RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551984.5

FGD4-215, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, human

TSL 5

Gene FGD4, Length 2,435 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGD4-215	ENST00000551984	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	RAB9B	Q9NP90	201 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	PRO0461	Q9UI25	63 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984		B5MCH6	92 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984		E9PLD3	99 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	GCSH	P23434	173 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	GPR12	P47775	334 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	FHL3	Q13643	280 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	MOB3B	Q86TA1	216 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF329	Q86UD4	541 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	SYT8	Q8NBV8	401 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	NABP2	Q9BQ15	211 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	AGRN	O00468	2067 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984		K7EIL1	84 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	SPINT2	O43291	252 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF134	P52741	427 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	XG	P55808	180 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984		Q6ZUT4	128 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	RNF152	Q8N8N0	203 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984		A0A096LNJ9	63 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	CNIH1	O95406	144 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	MOS	P00540	346 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	CT45A6	P0DMU7	189 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	CT45A5	P0DMU8	189 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	CT45A7	P0DMV0	189 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	MYCNOS	P40205	109 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	CSN1S1	P47710	185 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	NMU	P48645	174 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	AMTN	Q6UX39	209 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	S1PR3	Q99500	378 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	COL7A1	Q02388	2944 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	IGLL5	B9A064	214 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	CFHR3	Q02985	330 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	FOXI1	Q12951	378 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	GNG12	Q9UBI6	72 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984		K7EMI3	77 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	PEX7	O00628	323 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	CHEK1	O14757	476 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	APOM	O95445	188 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	CACNG7	P62955	275 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	ODF1	Q14990	250 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	TNC	P24821	2201 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984		A0A1B0GW15	77 aa		4.96	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984		A0A1B0GWB2	263 aa		4.96	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		4.96	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	LTA	P01374	205 aa		4.96	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	IGF1	P05019	195 aa		4.96	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	CLEC3B	P05452	202 aa		4.96	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	ELANE	P08246	267 aa		4.96	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	C8orf88	P0DMB2	117 aa		4.96	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		4.96	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.96	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		4.96	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		4.96	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		4.96	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		4.96	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	HINT2	Q9BX68	163 aa		4.96	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.96	□□□□□ -1.61

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