDM4-202ENST00000547188 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa14.81□□□□□ -0.04
PRDM4-202ENST00000547188 G3V3Q6 166 aa14.8□□□□□ -0.04
PRDM4-202ENST00000547188 HLA-DQA1P01909 254 aa14.8□□□□□ -0.04
PRDM4-202ENST00000547188 A0A087WWC5 75 aa14.79□□□□□ -0.04
PRDM4-202ENST00000547188 MGST1P10620 155 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
PRDM4-202ENST00000547188 FXYD5Q96DB9 178 aa14.79□□□□□ -0.04
PRDM4-202ENST00000547188 OR2T35Q8NGX2 323 aa14.78□□□□□ -0.04
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PRDM4-202ENST00000547188 Q0VG73 95 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM4-202ENST00000547188 ENHOQ6UWT2 76 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM4-202ENST00000547188 C7orf33Q8WU49 177 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM4-202ENST00000547188 TNFSF18Q9UNG2 199 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM4-202ENST00000547188 PRR3P79522 188 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PRDM4-202ENST00000547188 ELOBQ15370 118 aa14.75□□□□□ -0.05
PRDM4-202ENST00000547188 REG3GQ6UW15 175 aa14.75□□□□□ -0.05
PRDM4-202ENST00000547188 OR10G9Q8NGN4 311 aa14.74□□□□□ -0.05
PRDM4-202ENST00000547188 OR2G3Q8NGZ4 309 aa14.74□□□□□ -0.05
PRDM4-202ENST00000547188 SDF2L1Q9HCN8 221 aa14.74□□□□□ -0.05
PRDM4-202ENST00000547188 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa14.73□□□□□ -0.05
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PRDM4-202ENST00000547188 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PRDM4-202ENST00000547188 PGPEP1LA6NFU8 196 aa14.72□□□□□ -0.05
PRDM4-202ENST00000547188 OR7C2O60412 319 aa14.72□□□□□ -0.05
PRDM4-202ENST00000547188 ATP6V0CP27449 155 aa14.72□□□□□ -0.05
PRDM4-202ENST00000547188 TAS2R45P59539 299 aa14.72□□□□□ -0.05
PRDM4-202ENST00000547188 RAB2AP61019 212 aa14.72□□□□□ -0.05
PRDM4-202ENST00000547188 KHDC3LQ587J8 217 aa14.72□□□□□ -0.05
PRDM4-202ENST00000547188 GTSF1Q8WW33 167 aa14.72□□□□□ -0.05
PRDM4-202ENST00000547188 PHYHIPLQ96FC7 376 aa14.72□□□□□ -0.05
PRDM4-202ENST00000547188 RBAKDNA6NC62 111 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM4-202ENST00000547188 PGPA6NDG6 321 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM4-202ENST00000547188 DIRC3C9JPN6 131 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM4-202ENST00000547188 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF506Q5JVG8 444 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM4-202ENST00000547188 DMRTA1Q5VZB9 504 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM4-202ENST00000547188 SPACA4Q8TDM5 124 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM4-202ENST00000547188 RNF185Q96GF1 192 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM4-202ENST00000547188 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PRDM4-202ENST00000547188 KCNIP4Q6PIL6 250 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM4-202ENST00000547188 F6UZH7 168 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM4-202ENST00000547188 CRPP02741 224 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM4-202ENST00000547188 CSN1S1P47710 185 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM4-202ENST00000547188 SERF2P84101 59 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM4-202ENST00000547188 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PRDM4-202ENST00000547188 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PRDM4-202ENST00000547188 OR10G7Q8NGN6 311 aa14.69□□□□□ -0.06
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