RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516411.1

RNU6-977P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 977, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-977P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-977P-201ENST00000516411 TPST1O60507 370 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 CAPZBP47756 277 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 MAXP61244 160 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 RPL19P84098 196 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 EMX2Q04743 252 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 FADDQ13158 208 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 POU6F1Q14863 301 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 RHOHQ15669 191 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 LYPD5Q6UWN5 251 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 OR8J3Q8NGG0 315 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 CLEC2BQ92478 149 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 PPP1R14BQ96C90 147 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 GINS3Q9BRX5 216 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 OTORQ9NRC9 128 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 TECPR2O15040 1411 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 FAM135BQ49AJ0 1406 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 PLXNB2O15031 1838 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 CHD8Q9HCK8 2581 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 ARAP1Q96P48 1450 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 COL6A3P12111 3177 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 CASZ1Q86V15 1759 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 USF3Q68DE3 2245 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 TMEM189A5PLL7 270 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 IFNA1P01562 189 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 MT-ND6P03923 174 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 PYYP10082 97 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 BCL2P10415 239 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 TPT1P13693 172 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 HSD11B1P28845 292 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 SDC4P31431 198 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 SRP9P49458 86 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 ARF6P62330 175 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 MUC2Q02817 5179 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 MORN4Q8NDC4 146 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 AP3S1Q92572 193 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 BORCS8Q96FH0 119 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 CARD19Q96LW7 228 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 PRELID3AQ96N28 172 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 PBDC1Q9BVG4 233 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 ATG5Q9H1Y0 275 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 BIN3Q9NQY0 253 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 COMMD3Q9UBI1 195 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 MYO7BQ6PIF6 2116 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 WNK3Q9BYP7 1800 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-977P-201ENST00000516411 NRXN2Q9P2S2 1712 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 SYNMO15061 1565 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 TMEM210A6NLX4 147 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 C5orf58C9J3I9 102 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 F2Z2F3 143 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 H7BYZ3 331 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 MFSD11O43934 449 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 OR2H2O95918 312 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 CCKP06307 115 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 S100A6P06703 90 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 NMBP08949 121 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 IFITM1P13164 125 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 PPP1R2P41236 205 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 REEP5Q00765 189 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 TMED2Q15363 201 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 SNCBQ16143 134 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 LTC4SQ16873 150 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 OR4S1Q8NGB4 309 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 OR5A2Q8NGI9 324 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 OR5H6Q8NGV6 325 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 OR13C6PQ8NH95 151 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 SMIM11BQ8TCY0 68 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 PHB2Q99623 299 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 COA4Q9NYJ1 87 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 BET1LQ9NYM9 111 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 FAT2Q9NYQ8 4349 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 BSNQ9UPA5 3926 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 MYH13Q9UKX3 1938 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 ATRQ13535 2644 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 PDZD2O15018 2839 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 URB1O60287 2271 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 TRAV2A0A0B4J234 112 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 TRAV17A0A0B4J275 112 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 C9JAW5 83 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 EDF1O60869 148 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-977P-201ENST00000516411 IFNA21P01568 189 aa-0.36□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms