RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538020.1

LMO3-218, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 622 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-218ENST00000538020 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
LMO3-218ENST00000538020 RBMY1CP0DJD4 496 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-218ENST00000538020 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
LMO3-218ENST00000538020 TDRG1Q3Y452 100 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-218ENST00000538020 MUC21Q5SSG8 566 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-218ENST00000538020 Q6ZWC4 215 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-218ENST00000538020 C1orf158Q8N1D5 194 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-218ENST00000538020 LINC01587Q99440 93 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-218ENST00000538020 LINC00467Q9BRT7 94 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-218ENST00000538020 RPS10P5Q9NQ39 176 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-218ENST00000538020 V9GYV3 84 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-218ENST00000538020 TRGV11A0A075B6L2 103 aa8.72□□□□□ -1.01
LMO3-218ENST00000538020 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa8.72□□□□□ -1.01
LMO3-218ENST00000538020 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa8.72□□□□□ -1.01
LMO3-218ENST00000538020 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.72□□□□□ -1.01
LMO3-218ENST00000538020 RCHY1Q96PM5 261 aa8.72□□□□□ -1.01
LMO3-218ENST00000538020 TMEM242Q9NWH2 141 aa8.72□□□□□ -1.01
LMO3-218ENST00000538020 C11orf21Q9P2W6 132 aa8.72□□□□□ -1.01
LMO3-218ENST00000538020 MGAM2Q2M2H8 2515 aa8.72□□□□□ -1.01
LMO3-218ENST00000538020 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa8.71□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 RPL19P84098 196 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 DEFB135Q30KP9 77 aa8.71□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 DEFB121Q5J5C9 76 aa8.71□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 Q6ZQT7 251 aa8.71□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 TSKUQ8WUA8 353 aa8.71□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 FAM231BA6NCW3 169 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 CBY3A6NI87 242 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 TYMSP04818 313 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 HTN1P15515 57 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 S100A4P26447 101 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 ASIPP42127 132 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 MRAPQ8TCY5 172 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 GFRA4Q9GZZ7 299 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 IL36BQ9NZH7 164 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 A0A1W2PPQ1 181 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 SMIM9A6NGZ8 99 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 ZNF415Q09FC8 603 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 RRN3P1Q2M238 152 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 DNLZQ5SXM8 178 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 KCNIP4Q6PIL6 250 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 RNF183Q96D59 192 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 IMMP2LQ96T52 175 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 NEU1Q99519 415 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 DNHD1Q96M86 4753 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 GRIFINA4D1Z8 144 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 CXorf65A6NEN9 183 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 SPRY2O43597 315 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 MED14OSP0DP75 135 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 S100PP25815 95 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 ATRAIDQ6UW56 229 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 ZNF493Q6ZR52 646 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 C16orf74Q96GX8 76 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 NAT8BQ9UHF3 227 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 HIGD1CA8MV81 97 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 F2Z2F3 143 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 H3BVH4 76 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 GNRH2O43555 120 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 IGLC6P0CF74 106 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 GZMBP10144 247 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 NOTCH1P46531 2555 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 OR11H2Q8NH07 326 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 BORCS7Q96B45 105 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 SMCO4Q9NRQ5 59 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 SNAI2O43623 268 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 OR5AL1P0C617 328 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 MIFP14174 115 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 TCL1AP56279 114 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 SPATA25Q9BR10 227 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 TPPP3Q9BW30 176 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 SNURFLB1AK76 121 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 ARMS2P0C7Q2 107 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 AZU1P20160 251 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 CTRLP40313 264 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 DEFA6Q01524 100 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 ZNF575Q86XF7 245 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 SBSPONQ8IVN8 264 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 GTSF1Q8WW33 167 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 BTF3L4Q96K17 158 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 C9orf85Q96MD7 179 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 OVOL2Q9BRP0 275 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 SPXQ9BT56 116 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 MDFICQ9P1T7 246 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
LMO3-218ENST00000538020 X6R8D5 127 aa8.65□□□□□ -1.02
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