RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493536.5

SNHG16-202, Transcript of small nucleolar RNA host gene 16, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG16, Length 2,424 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG16-202ENST00000493536 Q6ZQT7 251 aa6.57□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.57□□□□□ -1.36
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SNHG16-202ENST00000493536 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.56□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 A0A1B0GW15 77 aa6.56□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 TSPOP30536 169 aa6.56□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 SLAQ13239 276 aa6.56□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 MUC21Q5SSG8 566 aa6.56□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.56□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.56□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 KNCNA6PVL3 124 aa6.56□□□□□ -1.36
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SNHG16-202ENST00000493536 CDKN1BP46527 198 aa6.56□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 KIR3DS1Q14943 382 aa6.56□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 TWIST1Q15672 202 aa6.56□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.56□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 MAP6D1Q9H9H5 199 aa6.56□□□□□ -1.36
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SNHG16-202ENST00000493536 PRR31Q5SQ13 230 aa6.55□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 ODF3Q96PU9 254 aa6.55□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.55□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 IGLC6P0CF74 106 aa6.55□□□□□ -1.36
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SNHG16-202ENST00000493536 CTRLP40313 264 aa6.55□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 ZNF124Q15973 351 aa6.55□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.55□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 APRG1Q8IVJ8 170 aa6.55□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 C7orf71A4D174 169 aa6.54□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.54□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 HLA-DRB4P13762 266 aa6.54□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.54□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.54□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 BAGE3Q86Y29 109 aa6.54□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.54□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 OR11H12B2RN74 326 aa6.54□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 H3BMM0 161 aa6.54□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.54□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 ZNF575Q86XF7 245 aa6.54□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 H3BVH4 76 aa6.53□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 IGLV1-51P01701 117 aa6.53□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 ASIPP42127 132 aa6.53□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 FXYD7P58549 80 aa6.53□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 KCNS1Q96KK3 526 aa6.53□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 STHQ8IWL8 128 aa6.52□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.52□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 CITED1Q99966 193 aa6.52□□□□□ -1.36
SNHG16-202ENST00000493536 VWFP04275 2813 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 GNRH2O43555 120 aa6.52□□□□□ -1.37
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SNHG16-202ENST00000493536 OR5AL1P0C617 328 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 OR2K2Q8NGT1 345 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 Q0VG73 95 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 AMTNQ6UX39 209 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 CNFNQ9BYD5 112 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 M0R381 172 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 FABP4P15090 132 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 CACNG7P62955 275 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 AMN1Q8IY45 258 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 SNAI2O43623 268 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 HTN1P15515 57 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 GATD1Q8NB37 220 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 MAST4O15021 2626 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 SERF1AO75920 110 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 TMEM18Q96B42 140 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 A8MTW9 85 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 INSL3P51460 131 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG16-202ENST00000493536 IQCJQ1A5X6 159 aa6.49□□□□□ -1.37
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