RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373190.5

PTPRT-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,559 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-204ENST00000373190 COL8A2P25067 703 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 FXYD2P54710 66 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 WFDC2Q14508 124 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 IGFBPL1Q8WX77 278 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 TAX1BP3O14907 124 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 TMEM105Q8N8V8 129 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 E7EQL1 145 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 NOTCH2Q04721 2471 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 BPESC1Q9GZL8 116 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 XCL2Q9UBD3 114 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 ABCA2Q9BZC7 2435 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 H0YGX0 51 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 G3V318 75 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 CRYGCP07315 174 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 GATA3P23771 443 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 ATP5G1P05496 136 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 CFHR3Q02985 330 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF491Q8N8L2 437 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 LY6HO94772 140 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 FOXE3Q13461 319 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 C5orf47Q569G3 176 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 F5H768 121 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 A4D1N5 150 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 Q6ZR03 302 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 H3BQ85 93 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 GP9P14770 177 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 C8orf31Q8N9H6 132 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 RNF114Q9Y508 228 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 LINC01619G3V211 115 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 GTSF1Q8WW33 167 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 DAD1P61803 113 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 LGALS9O00182 355 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 LINC01620Q4KN68 170 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 Q8NFD4 153 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 C17orf77Q96MU5 243 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 COL4A6Q14031 1691 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 H3BT86 120 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 WISP1O95388 367 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 LOXP28300 417 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 CD59P13987 128 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 PSMB8P28062 276 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 IGHV1-69P01742 117 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 Q6ZUT4 128 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 HIVEP2P31629 2446 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 XCL1P47992 114 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 MSMBP08118 114 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF524Q96C55 264 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRT-204ENST00000373190 GNRH2O43555 120 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 MP68P56378 58 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 TOMM6Q96B49 74 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 H3BUA1 57 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 BAALCQ8WXS3 180 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 IGLV1-44P01699 117 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 NDUFS5O43920 106 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 PRB1P04280 392 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 CRYGBP07316 175 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 Q71RC1 249 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 KAAG1Q9UBP8 84 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 Q6ZS92 163 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 WFDC9Q8NEX5 89 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 PROK2Q9HC23 129 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 E9PLD3 99 aa6.88□□□□□ -1.31
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