RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1W2PRS3	328 aa		1.47	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		1.47	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	OOSP1	A8MZH6	123 aa		1.47	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	SSSCA1	O60232	199 aa		1.47	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	PIRT	P0C851	137 aa		1.47	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	S100A10	P60903	97 aa		1.47	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	TPRXL	Q17RH7	258 aa		1.47	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		1.47	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		1.47	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		1.47	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		1.47	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		1.47	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957		Q8TAT8	98 aa		1.47	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	TVP23C	Q96ET8	276 aa		1.47	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		1.47	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	DPY30	Q9C005	99 aa		1.47	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		1.47	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		1.47	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		1.47	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	COL4A5	P29400	1685 aa		1.47	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	1.47	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	THADA	Q6YHU6	1953 aa		1.47	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		1.47	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	ARID1A	O14497	2285 aa		1.46	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	NACA	E9PAV3	2078 aa		1.46	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		1.46	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		1.46	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	1.46	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	IFT140	Q96RY7	1462 aa		1.46	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		1.46	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		1.46	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A0G2JQZ4	141 aa		1.46	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC00032	P0C843	101 aa		1.46	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	COX7C	P15954	63 aa		1.46	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	1.46	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		1.46	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957		Q8N8P6	123 aa		1.46	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM141	Q96I45	108 aa		1.46	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		1.46	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	AP4S1	Q9Y587	144 aa		1.46	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	PTPRB	P23467	1997 aa		1.46	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		1.46	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	COL4A2	P08572	1712 aa		1.46	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		1.46	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	PLXNA3	P51805	1871 aa		1.46	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		1.46	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		1.45	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	PCM1	Q15154	2024 aa		1.45	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		1.45	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	MYLK	Q15746	1914 aa		1.45	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		1.45	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1W2PNN7	141 aa		1.45	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	SNCG	O76070	127 aa		1.45	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	1.45	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	RHOH	Q15669	191 aa		1.45	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		1.45	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	C5orf38	Q86SI9	138 aa		1.45	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		1.45	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	PATE1	Q8WXA2	126 aa		1.45	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		1.45	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		1.45	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		1.45	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	COL1A2	P08123	1366 aa		1.45	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		1.45	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	1.44	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	KDM6B	O15054	1643 aa		1.44	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	PTPRM	P28827	1452 aa		1.44	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		1.44	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		1.44	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	1.44	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		1.44	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A0J9YY99	117 aa		1.44	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	PLXNB1	O43157	2135 aa		1.44	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	CBLN1	P23435	193 aa		1.44	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	1.44	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC00052	Q96N35	136 aa		1.44	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	DSCR8	Q96T75	97 aa		1.44	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		1.44	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957		Q9H521	79 aa		1.44	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		1.44	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		1.44	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	C22orf24	Q9Y442	160 aa		1.44	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		1.44	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	SCN9A	Q15858	1988 aa		1.44	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	MYH7	P12883	1935 aa		1.44	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	AKAP12	Q02952	1782 aa		1.44	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		1.44	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	HIVEP2	P31629	2446 aa		1.44	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	POLE	Q07864	2286 aa		1.43	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		1.43	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		1.43	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	CCL16	O15467	120 aa		1.43	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	1.43	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957		Q0VG73	95 aa		1.43	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	SPRN	Q5BIV9	151 aa		1.43	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	1.43	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		1.43	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		1.43	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		1.43	□□□□□ -2.18
AKAP13-223	ENST00000560957	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		1.43	□□□□□ -2.18

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