RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490435.5

ITGA4-211, Transcript of integrin subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene ITGA4, Length 720 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4-211ENST00000490435 PYYP10082 97 aa-0.3□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 PCBD1P61457 104 aa-0.3□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 EMX2Q04743 252 aa-0.3□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 CENPHQ9H3R5 247 aa-0.3□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 FAT1Q14517 4588 aa-0.3□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 CASZ1Q86V15 1759 aa-0.3□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa-0.3□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 CADP27708 2225 aa-0.31□□□□□ -2.46
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ITGA4-211ENST00000490435 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 SAMD13Q5VXD3 122 aa-0.31□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa-0.31□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 SOGA1O94964 1423 aa-0.31□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 UNC13BO14795 1591 aa-0.32□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 KDM5CP41229 1560 aa-0.32□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP-0.32□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 C9JAW5 83 aa-0.32□□□□□ -2.46
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ITGA4-211ENST00000490435 HSD17B12Q53GQ0 312 aa-0.32□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 PRR15LQ9BU68 103 aa-0.32□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 NDUFAF1Q9Y375 327 aa-0.32□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa-0.32□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 WNK2Q9Y3S1 2297 aa-0.33□□□□□ -2.46
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ITGA4-211ENST00000490435 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 PPDPFLQ8WWR9 84 aa-0.33□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 TMEM141Q96I45 108 aa-0.33□□□□□ -2.46
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ITGA4-211ENST00000490435 TENM4Q6N022 2769 aa-0.34□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 UBR4Q5T4S7 5183 aa-0.34□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa-0.34□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa-0.34□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 TFF1P04155 84 aa-0.34□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 PSPHP78330 225 aa-0.34□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 PLGLB1Q02325 96 aa-0.34□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 SLC25A26Q70HW3 274 aa-0.34□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 TMEM35BQ8NCS4 154 aa-0.34□□□□□ -2.46
ITGA4-211ENST00000490435 DDA1Q9BW61 102 aa-0.34□□□□□ -2.46
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ITGA4-211ENST00000490435 V9GYQ6 96 aa-0.34□□□□□ -2.46
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ITGA4-211ENST00000490435 RNF213Q63HN8 5207 aa-0.35□□□□□ -2.46
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ITGA4-211ENST00000490435 AKR1D1P51857 326 aa-0.35□□□□□ -2.47
ITGA4-211ENST00000490435 RPS28P62857 69 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
ITGA4-211ENST00000490435 BET1LQ9NYM9 111 aa-0.35□□□□□ -2.47
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ITGA4-211ENST00000490435 TMEM91Q6ZNR0 172 aa-0.36□□□□□ -2.47
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ITGA4-211ENST00000490435 F2Z2F3 143 aa-0.37□□□□□ -2.47
ITGA4-211ENST00000490435 J3KT08 172 aa-0.37□□□□□ -2.47
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ITGA4-211ENST00000490435 S100GP29377 79 aa-0.37□□□□□ -2.47
ITGA4-211ENST00000490435 S100A5P33763 92 aa-0.37□□□□□ -2.47
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ITGA4-211ENST00000490435 VPS25Q9BRG1 176 aa-0.37□□□□□ -2.47
ITGA4-211ENST00000490435 BPESC1Q9GZL8 116 aa-0.37□□□□□ -2.47
ITGA4-211ENST00000490435 U3KQA8 63 aa-0.37□□□□□ -2.47
ITGA4-211ENST00000490435 LAMA5O15230 3695 aa-0.37□□□□□ -2.47
ITGA4-211ENST00000490435 STAB1Q9NY15 2570 aa-0.37□□□□□ -2.47
ITGA4-211ENST00000490435 PTPRMP28827 1452 aa-0.37□□□□□ -2.47
ITGA4-211ENST00000490435 LRP1BQ9NZR2 4599 aa-0.38□□□□□ -2.47
ITGA4-211ENST00000490435 A0A087WTM6 91 aa-0.38□□□□□ -2.47
ITGA4-211ENST00000490435 A0A1B0GW64 132 aa-0.38□□□□□ -2.47
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ITGA4-211ENST00000490435 COX6A2Q02221 97 aa-0.38□□□□□ -2.47
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ITGA4-211ENST00000490435 SSC5DA1L4H1 1573 aa-0.38□□□□□ -2.47
ITGA4-211ENST00000490435 DOCK11Q5JSL3 2073 aa-0.38□□□□□ -2.47
ITGA4-211ENST00000490435 ABCA2Q9BZC7 2435 aa-0.38□□□□□ -2.47
ITGA4-211ENST00000490435 CCDC171Q6TFL3 1326 aa-0.38□□□□□ -2.47
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ITGA4-211ENST00000490435 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa-0.4□□□□□ -2.47
ITGA4-211ENST00000490435 ARAP1Q96P48 1450 aa-0.4□□□□□ -2.47
ITGA4-211ENST00000490435 KMT2AQ03164 3969 aa-0.4□□□□□ -2.47
ITGA4-211ENST00000490435 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa-0.4□□□□□ -2.47
ITGA4-211ENST00000490435 A0A1B0GX51 115 aa-0.4□□□□□ -2.47
ITGA4-211ENST00000490435 PAEPP09466 180 aa-0.4□□□□□ -2.47
ITGA4-211ENST00000490435 SLC25A6P12236 298 aa-0.4□□□□□ -2.47
ITGA4-211ENST00000490435 FAM213BQ8TBF2 198 aa-0.4□□□□□ -2.47
ITGA4-211ENST00000490435 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP-0.4□□□□□ -2.47
ITGA4-211ENST00000490435 ABCA13Q86UQ4 5058 aa-0.4□□□□□ -2.47
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