RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504440.1

NPHP3-AS1-202, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,507 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TRGV3P03979 118 aa5.04□□□□□ -1.6
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OCIAD2Q56VL3 154 aa5.04□□□□□ -1.6
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LGALS9CQ6DKI2 356 aa5.04□□□□□ -1.6
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa5.03□□□□□ -1.6
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TIMD4Q96H15 378 aa5.02□□□□□ -1.61
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa5.02□□□□□ -1.61
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BMI1P35226 326 aa5.02□□□□□ -1.61
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP5.02□□□□□ -1.61
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PTPN13Q12923 2485 aa5.02□□□□□ -1.61
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FCER1GP30273 86 aa5□□□□□ -1.61
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C20orf173Q96LM9 149 aa5□□□□□ -1.61
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa4.99□□□□□ -1.61
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SAA4P35542 130 aa4.99□□□□□ -1.61
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FOXI1Q12951 378 aa4.99□□□□□ -1.61
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR2K2Q8NGT1 345 aa4.99□□□□□ -1.61
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 AP1S3Q96PC3 154 aa4.99□□□□□ -1.61
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CNFNQ9BYD5 112 aa4.99□□□□□ -1.61
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.99□□□□□ -1.61
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PPBPP02775 128 aa4.99□□□□□ -1.61
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SMIM17P0DL12 118 aa4.99□□□□□ -1.61
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