RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545170.5

ATXN3-216, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ATXN3, Length 6,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-216ENST00000545170 USP17L23D6RBM5 183 aa6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-216ENST00000545170 LOXP28300 417 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-216ENST00000545170 CTRLP40313 264 aa6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-216ENST00000545170 TM2D2Q9BX73 214 aa6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-216ENST00000545170 INSL3P51460 131 aa6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-216ENST00000545170 C17orf58Q2M2W7 97 aa6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-216ENST00000545170 UNC13CQ8NB66 2214 aa6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-216ENST00000545170 VPREB1P12018 145 aa6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-216ENST00000545170 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-216ENST00000545170 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-216ENST00000545170 C5orf67F2Z3F1 127 aa6.73□□□□□ -1.33
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ATXN3-216ENST00000545170 DIRC1Q969H9 104 aa6.73□□□□□ -1.33
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ATXN3-216ENST00000545170 IGHV4-59P01825 116 aa6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-216ENST00000545170 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-216ENST00000545170 CRIPAKQ8N1N5 446 aa6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-216ENST00000545170 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-216ENST00000545170 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa6.72□□□□□ -1.33
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ATXN3-216ENST00000545170 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa6.72□□□□□ -1.33
ATXN3-216ENST00000545170 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.72□□□□□ -1.33
ATXN3-216ENST00000545170 NDUFA4O00483 81 aa6.72□□□□□ -1.33
ATXN3-216ENST00000545170 TRIAP1O43715 76 aa6.72□□□□□ -1.33
ATXN3-216ENST00000545170 P0DMU3 169 aa6.72□□□□□ -1.33
ATXN3-216ENST00000545170 FAM231AP0DMU4 169 aa6.72□□□□□ -1.33
ATXN3-216ENST00000545170 FAM231CP0DMU5 169 aa6.72□□□□□ -1.33
ATXN3-216ENST00000545170 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa6.72□□□□□ -1.33
ATXN3-216ENST00000545170 ZNF491Q8N8L2 437 aa6.72□□□□□ -1.33
ATXN3-216ENST00000545170 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
ATXN3-216ENST00000545170 TIMM17AQ99595 171 aa6.72□□□□□ -1.33
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ATXN3-216ENST00000545170 SLPIP03973 132 aa6.72□□□□□ -1.33
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ATXN3-216ENST00000545170 CGB3P0DN86 165 aa6.71□□□□□ -1.33
ATXN3-216ENST00000545170 CD59P13987 128 aa6.71□□□□□ -1.33
ATXN3-216ENST00000545170 PRR4Q16378 134 aa6.71□□□□□ -1.33
ATXN3-216ENST00000545170 KNL1Q8NG31 2342 aa6.71□□□□□ -1.33
ATXN3-216ENST00000545170 COL18A1P39060 1754 aa6.71□□□□□ -1.33
ATXN3-216ENST00000545170 CASC2Q6XLA1 102 aa6.71□□□□□ -1.33
ATXN3-216ENST00000545170 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa6.71□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 A0A0J9YXY3 114 aa6.71□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 IGHV1-69P01742 117 aa6.71□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 LMO1P25800 156 aa6.71□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 SAA4P35542 130 aa6.71□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 SEM1Q6ZVN7 128 aa6.71□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 A0A0J9YWU9 116 aa6.71□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.71□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 GP9P14770 177 aa6.7□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 Q6Q795 121 aa6.7□□□□□ -1.34
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ATXN3-216ENST00000545170 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.7□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.7□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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ATXN3-216ENST00000545170 C15orf65H3BRN8 121 aa6.7□□□□□ -1.34
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ATXN3-216ENST00000545170 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.7□□□□□ -1.34
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ATXN3-216ENST00000545170 LINC01619G3V211 115 aa6.7□□□□□ -1.34
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ATXN3-216ENST00000545170 K7EQD1 137 aa6.69□□□□□ -1.34
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ATXN3-216ENST00000545170 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6.69□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.69□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 NPBQ8NG41 125 aa6.69□□□□□ -1.34
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ATXN3-216ENST00000545170 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.69□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.69□□□□□ -1.34
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ATXN3-216ENST00000545170 DOCK3Q8IZD9 2030 aa6.68□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 TIRAPP58753 221 aa6.68□□□□□ -1.34
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ATXN3-216ENST00000545170 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.68□□□□□ -1.34
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ATXN3-216ENST00000545170 ALPK2Q86TB3 2170 aa6.67□□□□□ -1.34
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ATXN3-216ENST00000545170 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 UBR3Q6ZT12 1888 aa6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 GATA3P23771 443 aa6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 PROK2Q9HC23 129 aa6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 NRXN2Q9P2S2 1712 aa6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 PRO0628Q9UI54 55 aa6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 PSPHP1O15172 72 aa6.66□□□□□ -1.34
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