Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GcaQ8VC88 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GcaQ8VC88 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GcaQ8VC88 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GcaQ8VC88 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GcaQ8VC88 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GcaQ8VC88 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GcaQ8VC88 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GcaQ8VC88 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GcaQ8VC88 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GcaQ8VC88 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GcaQ8VC88 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GcaQ8VC88 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GcaQ8VC88 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GcaQ8VC88 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GcaQ8VC88 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
GcaQ8VC88 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GcaQ8VC88 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GcaQ8VC88 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GcaQ8VC88 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GcaQ8VC88 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GcaQ8VC88 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GcaQ8VC88 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GcaQ8VC88 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GcaQ8VC88 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GcaQ8VC88 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GcaQ8VC88 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GcaQ8VC88 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GcaQ8VC88 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GcaQ8VC88 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GcaQ8VC88 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GcaQ8VC88 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GcaQ8VC88 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GcaQ8VC88 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GcaQ8VC88 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GcaQ8VC88 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GcaQ8VC88 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GcaQ8VC88 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GcaQ8VC88 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GcaQ8VC88 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GcaQ8VC88 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GcaQ8VC88 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GcaQ8VC88 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GcaQ8VC88 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GcaQ8VC88 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GcaQ8VC88 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GcaQ8VC88 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GcaQ8VC88 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GcaQ8VC88 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GcaQ8VC88 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GcaQ8VC88 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GcaQ8VC88 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GcaQ8VC88 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GcaQ8VC88 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GcaQ8VC88 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GcaQ8VC88 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GcaQ8VC88 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GcaQ8VC88 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GcaQ8VC88 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GcaQ8VC88 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GcaQ8VC88 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GcaQ8VC88 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GcaQ8VC88 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GcaQ8VC88 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GcaQ8VC88 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GcaQ8VC88 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GcaQ8VC88 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GcaQ8VC88 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GcaQ8VC88 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GcaQ8VC88 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GcaQ8VC88 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GcaQ8VC88 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GcaQ8VC88 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GcaQ8VC88 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GcaQ8VC88 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GcaQ8VC88 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GcaQ8VC88 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GcaQ8VC88 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GcaQ8VC88 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GcaQ8VC88 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GcaQ8VC88 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GcaQ8VC88 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GcaQ8VC88 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GcaQ8VC88 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GcaQ8VC88 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GcaQ8VC88 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GcaQ8VC88 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GcaQ8VC88 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GcaQ8VC88 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GcaQ8VC88 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GcaQ8VC88 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GcaQ8VC88 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GcaQ8VC88 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GcaQ8VC88 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GcaQ8VC88 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GcaQ8VC88 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GcaQ8VC88 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GcaQ8VC88 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GcaQ8VC88 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GcaQ8VC88 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
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