RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463372.5

C9orf3-211, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-211ENST00000463372 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf3-211ENST00000463372 LCE2CQ5TA81 110 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf3-211ENST00000463372 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
C9orf3-211ENST00000463372 GPR132Q9UNW8 380 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf3-211ENST00000463372 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
C9orf3-211ENST00000463372 SLC25A6P12236 298 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf3-211ENST00000463372 RBX1P62877 108 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf3-211ENST00000463372 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
C9orf3-211ENST00000463372 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf3-211ENST00000463372 C15orf56Q8N910 161 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf3-211ENST00000463372 MIXL1Q9H2W2 232 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf3-211ENST00000463372 PSENENQ9NZ42 101 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf3-211ENST00000463372 COMMD3Q9UBI1 195 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf3-211ENST00000463372 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
C9orf3-211ENST00000463372 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa7.84□□□□□ -1.15
C9orf3-211ENST00000463372 TAS2R19P59542 299 aa7.84□□□□□ -1.15
C9orf3-211ENST00000463372 S100A10P60903 97 aa7.84□□□□□ -1.15
C9orf3-211ENST00000463372 RAB2AP61019 212 aa7.84□□□□□ -1.15
C9orf3-211ENST00000463372 UBE2D3P61077 147 aa7.84□□□□□ -1.15
C9orf3-211ENST00000463372 UBE2D2P62837 147 aa7.84□□□□□ -1.15
C9orf3-211ENST00000463372 MGST2Q99735 147 aa7.84□□□□□ -1.15
C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.84□□□□□ -1.15
C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.84□□□□□ -1.15
C9orf3-211ENST00000463372 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
C9orf3-211ENST00000463372 RABL2BQ9UNT1 228 aa7.84□□□□□ -1.15
C9orf3-211ENST00000463372 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.83□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 AMTP48728 403 aa7.83□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 UFSP1Q6NVU6 142 aa7.83□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM229BQ8NBD8 167 aa7.83□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa7.83□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 VCXQ9H320 206 aa7.83□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 F6UZH7 168 aa7.82□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 RHODO00212 210 aa7.82□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 METTL15P1P0C7V9 234 aa7.82□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 PRR27Q6MZM9 219 aa7.82□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 FAAP20Q6NZ36 180 aa7.82□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 MTFP1Q9UDX5 166 aa7.82□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 USH2AO75445 5202 aa7.81□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 TRAV6A0A075B6T7 132 aa7.81□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.81□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 DISC1C4P0D8 188 aa7.81□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 APOA1P02647 267 aa7.81□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 CAMLGP49069 296 aa7.81□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.81□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 MIC13Q5XKP0 118 aa7.81□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 TMED6Q8WW62 240 aa7.81□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 JPT2Q9H910 190 aa7.81□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 BLOC1S6Q9UL45 172 aa7.81□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.8□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 NBEAP1P0C6P0 100 aa7.8□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 GAGE6Q13070 117 aa7.8□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.8□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF674Q2M3X9 581 aa7.79□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 TREM1Q9NP99 234 aa7.79□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 A0A1W2PNN7 141 aa7.78□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 PTTG1IPP53801 180 aa7.78□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.78□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 NRARPQ7Z6K4 114 aa7.78□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.78□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 DIRAS2Q96HU8 199 aa7.78□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
C9orf3-211ENST00000463372 A0A087WZ39 114 aa7.77□□□□□ -1.17
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa7.77□□□□□ -1.17
C9orf3-211ENST00000463372 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
C9orf3-211ENST00000463372 SCGB3A2Q96PL1 93 aa7.77□□□□□ -1.17
C9orf3-211ENST00000463372 PRRT1Q99946 306 aa7.77□□□□□ -1.17
C9orf3-211ENST00000463372 GGACTQ9BVM4 153 aa7.77□□□□□ -1.17
C9orf3-211ENST00000463372 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.77□□□□□ -1.17
C9orf3-211ENST00000463372 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.77□□□□□ -1.17
C9orf3-211ENST00000463372 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
C9orf3-211ENST00000463372 SSSCA1O60232 199 aa7.76□□□□□ -1.17
C9orf3-211ENST00000463372 GAGE2BQ13066 116 aa7.76□□□□□ -1.17
C9orf3-211ENST00000463372 PHYHIPLQ96FC7 376 aa7.76□□□□□ -1.17
C9orf3-211ENST00000463372 SMIM8Q96KF7 97 aa7.76□□□□□ -1.17
C9orf3-211ENST00000463372 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
C9orf3-211ENST00000463372 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.75□□□□□ -1.17
C9orf3-211ENST00000463372 M0R2T5 61 aa7.75□□□□□ -1.17
C9orf3-211ENST00000463372 S100A4P26447 101 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
C9orf3-211ENST00000463372 RANP62826 216 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM97Q5BJF2 176 aa7.75□□□□□ -1.17
C9orf3-211ENST00000463372 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.75□□□□□ -1.17
C9orf3-211ENST00000463372 CARD19Q96LW7 228 aa7.75□□□□□ -1.17
C9orf3-211ENST00000463372 SLC25A2Q9BXI2 301 aa7.75□□□□□ -1.17
C9orf3-211ENST00000463372 NMES1Q9C002 83 aa7.75□□□□□ -1.17
C9orf3-211ENST00000463372 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
C9orf3-211ENST00000463372 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.75□□□□□ -1.17
C9orf3-211ENST00000463372 RPS19P39019 145 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
C9orf3-211ENST00000463372 OR10G8Q8NGN5 311 aa7.74□□□□□ -1.17
C9orf3-211ENST00000463372 BCL7BQ9BQE9 202 aa7.74□□□□□ -1.17
C9orf3-211ENST00000463372 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.73□□□□□ -1.17
C9orf3-211ENST00000463372 TSC22D2O75157 780 aa7.73□□□□□ -1.17
C9orf3-211ENST00000463372 SULT1A2P50226 295 aa7.73□□□□□ -1.17
C9orf3-211ENST00000463372 ID3Q02535 119 aa7.73□□□□□ -1.17
C9orf3-211ENST00000463372 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
C9orf3-211ENST00000463372 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.73□□□□□ -1.17
C9orf3-211ENST00000463372 TVP23CQ96ET8 276 aa7.73□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms