RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 G3V2T6 193 aa-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 H3BQV1 296 aa-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 H7C1C5 153 aa-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 EDF1O60869 148 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 IFNA6P05013 189 aa-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 COX4I1P13073 169 aa-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 GCHFRP30047 84 aa-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 SPRR2BP35325 72 aa-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 LCN6P62502 163 aa-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 EMX2Q04743 252 aa-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 COTL1Q14019 142 aa-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 POU6F1Q14863 301 aa-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 RTL8BQ17RB0 113 aa-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 AKIRIN2Q53H80 203 aa-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 Q5VSD8 79 aa-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 OR8J2Q8NGG1 315 aa-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 OR5H6Q8NGV6 325 aa-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 CLEC2BQ92478 149 aa-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 AP3S1Q92572 193 aa-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 SMIM7Q9BQ49 75 aa-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 VPS25Q9BRG1 176 aa-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 C9orf16Q9BUW7 83 aa-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 PBDC1Q9BVG4 233 aa-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 RTL8AQ9BWD3 113 aa-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 SSR3Q9UNL2 185 aa-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 MPC1Q9Y5U8 109 aa-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 CPDO75976 1380 aa-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 FAT1Q14517 4588 aa-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 LRP1BQ9NZR2 4599 aa-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 CCDC144AA2RUR9 1427 aa-0.38□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa-0.39□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP-0.39□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 TRAV22A0A0B4J277 110 aa-0.39□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa-0.39□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 LOC730098B7Z3J9 87 aa-0.39□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 CDC42EP2O14613 210 aa-0.39□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 IFNA21P01568 189 aa-0.39□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 C1QBP02746 253 aa-0.39□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 S100A6P06703 90 aa-0.39□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 SPINK8P0C7L1 97 aa-0.39□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 FABP2P12104 132 aa-0.39□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 SPRR1AP35321 89 aa-0.39□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 TAS2R41P59536 307 aa-0.39□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 MAXP61244 160 aa-0.39□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 LSM3P62310 102 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 GNG5P63218 68 aa-0.39□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 FADDQ13158 208 aa-0.39□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP-0.39□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa-0.39□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 OR5A2Q8NGI9 324 aa-0.39□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 PPP1R14BQ96C90 147 aa-0.39□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 PRELID3AQ96N28 172 aa-0.39□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 Q96NJ1 140 aa-0.39□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 PHB2Q99623 299 aa-0.39□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 CNFNQ9BYD5 112 aa-0.39□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa-0.39□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 PYCARDQ9ULZ3 195 aa-0.39□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa-0.39□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 ITPR3Q14573 2671 aa-0.39□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP-0.39□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa-0.39□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 USP54Q70EL1 1684 aa-0.4□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 SVEP1Q4LDE5 3571 aa-0.4□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa-0.4□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 AKAP11Q9UKA4 1901 aa-0.4□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 A0A087WTM6 91 aa-0.4□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa-0.4□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa-0.4□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa-0.4□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 OR2H2O95918 312 aa-0.4□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 ACYP2P14621 99 aa-0.4□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 LSM6P62312 80 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-0.4□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 Q6ZRX8 168 aa-0.4□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 NUP35Q8NFH5 326 aa-0.4□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 DIRC1Q969H9 104 aa-0.4□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 BORCS8Q96FH0 119 aa-0.4□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 CFAP53Q96M91 514 aa-0.4□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP-0.4□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 FKBP11Q9NYL4 201 aa-0.4□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 IL20Q9NYY1 176 aa-0.4□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa-0.4□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 PRNDQ9UKY0 176 aa-0.4□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 SLC22A13Q9Y226 551 aa-0.4□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms