RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060634.13

Rpusd3-201, Transcript of Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Rpusd3, Length 1,224 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Ceacam18Q9D871 376 aa14.68□□□□□ -0.06
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 TsnaxQ9QZE7 290 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Fhl2O70433 279 aa14.67□□□□□ -0.06
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 St8sia3Q64689 380 aa14.67□□□□□ -0.06
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Stoml3Q6PE84 287 aa14.67□□□□□ -0.06
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Onecut2Q6XBJ3 505 aa14.67□□□□□ -0.06
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Ifna16Q810G1 189 aa14.67□□□□□ -0.06
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Dppa1Q810Y7 116 aa14.67□□□□□ -0.06
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Olfr1151Q8VFQ8 308 aa14.67□□□□□ -0.06
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Gorasp2Q99JX3 451 aa14.67□□□□□ -0.06
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Klk11Q9QYN3 276 aa14.67□□□□□ -0.06
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Dnah3Q8BW94 4083 aa14.66□□□□□ -0.06
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Ighv7-2A0A0A6YX91 119 aa14.66□□□□□ -0.06
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Akirin2B1AXD8 201 aa14.66□□□□□ -0.06
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Sult6b2B7ZWN4 290 aa14.66□□□□□ -0.06
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 ErhP84089 104 aa14.66□□□□□ -0.06
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Nhlh2Q64221 135 aa14.66□□□□□ -0.06
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Olfr688Q6W049 321 aa14.66□□□□□ -0.06
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 TMEM229BQ8BFQ2 167 aa14.66□□□□□ -0.06
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Ahsa1Q8BK64 338 aa14.66□□□□□ -0.06
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Il19Q8CJ70 176 aa14.66□□□□□ -0.06
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Ubac2Q8R1K1 345 aa14.66□□□□□ -0.06
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Olfr1466Q8VFW4 310 aa14.66□□□□□ -0.06
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Olfr401Q8VFX6 315 aa14.66□□□□□ -0.06
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 MpiQ924M7 423 aa14.66□□□□□ -0.06
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Tmem201A2A8U2 664 aa14.65□□□□□ -0.06
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Zfp961E9Q4R5 444 aa14.65□□□□□ -0.06
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Map2k4P47809 397 aa14.65□□□□□ -0.06
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 SelenohQ3UQA7 116 aa14.65□□□□□ -0.06
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Rasl11aQ6IMB1 242 aa14.65□□□□□ -0.06
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Habp2Q8K0D2 558 aa14.65□□□□□ -0.06
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Etfrf1Q91V16 86 aa14.65□□□□□ -0.06
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Atp6v0bQ91V37 205 aa14.65□□□□□ -0.06
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 2610524H06RikQ9CZU9 139 aa14.65□□□□□ -0.06
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Naa60Q9DBU2 242 aa14.65□□□□□ -0.06
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Vma21-psA0A140T8R2 101 aa14.64□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 ElobP62869 118 aa14.64□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Ear1P97426 155 aa14.64□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Dhrs2Q149L0 282 aa14.64□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 MyocosQ3UWS6 143 aa14.64□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Reep5Q60870 185 aa14.64□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Wfdc15aQ8BH89 80 aa14.64□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Nupl2Q8CIC2 420 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Vmn1r228Q8R2A7 333 aa14.64□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Olfr73Q920P2 313 aa14.64□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Gm17509Q9CZ61 145 aa14.64□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 PpbpQ9EQI5 113 aa14.64□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Rnf212bD3Z423 297 aa14.63□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Ucp2P70406 309 aa14.63□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Znf740Q6NZQ6 180 aa14.63□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 IrgcQ8C262 412 aa14.63□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 SbsnQ8CIT9 700 aa14.63□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Olfr810Q8VFH9 312 aa14.63□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Mgat4cQ9D306 478 aa14.63□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Cd164l2Q9D6W7 172 aa14.63□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 HpgdsQ9JHF7 199 aa14.63□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Insl6Q9QY05 191 aa14.63□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Hsf4Q9R0L1 492 aa14.63□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Ighv1-77A0A0G2JGS9 117 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 ApcsP12246 224 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Cdx1P18111 268 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Rag2P21784 527 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Loxl2P58022 776 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Txn2P97493 166 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Coq2Q66JT7 374 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 ApoolQ78IK4 265 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Olfr923Q7TRB9 317 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Tmem230Q8CIB6 120 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 GcaQ8VC88 220 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 EpcamQ99JW5 315 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Ms4a6cQ99N08 217 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Rnase4Q9JJH1 148 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Psma1Q9R1P4 263 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 TroQ6DIC6 2087 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Ighv9-4A0A0A6YWH6 117 aa14.61□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Olfr746E9Q840 314 aa14.61□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Socs3O35718 225 aa14.61□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Nkx2-1P50220 372 aa14.61□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Rps10P63325 165 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Fam3dP97805 223 aa14.61□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Gipc3Q8R5M0 297 aa14.61□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Pdcd10Q8VE70 212 aa14.61□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Gatad1Q920S3 266 aa14.61□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Ms4a6bQ99N09 244 aa14.61□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Trem3Q9JKE1 183 aa14.61□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Smim10l1A0A087WNQ7 89 aa14.6□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 A0A286YDM5 308 aa14.6□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Esp23A8R0V5 104 aa14.6□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 P01741 114 aa14.6□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Lcn3Q62471 182 aa14.6□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 SepsecsQ6P6M7 504 aa14.6□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Olfr275Q7TS18 319 aa14.6□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Gm4894Q8CA09 118 aa14.6□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Olfr1099Q8VG37 312 aa14.6□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Olfr1238Q8VG59 315 aa14.6□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Q9DAL9 119 aa14.6□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 RbpmsQ9WVB0 197 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Trav15-2-dv6-2A0A075B650 123 aa14.59□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Trbv15A0A0A6YYE3 115 aa14.59□□□□□ -0.07
Rpusd3-201ENSMUST00000060634 Olfr748E9Q9Z0 307 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 86.8 ms